• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2003.04a
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• pp.893-895
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• 2003

단백질간 구조 비교는 기능적 또는 구조적으로 연관된 단백질을 분류하거나 모티프(motif)를 찾는데 유용하게 사용되고 있다. 여러 가지 단백질간 구조 비교 방법 중에서 단백질 2차구조를 이용하는 방법은 실행속도의 측면에서 장점이 있다. 본 논문에서는 단백질 2차 구조와 그들 사이의 관계를 기반으로 한 단백질 구조 비교에서 사용될 유사성 그래프를 생성하는 방법을 기술하였다. 유사성 그래프는 단백질의 2차구조 사이의 관계를 노드로 하여 생성되는데, 그 시간복잡도가 O(n$^4$)이다. 이에 본 논문에서는 유사성 그래프의 생성을 효율적으로 할 수 있는 알고리즘을 개발하였다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2005.05a
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• pp.1749-1752
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• 2005

하드웨어/소프트웨어 통합설계에서 기존의 FDS(Force-Directed Scheduling)를 응용하는 모든 방법들은 분포 그래프를 기반으로 분할을 수행하는데, 이들의 문제점은 입력테이블의 특정한 설계방법에서 구현이 불가능한 노드가 존재할 때에는 분할의 해가 존재함에도 불구하고 분할의 해를 찾지 못하는 경우나 다양한 해가 존재함에도 불구하고 탐색공간을 충분히 고려하지 못하는 경우가 발생한다. 본 연구에서는 입력테이블의 여러 가지 설계방법에서 구현이 불가능한 노드가 복합적으로 존재하는 경우에도 분포그래프를 생성하고 생성된 분포 그래프의 노드별 힘을 계산하여 분할이 가능하게 하였다. 제안 방법은 비용테이블에서 특정한 구현방법으로의 매핑이 불가능한 경우에는 최소 실행시간을 갖는 구현방법을 임의로 선택해서 분포그래프를 생성하여 분할할 수 있도록 하였다. 제안방법의 실험 결과는 기존의 FDS 응용 방법들보다 개선된 알고리즘 실행시간과 더불어 여러개의 노드에 대해 불가능한 구현 방법이 복합적으로 존재할 때에도 분할이 가능함을 보인다.

• Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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• v.21 no.11
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• pp.2103-2108
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• 2017

For n points $p_i$ on the m-dimensional plane $R^m$ and a fixed range r, consider a set $T_i$ containing points the distances from $p_i$ of which are less than or equal to r. In case m=1, $T_i$ is an interval on a line, it is a circle on a plane when m=2. For the vertices corresponding to the sets $T_i$, there is an edge between the vertices if the two sets intersect. Then this graph is called an intersection graph G. For m=1 G is called a proper interval graph and for m=2, it is called an unit disk graph. In this paper, we are concerned in the intersection graph G(r) when r changes. In particular, we consider the problem to find the minimum r such that G(r)is connected. For this problem, we propose an O(n) algorithm for the proper interval graph and an $O(n^2{\log}\;n)$ algorithm for the unit disk graph. For the dynamic environment in which the points on a line are added or deleted, we give an O(log n) algorithm for the problem.

• Proceedings of the Korea Database Society Conference
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• 1999.06a
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• pp.325-333
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• 1999

본 논문에서는 응용범위가 넓고 비교적 복잡도가 높은 화물운송 계획문제들을 대상으로 몇 가지 실험을 통해 대표적인 인공지능 계획방식인 부분순서 계획법과 그래프 계획법의 성능을 비교 분석하였다. 또 동시에 이러한 실험을 통해 DVO 및 LPVO와 같은 대표적인 제어전략들을 중심으로 이들이 그래프 계획법의 성능에 미치는 효과를 비교 분석하여 보았다. 본 연구의 실험을 통해서는 부분순서 계획법에 비해 그래프 계획법이 메모리 사용량이나 CPU 계산시간 면에서 월등히 우수한 성능을 보여주었으며 비교적 복잡도가 큰 계획문제에서도 좋은 결과를 보여주었다. 하지만 도출된 해 계획의 질적인 면에서는 부분순서 계획법이 대부분 최적의 해를 찾아낸 것에 반해 그래프 계획법은 사용된 제어전략과 최적화 방법에 따라 해 계획의 질이 크게 달라질 수 있음을 보였다. 한편 그래프 계획법에서는 부속목표 선택 전략인 DVO는 그 효과를 뚜렷이 보이지 못한 반면 동작 선택 전략인 LPVO는 도출된 해 계획의 질적인 면이나 계산속도 면에서 모두 뛰어난 효과를 보여주었다.

• Proceedings of the Korea Inteligent Information System Society Conference
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• 1999.03a
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• pp.325-333
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• 1999

본 논문에서는 응용범위가 넓고 비교적 복잡도가 높은 화물운성 계획문제들을 대상으로 몇 가지 실험을 통해 대표적인 인공지능 계획방식인 부분순서 계획법과 그래프 계획법의 성능을 비교 분석하였다. 또 동시에 이러한 실험을 통해 DVO 및 LPVO와 같은 대표적인 제어전략들을 중심으로 이들이 그래프 계획법의 성능에 미치는 효과를 비교 분석하여 보았다. 본 연구의 실험을 통해서는 부분순서 계획법에 비해 그래프 계획법이 메모리 사용량이나 CPU 계산시간 면에서 월등히 우수한 성능을 보여주었으며 비교적 복잡도가 큰 계획문제에서도 좋은 결과를 보여주었다. 하지만 도출된 해 계획의 질적인 면에서는 부분순서 계획법이 대부분 최적의 해를 찾아낸 것에 반해 그래프 계획법은 사용된 제어전략과 최적화 방법에 따라 해 계획의 질이 크게 달라질 수 있음을 보였다. 한편 그래프 계획법에서는 부속목표 선택 전략인 DVO는 그 효과를 뚜렷이 보이지 못한 반면 동작 선택 전략인 LPVO는 도출된 해 계획의 질적인 면이나 계산속도 면에서 모두 뛰어난 효과를 보여주었다.

• Journal of KIISE:Software and Applications
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• v.28 no.8
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• pp.593-602
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• 2001

G-Machine은 주어진 표현식을 그래프 축약을 통해석 계산한다. 이러한 축약 과정은 표현식을 그래프로 표현하기 위해 많은 그래프 공간을 필요로 한다. 본 논문에서는 그래프 공간을 효율적으로 사용할 수 있는 방법을 제안한다. 본 논문에서는 우회 노드 장소에 자료를 중복 사용하는 방법을 제안하여 G-Machine에서 필요로 하는 그래프 공간을 절약하며, 이를 위한 새로운 추상기계인 poGM(Pointer Overlapped GM)을 제안한다. poGM에서는 필요한 곳에만 상대 주소를 사용하여, 그래프 내부 노드와 단말 노드 모두에서 그래프 공간을 절약할 수 있다. 기억 장소 재활용 체계를 포함하는 시뮬레이션의 결과벤치마크 프로그램에서 GM보다 총합 사용량은 평균32%, 최소합은 평균 47.6% 적게 사용하였으며, 수행 시간은 평균 30% 빠르게 수행되었다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2013.11a
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• pp.152-154
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• 2013

페타 바이트 이상의 규모의 빅 데이터 분석은 다양한 분야에서 연구되고 있다. 최근 소셜 네트워크, XML 등과 같은 구조적인 정보를 갖는 대용량의 그래프들을 분석하는 기술이 활발히 연구되고 있다. 이러한 대용량의 그래프를 분석하기 위한 연산중의 하나로 순환 그래프가 사용되고 있다. 대용량의 그래프 환경에서 순환을 검출하는 연산은 단일 컴퓨팅 시스템에서 처리가 불가능하거나 많은 시간 비용이 발생하여 분산처리가 필요하다. 본 논문에서는 그래프 처리에 효율적인 프리겔 프레임워크를 이용하여 효율적으로 순환을 검출하고, 중복 순환을 제거하기 위해 정규 순환 코드를 제안한다. 실험을 통하여 제안하는 기법이 대용량 그래프에서 효율적으로 순환을 찾을 수 있음을 보인다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2000.04a
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• pp.489-491
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• 2000

본 논문은 ATM(Abstract Timed Machine)으로 명세된 실시간 시스템을 검증하기 위한 방법을 기술한다. ATM은 임무 위급 시스템인 실시간 시스템을 명세, 분석, 검증하기 위한 정형기법이다. ATM은 모드와 전이, 포트로 구성된다. 다른 정형기법과 비교하여 ATM은 소프트웨어의 순환공학 과정에서 사용하기 위해 설계되었다. 역공학 과정에서 ATM은 계산 논리 뿐만 아니라 실시간 시스템의 실제 소스코드에 있는 설계나 환경정보를 표현할 수 있다. 이러한 목적을 위해 ATM은 다양한 모드를 사용한다. ATM을 사용한 실시간 시스템의 검증은 도달성 그래프를 생성함으로써 수행한다. 도달성 그래프는 상태와 시간을 추상화되고 압축된 형태로 표현할 수 있으며 그 결과 시간 속성을 지닌 상태 공간을 감소시킬 수 있다. 또한 시스템의 교착상태를 쉽게 발견할 수 있다. 본 논문은 ATM과 실행 모델, 도달성 그래프, 검증을 위한 속성 등을 기술하며 이들을 다른 정형 기법들과 예제를 통하여 비교한다.

• Journal of the Korea Society of Computer and Information
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• v.24 no.10
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• pp.57-64
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• 2019

In this paper, we study a polynomially solvable case of the inverse interval graph coloring problem. Given an interval graph associated with a specific interval system, the inverse interval graph coloring problem is defined with the assumption that there is no proper K-coloring for the given interval graph, where K is a fixed integer. The problem is to modify the system of intervals associated with the given interval graph by shifting some of the intervals in such a way that the resulting interval graph becomes K-colorable and the total modification is minimum with respect to a certain norm. In this paper, we focus on the case K = 1 where all intervals associated with the interval graph have length 1 or 2, and interval displacement is only allowed to the righthand side with respect to its original position. To solve this problem in polynomial time, we propose a two-phase algorithm which consists of the sorting and First Fit procedure.

• The Transactions of the Korea Information Processing Society
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• v.3 no.4
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• pp.926-937
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• 1996

A graph traversal technique is a certain pattern of visiting nodes of a graph. Many special traversal techniques have been applied to solve graph related problems. For example, the depth first search technique has been used for finding strongly onnected components of a directed graph or biconnected components of a general graph. The distributed protocol to implement his depth first search technique on the distributed network can be divided into a fixed topology problem where there is no topological change and a dynamic topology problem which has some topological changes. Therefore, in this paper, we present a more efficient distributed depth first search protocol with fixed topology and a resilient distributed depth first search protocol where there are topological changes for the distributed network. Also, we analysed the message and time complexity of the presented protocols and showed the improved results than the complexities of the other distributed depth first search protocols.