• Bioinformatics and Biosystems
• /
• v.2 no.2
• /
• pp.37-45
• /
• 2007

생물정보학은 컴퓨터를 이용하여 방대한 양의 생물학적 데이터를 처리하고 그 결과를 분석하는 학문으로서 IT의 고속성장과 맞물려 점차 그 활용도를 넓혀가고 있다. 특히 의학, 생명과학 연구에 사용되는 데이터는 그 종류도 다양하고 크기가 매우 큰 것이 일반적인데, 이의 처리를 위해서는 고속 네트워크가 바탕이 된 그리드-컴퓨팅(Grid-Computing) 기술 접목이 필연적이다. 고속 네트워크 기술의 발전은 슈퍼컴퓨터를 대체해 컴퓨터 풀 내에 분산된 시스템들을 하나로 묶을 수 있는 그리드-컴퓨팅 분야를 선도하고 있다. 최근 생물정보학 분야에서도 이처럼 발전된 고성능 분산 컴퓨팅 기술을 이용하여 데이터의 신속한 처리와 관리의 효율성을 증대시키고 있는 추세이다. 그리드-컴퓨팅 기술은 크게 데이터 가공을 위한 응용 프로그램 개발과 데이터 관리를 위한 데이터베이스 구축으로 구분 지을 수 있다. 전자에 해당하는 생물정보 연구용 프로그램들은 mpiBLAST, ClustalW-MPI와 같은 MSA서열정렬 프로그램들을 꼽을 수 있으며, BioSimGrid, Taverna와 같은 프로젝트는 그리드-데이터베이스 (Grid-Database)기술을 바탕으로 개발되었다. 본 고에서는 미지의 생명현상을 탐구하고 연구하기 위하여 현재까지 개발된 그리드-컴퓨팅 환경과 의생명과학 연구를 위한 응용 프로그램들, 그리고 그리드-데이터베이스 기술 등을 소개한다.

• Communications of the Korean Institute of Information Scientists and Engineers
• /
• v.31 no.4
• /
• pp.24-33
• /
• 2013

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
• /
• 2003.11b
• /
• pp.777-780
• /
• 2003

한국과학기술정보연구원 슈퍼컴퓨팅센터에서는 작년부터 그리드 테스트 베드를 운영하면서 축적된 기술을 바탕으로 금년 하반기부터 그리드 시범 서비스를 시행할 예정에 있다. 그리드 환경에서의 사용자 요금 부과를 위해서는 기존의 체계와는 다른 여러 가지 요소들을 고려해야 하는데, 본 고에서는 그리드 환경에 적합한 요금부과 프로그램을 설계하였다.

• Journal of Scientific & Technological Knowledge Infrastructure
• /
• s.8
• /
• pp.113-118
• /
• 2002

한국과학기술정보연구원 (KISTI) 슈퍼컴퓨팅센터의 SeeMore는 국내에서 처음으로 구현된 시스템으로 지난 해 4월에 설치되었으며, 복잡하고 방대한 계산결과를 가상현실 공간상에서 시각화하여, 효과적인 해석을 가능하게 하는 과학적 가시화 시스템이라고 할 수 있다. SeeMore에서 활용될 수 있는 적용 분야는 가상현실, 과학적 데이터의 시각화, 복잡한 데이터의 분석, 기상모델링, 양자화학, 생물정보학, 물리적 현상의 모델링에 이르기까지 무궁무진하다.

• Information and Communications Magazine
• /
• v.30 no.6
• /
• pp.40-46
• /
• 2013

본고에서는 무선인체센서내트워크의 개념을 정립하고, WBAN (Wireless Body Network)의 표준화 동향, 문제점 그리고 향후 지속 가능한 연구 방향에 대하여 고찰하였다. 클라우드 컴퓨팅 환경은 인체센서 노드에서 고성능 슈퍼 컴퓨터에 이르는 다양한 범위의 서로 다른 장치를 연결하여 컨텐트 중심의 서비스를 제공하게 될 것이며 이에 대한 이슈와 연구방향을 진단하였다. 나노기술로 인하여 나노미터 수준의 장치를 개발할 수 있을 것으로 예상되며, 이러한 나노장치 간 정보교환은 의료, 환경 및 군사 분야에서 떠오르는 나노 응용기술로 발전하게 되었다. 나노장치 사이의 정보전송을 전기자기학적(EM) 나노통신 및 분자레벨 나노통신으로 구분할 수 있으며 이들의 연구 방향을 통신 이론적 관점에서 고찰하고 분석하였다.

• Journal of Scientific & Technological Knowledge Infrastructure
• /
• s.12
• /
• pp.104-107
• /
• 2003

지식하부구조는 '능력'의 형태를 띠고 있다. 능력은 기본적으로 지식의 형태로 존재하게 된다. 그러나 이 지식은 기초연구 또는 교과서나 설계도와 같은 형식화된 지식만을 지칭하는 것이 아니라 공식언어로는 제대로 표현되지 않는 암묵적인 지식(tacit knowledge)까지 포괄하고 있다. 암묵적인 지식은 일반적으로 기업 특수적 성격을 지니고 있거나 산업 특수적인 성격을 지니고 있다. 암묵적인 지식은 공동의 경험을 지닌 사람들이나 조직들 사이에 공유되는 지식이기 때문이다. 이러한 측면에서 보았을 때, 능력으로서 존재하는 지식하부구조는 특정 산업이나 영역에서 국지성을 지니고 있다고 파악된다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
• /
• 2019.10a
• /
• pp.115-117
• /
• 2019

누리온 시스템은 Intel Xeon Phi 아키텍쳐를 기반한 8305개의 노드로 구성되었고, 이론 성능 25.7페타플롭스를 갖춘 시스템으로 2018년도에 도입되었다. 누리온 시스템은 그동안 KISTI가 지속적으로 수행해 온 국내 계산과학자를 지원하는 한편, 빅데이터를 기반으로 하는 거대 규모의 딥러닝 등의 새로운 AI 분야에서도 슈퍼컴퓨팅을 활용할 수 있도록 전략적으로 지원하고 있다. 본 논문에서는 이러한 거대 규모 딥러닝을 수행하는데 있어 발생하는 주요 이슈들과 이러한 이슈들을 누리온 시스템에서는 어떻게 해결하고 있는지에 대해 소개한다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
• /
• 2015.10a
• /
• pp.187-190
• /
• 2015

지역적으로 분산되어 있는 PLSI 연동 자원 간 사용자 작업 데이터의 원활한 공유을 위한 글로벌 공유파일시스템은 통합 슈퍼컴퓨팅 서비스의 핵심 구성요소 중의 하나이다. 본 연구에서는 10Gbps급 WAN 전용망 환경에서 공개 소프트웨어인 Lustre 병렬파일시스템 기반의 글로벌 공유파일시스템의 성능을 측정 및 분석하여 차세대 글로벌 공유파일시스템 구축을 위한 기반을 마련하고자 한다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
• /
• 2013.05a
• /
• pp.111-113
• /
• 2013

멀티 코어 시스템의 보급으로 일반 시스템에서도 프로그램의 병렬 실행이 가능해지고 있다. 본 연구에서는 멀티 코어를 사용하는 단일 시스템에서 분자 동역학 코드인 LAMMPS를 대상으로 병렬 수행 성능을 확인하고 분석하여 효과적인 실행 조건을 살펴보았다. LAMMPS의 구조적인 특징과 공간 분할 방식의 사용으로 인하여 단일 시스템에서도 메시지 전달 방식에 의한 병렬 수행이 보다 효율적임을 확인할 수 있었다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
• /
• 2013.05a
• /
• pp.114-116
• /
• 2013

메시지 전달 방식의 병렬 프로그래밍에서 사용되는 MPI는 프로그램의 확장성 보장에 적합한 MPI-IO라는 파일 I/O 방법을 제공하고 있다. MPI-IO는 동시적인 병렬 I/O 수행으로 인한 성능 저하를 최소화하기 위하여 내부적으로 데이터 재정렬 후 I/O를 수행한다. 본 연구에서는 이와 같은 MPI-IO의 내부 처리과정을 기록하기 위한 방안을 강구하여 실행 시간 로그를 기록하였고 이를 바탕으로 MPI-IO의 특성을 살펴보았다.