Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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2002.11a
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pp.743-746
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2002
바이오 인포매틱스(bioinformatics) 분야 중 한 분야인 셀 기반 분석(cell-based assay) 시스템 구축의 필요성이 최근 대두되고 있다. 특정 시약 또는 시험 물질을 셀 세포에 투여했을 때 시간 축 변화에 따라 변화하는 세포의 변화를 감지하기 위해서 세포 영상의 영역 분할이 선행되어야 한다. 본 논문에서는 전체 영상에 대하여 셀 공통 영역을 추출하고, 추출된 공통영역을 스네이크(snake) 기법을 이용하여 세포 영역을 분할하는 방법을 제안하고자 한다.
Kim, De-Sok;Yoo, Jin-Sung;Lee, Jin-Woo;Kim, Jong-Won;Moon, Shin-Yong;Choi, Young-Min
Proceedings of the KOSOMBE Conference
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v.1998
no.11
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pp.66-69
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1998
Comparative genomic hybridization (CGH) is an important molecular cytogenetics technique that maps abnormal copy number of specific DNA sequence of the chromosome. CGH is based on quantitative digital image analysis of ratio images from fluorescently labeled chromosomes. In this paper, we would like to introduce how recently developed image analysis algorithms are used for CGH techniques. To average the ratio profile of each chromosome, binarization, skeletonization, and stretching of chromosome images have been studied. Developed algorithms have been implemented in the karyotyping system ChIPS commercially developed at Biomedlab Co. Ltd.
In this study, we evaluated diffusion weighted imaging (DWI) to investigate whether the DWI parameters can predict characteristic parameters on pathologic specimens of tumor or not. CFPAC-1 was injected subcutaneously on the back flank of athymic nude mice (n=13) then two tumors were initiated on each mouse (2${\times}$13=26 tumors). The mice were sacrificed to make specimen immediately after initial MR imaging then were compared with the MR image. A dedicated high-field (7T) small-animal MR scanner was used for image acquisitions. A T1 and T2 weighted axial image using RARE technique was acquired to measure the T2 values and tumor size. DWI MR was performed for calculating ADC values. To evaluate tumor cellularity and determine the levels of MVD, tumor cells were excised and processed for H-E staining and immunostaining using CD31. T2 values and ADC values were computed and analyzed for each half of the tumors and compared to the correlated specimens slide. Median ADC within each half of mass was compared to the cellularity and MVD in the correlated area of pathologic slide. The mean of ADC value is $0.7327{\times}10^{-3}$$mm^2/s$ and standard deviation is $0.1075{\times}10^{-3}$$mm^2/s$. There is a linear relationship between ADC value and tumor necrosis (R2=0.697, p< 0.001). DW image parameters including the ADC values can be utilized as surrogate markers to assess intratumoral neoangiogenesis and change of the internal structure of tumor cells.
목적: 고형성 종양에 특이적으로 발현하는 MR 분자영상용 조영제의 후보물질을 분자생물학적 방법 및 in vitro 분자영상기법을 이용하여 탐색하고자 하였다. 대상 및 방법: 암이 진행됨에 따라 유전자가 과발현되는 세포표면 단백질인 CD44 와 세포막에 존재하는 단백질분해효소의 일종인 MTI-MMP를 일차 선정하여 유전자 수준 및 단백질 수준에서 분자생물학적 방법으로 종양특이성에 대해 검증하였고, 특히 각종 암세포에서 발현양이 증가하는 CD44의 변형인 CD44v6 항체를 이용하여 생세포에서의 표적화에 대한 광학적 검증을 위해 초상자성 나노입자 대신 형광입자(FITC)를 결합하여 confocal microscopy로 실시간 표적화에 대한 분자영상을 획득하였다.
Je Sung-Kwan;Cho Jae-Hyun;Kim Kwang-Baek;Cha Eui-Young
Proceedings of the Korean Institute of Intelligent Systems Conference
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2005.04a
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pp.261-264
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2005
현재 인간시각의 모델에 관한 많은 연구가 진행중이다. 본 논문에서는 형태정보의 영역대비를 강조하는 무축삭세포의 기능을 반영한 계산론적 망막모델을 제안한다. 무축삭세포는 전달된 물체의 운동정보의 변화를 감지하는 기능을 가지며, 그 감지된 정보를 강조하는 기능이 있다. 본 논문에서는 양극세포에서 출력된 형태정보의 영역대비를 강조한 계산론적 망막모델을 구현하였다. 실험에서는 양극세포의 결과 영상과 무축삭세포의 기능을 처리한 결과영상을 비교하였다. 따라서 무축삭세포의 영역대비 기능을 구현함으로써 대뇌피질에서는 영상의 정보를 효율적으로 처리할 수 있다.
To the detect of SPIO-labelled hMSC, in vitro study on various cell concentration and in vivo molecular magnetic resonance imaging(MRI) technique using T2, $T2^*$ and SWI are compared with pathology. Cell concentration was $1.56{\times}10^4$, $3.13{\times}10^4$, $6.25{\times}10^4$, $1.25{\times}10^5$, $2.5{\times}10^5$, $5{\times}10^5\;cells/m{\ell}$ and for control $5{\times}10^5\cells/m{\ell}$. MRI technique using T2, $T^2$ and SWI. Photothrombotic infarction was located 2.5mm from bregma right, posterior. Cell injected through the tail vein of rat for 8 rats. MRI performed pre injection and post injection of 1, 3, 7 and 14days and sacrifice for pathology. MRI analysed on quantitatively. In vitro result, SWI was highest CNR as compared with $T2^*WI$, T2WI and $2.5{\times}10^5\;cells/m{\ell}$ cell concentration. In vivo result among the T2WI, $T2^WI$, SWI, T2WI is highest CNR between normal and infarction. CNR in normal-SPIO and infarction-SPIO is high score in SWI. Therefore, T2WI is good distinguish between normal and infarction, SWI are well detect SPIO-labelled hMSC from normal and infarction. Nowaday, SWI are mostly used on hemorrhage, calcification etc. in clinically, but for the future, stem cell therapy is commonly application at all disease which is good observing tool for SPIO-labelled stem cells.
Although the outcome of cancer patients after cytotoxic chemotherapy is related diverse mechanisms, multidrug resistance (MDR) for chemotherapeutic drugs due to cellular P-glycoprotein (Pgp) or multidrug-resistance associated protein (MRP) is most important factor in the chemotherapy failure to cancer. A large number of pharmacologic compounds, including verapamil, quinidine, tamoxifen, cyclosporin A and quinolone derivatives have been reported to overcome MDR. Single photon emission computed tomography (SPECT) and positron emission tomography (PET) are available for the detection of Pgp and MRP-mediated transporter. $^{99m}Tc$-MIBI and other $^{99m}Tc$-radiopharmaceuticals are substrates for Pgp and MRP, and have been used in clinical studies for tumor imaging, and to visualize blockade of PgP-mediated transport after modulation of Pgp pump. Colchicine, verapamil and daunorubicin labeled with $^{11}C$ have been evaluated for the quantification of Pgp-mediated transport with PET in vivo and reported to be feasible substrates with which to image Pgp function in tumors. Leukotrienes are specific substrates for MRP and $N-[^{11}C]acetyl-leukotriene$ E4 provides an opportunity to study MRP function non-invasively in vivo. SPECT and PET pharmaceuticals have successfully used to evaluate pharmacologic effects of MDR modulators. Imaging of MDR and reversal of MDR with bioluminescence in a living animal is also evaluated for future clinical trial. We have described recent advances in molecular imaging of MDR and reviewed recent publications regarding feasibility of SPECT and PET imaging to study the functionality of MDR transporters in vivo.
Amyloidosis is a multisystemic disease characterized by the accumulation of abnormal proteins in extracellular spaces in various organs, with frequent involvement of the myocardium. We report a case of a patient who had cardiac amyloidosis with a trend of reduction in native T1 and T2 values and extracellular volume fraction on serial cardiac magnetic resonance imaging after chemotherapy and stem cell transplantation. The native T1 value and the extracellular volume fraction are closely associated with tissue amyloid burden in amyloidosis patients. This case demonstrated that cardiac magnetic resonance imaging may be used as a non-invasive and quantitative biomarker in the treatment monitoring of amyloidosis.
Sunah Heo;Sun-Young Park;Jinwon Seo;Sung Hye Koh;In Jae Lee
Journal of the Korean Society of Radiology
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v.82
no.1
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pp.250-254
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2021
Diffuse-type tenosynovial giant cell tumor (D-TSGCT), previously known as pigmented villonodular synovitis, is a locally aggressive neoplasm that may arise from the synovium, bursa, or tendon sheath. D-TSGCT is usually monoarticular and can be classified into intra- and extra-articular forms, the latter of which is rarer. Here, we report a case of D-TSGCT in a 64-year-old female that involved the entire flexor and extensor tendon sheaths of both wrists. We describe the ultrasonography and MRI findings, as well as review the relevant literature.
Purpose: Luciferase is one of the most commonly used reporter enzymes in the field of in vivo optical imaging. D-luciferin, the substrate for firefly luciferase has very high cost that allows this kind of experiment limited to small animals such as mice and rats. In this current study, we validated local injection of D-luciferin in the articular capsule for bioluminescence imaging in rabbits. Materials and Methods: Chondrocytes were cultured and infected by replication-defective adenoviral vector encoding firefly luciferase (Fluc). Chondrocytes expressing Fluc were injected or implanted in the left knee joint. The rabbits underwent optical imaging studies after local injection of D-luciferin at 1, 5, 7, 9 days after cellular administration. We sought whether optimal imaging signals was could be by a cooled CCD camera after local injection of D-luciferin. Results: Imaging signal was not observed from the left knee joint after intraperitoneal injection of D-luciferin (15 mg/kg), whereas it was observed after intraarticular injection. Photon intensity from the left knee joint of rabbits was compared between cell injected and implanted groups after intraarticular injection of D-luciferin. During the period of imaging studies, photon intensity of the cell implanted group was 5-10 times higher than that of the cell injected group. Conclusion: We successfully imaged chondrocytes expressing Fluc after intraarticular injection of D-luciferin. This technique may be further applied to develop new drugs for knee joint disease.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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