• Title, Summary, Keyword: 생화학적 정보

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A System To Integrate The Biochemical Network Data Efficiently (생화학적 네트워크 데이터의 효율적인 통합을 위한 시스템)

  • Jung, Tae-Sung;Ahn, Myung-Sang;Cho, Wan-Sup
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • pp.238-240
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    • 2005
  • 유전자의 생물학적 기능을 밝히고 세포 내 상호작용을 이해하는 것은 post-genome era의 가장 중요한 작업 중 하나이다. 세포는 서로 다른 컴포넌트들의 상호작용에 의해 아주 복잡한 네트워크를 구성한다. 생화학적 네트워크에는 metabolic, regulatory, signal transduction과 같은 세포의 프로세스를 포함한다. 이러한 생화학적 네트워크들은 서로 다른 정보체계를 가지고 각기 다른 데이터베이스에 분산되어 저장관리 되고 있다. 따라서 생화학적 네트워크 데이터를 체계적으로 효율적으로 저장, 관리하기 위한 데이터베이스에 대한 필요성이 증대되고 있다. 본 논문에서는 기존의 생화학적 네트워크 데이터베이스의 장.단점을 분석하고 객체지향 방식에 입각한 새로운 생화학적 네트워크 데이터의 통합을 위한 시스템 모델을 제시한다. 제안된 시스템 모델은 생화학적 네트워크 데이터에 대한 생물학전 관계를 자연스럽게 표현할 수 있는 객체지향 모델을 사용하였다. 또한 생화학적 네트워크 모델을 묘사하기 위한 응용프로그램 사이의 데이터 교환의 표준언어인 SBML[2]스키마를 기반으로 하고 있다.

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A Molecular Neural Network Based on Synaptic Transmission (시냅스 전위활동에 기반한 분자 신경망)

  • 정호진;조동연;장병탁
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • pp.416-418
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    • 2003
  • 해마 뉴런의 시냅스에서 발생하는 전류는 후시냅스의 생화학적 반응을 통해 다음 뉴런으로 전달된다. 즉, 시냅스는 정보를 전달하는 매개로서 전시냅스에서 입력된 정보에 의거하여 후시냅스로 보내는 전류량을 조절하게 된다. 본 논문에서 제안하는 시냅스 기전 신경망 모델은 기존의 신경망과는 달리 시냅스에서 일어나는 반응-확산(reaction-diffusion) 모델에 의하여 입력과 출력의 관계를 결정한다. 제안된 신경망을 분류 문제에 적용한 결과 은닉 뉴런층 없이도 좋은 성능을 보였으며, 이 신경망은 앞으로 뇌에서의 생화학적 뉴런 학습 양상을 연구하는 모델로 사용될 수 있다.

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Gene Ontology based SBML Document Management and Query processing system (GO 기반의 SBML 문서 관리 및 질의 처리기)

  • Jung Seung-Hyun;Jung Tae-Sung;Kim Tae-Kyung;Kim Kyoung-Ran;Cho Wan-Sup
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • pp.88-90
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    • 2006
  • 본 논문에서는 SBML문서를 효율적으로 저장관리 할 수 있는 Gene Ontology 기반의 SBML 문서관리 시스템을 제안한다. SBML은 시스템생물학에서 생화학적 네트워크 데이터의 교환 표준으로 연구 개발되었으며, 다수의 생화학적 네트워크 데이터베이스들이 SBML을 이용하여 데이터를 제공해주고 있다. 이러한 SBML 문서를 통해 서로 다른 데이터베이스 또는 응용 프로그램간 정보를 교환으로 사용되고 있으며, 그 양 또한 급속하게 증가하고 있다. 따라서 본 논문에서는 이러한 대량의 SBML 문서를 효율적으로 저장, 검색 할 수 있는 문서관리시스템을 제안한다. 제안된 시스템은 OODB를 사용하여 효율적으로 SBML 문서를 저장관리하며, Gene Ontology를 기반으로 생화학적 용어의 모호성을 해결하고, SBML문서간의 발생하는 데이터 중복을 제거하여 데이터의 품질을 제고하였다.

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On the Construction of an Object-Oriented Metabolic Pathway Database (대사경로 데이터베이스 구축)

  • 안명상;정태성;조완섭;노동현
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • pp.295-297
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    • 2004
  • 유전자의 생물학적 기능을 밝히고 세포 내 상호작용을 이해하는 것은 post-genome era의 가장 중요한 작업 중 하나이다. 이러한 세포 내 상호작용은 복잡한 생화학적 네트워크를 형성하게 되며 그 중 Metabolic pathway(대사 경로)는 생물 시스템을 이해하는데 가장 중요한 부분을 차지하게 된다. 대사 경로를 분석하기 위하여 분자의 기능 및 생화학적 프로세스에 대한 정보를 데이터베이스에 저장.관리해야하고, 사용자의 다양한 질의에 대하여 관련정보를 검색하여 GUI환경에서 제공해야 한다. 이 논문은 대사 경로 정보를 객체 데이타베이스 형태로 모델링하여 구축하고, 사용자가 관심있는 정보를 SBML형태로 제공하는 대사경로 데이타베이스의 설계 및 구현에 관해 다룬다.

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Lethal and Sublethal Toxicities of Bisphenol A and Ethynyl Estradiol Exposure on the 4th Instar Larvae of Chironomus riparius (Diptera, Chironomidae) (비스페놀 에이와 에티닐에스트라디올에 노출된 키로노무스 4기 유충의 치사, 아치사 독성연구)

  • Lee, Se-Bum;Choi, Jin-Hee
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • v.21 no.4
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    • pp.301-310
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    • 2006
  • 본 연구에서는 내분비계장애물질로 잘 알려진 Bisphenol A와 Ethynyl estradiol(이하 BPA, EE)이 Chironomus riparius에 미치는 영향을 알아보고자 하였다. 수생생태계에서 Chironomus의 생태학적 중요성을 고려하여 연구한 반수치사농도(LC50),효소 활성, 성장/발달 등의 생화학적, 생리학적 독성에 대한 연구는 이들 물질에 대한 잠재적인 생태학적 중요성을 이해하는데 있어 유용한 정보를 제공할 수 있을 것이다. 연구 결과 BPA와 EE에 노출된 후 C. riparius게서 CAT와 GST활성이 증가하였고, EE에 고농도로 노출된 후 성충까지 충분히 성장하지 못했음을 확인하였다 이러한 결과로부터 C. riparius에서 BPA, EE에 대한 중요한 독성정보를 얻을 수 있었다. 그러므로 앞으로 BPA와 EE의 생화학적 효과와 C. riparitis의 개체수준 이상에서의 생리학적 실험을 통한 검증이 필요할 것이다.

Analysis of Bone Mineral Density According to the Biochemical Variable Markers in Adults (생화학적 표식자에 따른 성인들의 골밀도 분석)

  • Kim, Sun-Geun;Kweon, Dae-Cheol;Song, Woon-Heung
    • Journal of radiological science and technology
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    • v.32 no.4
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    • pp.411-418
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    • 2009
  • To evaluate the bone mineral density (BMD) and biochemical markers. We evaluated the BMD of femoral neck and lumbar spines of 998(male 568, female 430) persons who took a regular health screening in Woosuk University Hospital from September 2007 to March 2008 by dual energy bone mineral densitometry. Results of BMD are different in terms of biochemical markers. Especially aged people showed osteoporotic change progressively. Degree of osteoporosis increases with age. A steep decrease of BMD can be found in postmenopausal women who have low level of female hormone. More persistent effort is needed to find out the factors that can reduce BMD values for prevention of problems by osteoporosis. In essence, research on factors related to other biochemical markers must be studied continuously.

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Study of biochemical factors and stress in Korean Adults (한국인 성인에서 스트레스에 대한 생화학적 요인 분석 연구)

  • Lee, Bum Ju
    • The Journal of the Convergence on Culture Technology
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    • v.7 no.1
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    • pp.31-36
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    • 2021
  • Stress is a common risk factor for health and is associated with the endocrine gland and immune system. Studies on the association between stress and biochemical factors have been conducted worldwide, but studies on the association have been rare in South Korea. Therefore, the aims of this study are to analyze the relationship of stress with demographic information and biochemical factors for domestic adults and derive risk factors for stress. For data analysis, stress and normal groups were analyzed using binary logistic regression. In both men and women, age and average daily sleep time during the weekday were highly associated with stress, and the depression score (Patient Health Questionnaire-9) was also highly related with stress. In women, white blood cell levels were highly associated with stress, and in men, red blood cell levels were highly related with stress. These findings will contribute to the prevention of stress and the national health in the future.

Biochemical Properities, Isolation & Identification of the Propionibacterium acnes Picked from Acne Lesion (여드름병변에서 채취한 Propionibacterium acnes의 분리, 동정 및 생화학적 특성 연구)

  • Lee, Kyung-Suk;Choi, Jeung-Sook
    • Fashion & Textile Research Journal
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    • v.8 no.5
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    • pp.571-576
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    • 2006
  • Thirty P. acnes were isolated from the 30 acne patients who visited some skin care shops from Feburary of 2001 to August of 2001. They were identified by morphological features (gram stain), biochemical properties. Only P. acne strains are isolated among Propionibacteria sp. and biochemical properities of P. acnes were not different from P. acnes ATCC 11827 strain significantly. The results of the biotyping was as follow: twenty three strains of biotype I from comedone, 1 strain of biotype II from pauple, 5 strains of biotype III from pauple and pustule, and 1 strain of biotype IV from pauple were isolated respectively.

Efficacy of I-123/I-131 Metaiodobenzylguanidine Scan as A Single Initial Diagnostic Modality in Pheochromocytoma: Comparison with Biochemical Test and Anatomic Imaging (갈색세포종의 초기 진단에서 I-123/I-131 Metaiodobenzylguanidine 스캔의 단일 검사로써의 진단 성능: 생화학적 검사, 해부학적 영상과 비교)

  • Moon, Eun-Ha;Lim, Seok-Tae;Jeong, Young-Jin;Kim, Dong-Wook;Jeong, Hwan-Jeong;Sohn, Myung-Hee
    • Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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    • v.43 no.5
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    • pp.436-442
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    • 2009
  • Purpose: We underwent this study to evaluate the diagnostic potential of I-123/I-131 metaiodobenzylguanidine (MIBG) scintigraphy alone in the initial diagnosis of pheochromocytoma, compared with biochemical test and anatomic imaging. Materials & Methods: Twenty two patients (M:F=13:9, Age: $44.3{\pm}\;19.3$ years) having the clinical evaluation due to suspicious pheochromocytoma received the biochemical test, anatomic imaging modality (CT and/or MRI) and I-123/I-131 MIBG scan for diagnosis of pheochromocytoma, prior to histopathological confirmation. MIBG scans were independently reviewed by 2 nuclear medicine physicians. Results: All patients were confirmed histopathologically by operation or biopsy (incisional or excisonal). In comparison of final diagnosis and findings of each diagnostic modality, the sensitivities of the biochemical test, anatomic imaging, and MIBG scan were 88.9%, 55.6%, and 88.9%, respectively. And the specificities of the biochemical test, anatomic imaging, and MIBG scan also were 69.2%, 69.2%, and 92.3%, respectively. MIBG scan showed one false positive (neuroblastoma) and one false negative finding. There was one patient with positive MIBG scan and negative findings of the biochemical test, anatomic imaging. Conclusion: Our data suggest that I-123/I-131 MIBG scan has higher sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value and accuracy than those of biochemical test and anatomic imaging. Thus, we expect that MIBG scan is e tectively used for initial diagnosis of pheochromocytoma alone as well as biochemical test and anatomic imaging.

Anatomical and biochemical Changes of Corn Roots Infected with Pratylenchus vulnus (사과뿌리썩이선충의 침입과 기주의 해부학적 및 생화학적 변화에 관한 연구)

  • 한혜림;한상찬;김용균
    • Korean journal of applied entomology
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    • v.34 no.2
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    • pp.112-119
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    • 1995
  • Anatomical and biochemical changes of the corn root injured by the root lesion nematode, Pratylenchus vulnus, were examined to understand the interactions between the nematode and the crop which can be applied to a breeding program for nematode-resistant crop. The nematode and the crop which can be applied to be a breeding program for nematode-resistant crop. The nematode entered the cortex of corn root through its epidemis. They moved to other cortical cells by breaking their cell walls. They, finally, gathered around the endodermis of the roots and the bases of the root hairs. Parasitism of the nematode formed cavities within the root tissues where the females laid eggs. Major root damage by the nematode occurred in the cortical cells where must cell walls were broken and crushed to form empty spaces. These empty spaces in the base of the root resulted in this breakdown. Damage-induced biochemical changes of the corn roots were analysed by their total protein patterns and esterase activities in both control and nematode-infected roots. Denaturing gel did not show any significant difference in the banding patterns between them. Esterase patterns and activities, also, were not significantly different between the infected and the control roots.

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