• Title/Summary/Keyword: 생물 정보학

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Bioinformatics Technology (바이오 정보 기술)

  • Jung, H.Y.;Park, S.J.;Park, S.H.
    • Electronics and Telecommunications Trends
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    • v.20 no.5 s.95
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    • pp.93-104
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    • 2005
  • 현재 우리나라에서 가장 주목받고 있는 분야가 IT와 BT일 것이다. IT는 워낙 언론매체에 많이 노출되어 어떤 것을 말하고 어떤 분야가 있다는 것을 많은 사람들이 잘 알고 있는 실정이나, BT 관련해서는 단순히 시험관을 연상하는 사람이나 줄기세포 연구 정도로 알고 있는 사람들이 많을 것이다. 현재의 BT 분야는 예전의 소규모 실험을 벗어나 대규모의 실험 수행이 가능한 시스템이 구축되었는데, 이러한 대규모 실험 결과를 분석하기 위한 정보학적인 방법의 도입이 필수적인 시대가 되었다. 그래서, 이런 접근방법을 통상 IT와 BT의 융합기술이다라고 이야기한다. 바이오 정보 기술이란 이런 대규모의 생물학적 데이터를 시스템적으로 분석하여 정보를 추출하는 제반 기술이라고 이야기 할 수 있다. 일반적으로 많이 알려진 용어로는 생물정보학(바이오인포매틱스)혹은 계산생물학이 있다. 더 넓은 의미에서 이야기 할 때는 이러한 정보 추출을 위한 분석 과정뿐만 아니라, 생물학 관련 데이터베이스 구축 및 서비스 부분도 포함해서 이야기하고 있다.

Bio-ontology for Analyzing Protein Structure Information (단백질 구조 정보 분석을 위한 바이오 온톨로지)

  • Nam, Deok-Woo;Ye, Hyoung-Suk;Jin, Hoon;Kim, In-Cheol
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2003.10b
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    • pp.799-801
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    • 2003
  • 생물정보학 분야에서의 온톨로지는 다양한 생물학적 의미들을 표현하는 구조로 되어 있으며, 생물학 데이터의 의미를 효과적으로 해석할 수 있는 매우 중요한 기술로 인식되고 있다. 특히 바이오 온톨로지는 생물학 데이터베이스로부터 정보에 대한 탐색과 추론 등 의미 전달 과정에서 중심적인 역할을 수행한다. 본 논문에서는 단백질 구조 예측을 지원하는 다중 에이전트시스템인 APSS내에서 각 구성원 에이전트들간에 온톨로지에 기초한 정확한 구조 정보의 전달을 통해 효과적인 단백질 구조 예측 작업을 지원하고자 한다. 이를 위하여 먼저 단백질 구조 관련 바이오 온톨로지의 설계방법을 제시하고, 이것에 기초한 실제 바이오 온톨로지의 설계에 대해 설명한다. 그리고 이렇게 구축된 단백질 구조 온톨로지를 APSS시스템 안에서 어떻게 응용하였는가에 대해서도 설명한다.

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The Study of Protein Structure Visualization and Rendering Speed Using the Geometry Instancing (기하 인스턴싱 기법을 이용한 단백질 구조 가시화 및 속도 향상에 관한 연구)

  • Park, Chan-Yong;Hwang, Chi-Jung
    • The KIPS Transactions:PartA
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    • v.16A no.3
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    • pp.153-158
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    • 2009
  • Analysis of 3-dimensional (3D) protein structure plays an important role of structural bioinformatics. The protein structure visualization is the one of the structural bioinformatics and the most fundamental problem. As the number of known protein structure increases rapidly and the study of protein-protein interaction is prevalent, the fast visualization of large scale protein structure becomes essential. The fast protein structure visualization system we proposed is sophisticated and well designed visualization system using geometry instancing technique. Because this system is optimized for recent 3D graphics hardware using geometry instancing technique, its rendering speed is faster than other visualization tools.

Informal Communication among Korean Biological Scientists (한국 생물과학자들의 비공식 커뮤니케이션(I))

  • Cho, Myung-Hi
    • Journal of the Korean Society for information Management
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    • v.4 no.1
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    • pp.87-101
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    • 1987
  • This paper reports investigation of informal communication among Korean biological scientists. Scientists at the research front communicate informally each other and social organization based upon this communication relation is identified. Seventy-four percent of the scientists are joined together in a large communication network which includes all of the most productive and communicative scientists. Central scientists are the nodal points for dissemination of information as well as important information sources.

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Informal Communication among Korean Biological Scientists (한국 생물과학자들의 비공식 커뮤니케이션 (II))

  • Cho, Myung-Hi
    • Journal of the Korean Society for information Management
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    • v.4 no.2
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    • pp.62-83
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    • 1987
  • This paper reports investigation of informal communication among Korean biological scientists. Scientists at the research front communicate informally each other and social organization based upon this communication relation is identified. Seventy-four percent of the scientists are joined together in a large communication network which includes all of the most productive and communicative scientists. Central scientists are the nodal points for dissemination of information as well as important information sources.

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First Discovery of Euploea eunice (Godart, 1819) (Lepidoptera, Nymphalidae) from Korea (국내미접 푸른줄까마귀왕나비(나비목, 네발나비과) 보고)

  • Lee, Dong-June;Lee, Jae-Seok;Kim, Jongwon;Lee, Hyeon;Roh, Seung Jin
    • Korean journal of applied entomology
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    • v.61 no.2
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    • pp.289-291
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    • 2022
  • The genus Euploea Fabricius is reported from Korea with an unrecorded species, E. eunice (Godart) for the first time. Illustraion of adult and genitalia of examined species provided, with all available information. DNA barcode sequence for precise identification of the species is also provided.

후기 유전체 시대의 생명정보학과 데이터베이스의 연구방향

  • Ryu, Geun-Ho
    • Journal of Scientific & Technological Knowledge Infrastructure
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    • s.12
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    • pp.108-117
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    • 2003
  • 대용량의 생명정보 데이터의 분석과 새로운 지식 추출을 지원하기 위해 생명정보 데이터의 저장과 관리를 책임지는 데이터베이스의 역할은 생명정보학 분야에서 더욱 중요해 지고 있다. 그러나 최근 새롭게 출현한 생명정보 데이터의 저장 관리는 생명 정보 데이터의 고유한 특성과 이러한 데이터의 특성을 이해하기 위한 생물학적 지식의 요구로 인해 많은 문제점과 어려움이 발생되고 있다. 따라서 이 원고에서는 생명정보 데이터를 관리하기 위해 데이터베이스 분야의 최근 연구 현황과 연구방향을 제시한다.

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Biological Pathway Real-time Expansion System (생물학적 패스웨이 실시간 확장 시스템)

  • Choi, Yunsoo;Jeon, Sun-hee;Seo, Dongmin;Yu, Seok Jong
    • Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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    • 2015.05a
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    • pp.371-372
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    • 2015
  • 생물학적 패스웨이는 기존 연구 문헌들을 토대로 생의학 분야 전문가들에 의해 수작업으로 구축되기 때문에, 신규 문헌들이 포함하고 있는 최신 정보들이 패스웨이에 적용되는데 많은 시간을 소모하게 된다. 본 논문에서는 텍스트 마이닝 및 정보 추출 기술을 사용하여 구축된 디지털 학술자원인 VSB(Virtual Science Brain) 데이터베이스를 활용하여 실시간으로 생물학적 패스웨이를 확장하는 방법과, 이를 위한 사용자 인터페이스를 소개한다.

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A Study on a tool to generate polymorphic genome and metagenome sequences (다염기변이 및 메타유전체 염기서열 생성도구에 관한 연구)

  • Kim, Jonghyun;Kim, Woocheol;Park, Sanghyun
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2007.11a
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    • pp.262-263
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    • 2007
  • 유전체학 (genomics)의 가장 기초적인 기반이 되는 것은 염기서열을 정확하게 결정해 내는 것이다. 많은 진핵생물들 (eukaryotes)은 두개의 상동염색체를 가지며 두개의 염색체의 염기서열에는 차이가 존재한다. 현재의 유전체 염기서열 결정방법으로는 염기변이가 많이 존재할 경우 유전체의 염기서열을 결정하기 어렵다. 특정한 장소에 서식하는 무수히 많은 미생물들의 유전체의 염기서열을 동시에 결정하는 문제도 미생물학에서 중요성을 인정받는 문제이지만, 미생물들간의 염기변이의 정도는 단일개체의 경우보다 복잡하며 염기서열을 효과적으로 결정하기 힘들다. 따라서 염기변이가 많은 생물들과 미생물들 집합의 염기서열을 결정할 수 있는 방법론의 개발이 시급한 실정이다. 본 논문에서는 조립된 다염기변이 유전체및 메타유전체의 염기서열의 정확성을 평가하기 위한 유전체 서열과 시뮬레이션에 기반한 read 들을 생성하는 도구를 개발하는 것을 목표로 한다.