• 제목/요약/키워드: 생물 정보학

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전사체 시각화 프레임워크 개발 (Transcriptome visualization framework development)

  • 황혜련;김소라;조환규
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2012년도 추계학술발표대회
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    • pp.1340-1343
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    • 2012
  • 정보의 시각화는 추상적 정보를 직관적으로 이해하기 쉽도록 시각적으로 명확하게 표현하는 방법을 말한다. 대용량의 바이오 데이터를 다루는 생물정보학(bioinformatics) 분야에서는 컴퓨터의 높은 성능을 활용하여 수많은 유전학적 데이터들을 분석하고 있다. 다양한 생물정보학 실험에서 전사체는 특정한 조건에서 발현된 RNA의 총합을 말한다. 분석된 전사체 정보는 텍스트형태로 제공이 되는데 이를 사용자가 수작업으로 비교하는 데에는 한계가 있다. 따라서 분석된 전사체 정보를 효과적으로 인지할 수 있도록 시각화하는 연구들이 진행되고 있다. 본 논문에서는 그래프 라이브러리인 yFile을 활용하여 추정된 전사체를 실시간으로 시각화하여 제공하는 방법을 제안한다. GTF파일을 입력받아서 데이터베이스에 저장하고 이 정보를 이용하여 그래프를 생성한다. 실험 결과는 전사체를 시각화 하는 방법을 통하여 다양한 전사체 정보를 알아 낼 수 있고, 최종적으로는 novel gene을 찾는 것이 가능할 것으로 기대한다.

보건분야의 생명정보학 (Bioinformatics in Public Health Science)

  • 김은진;배세은;손현석
    • Bioinformatics and Biosystems
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    • 제2권2호
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    • pp.66-70
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    • 2007
  • 과거 사회라는 개념 속에서의 관찰과 통계적 인과관계의 규명에 치중하여 이루어졌던 보건학 연구는 유전체 연구와 같은 증거 위주의 기초과학적 측면에서 이루어 지고 있는 것이 현재의 추세이다. 이러한 생물학적 데이터를 이용한 질병과 보건에 대한 연구가 활성화 됨에 따라 보건 분야에서도 컴퓨터를 이용하여 방대한 정보를 다룰 수 있는 생명정보학이 유용한 도구로서 인식되고 있다. 본고에서는 생명정보학이 보건학의 연구분야에서 어떻게 이용되는 가를 학술적인 의미에서 살펴보고 그 활용방안에 대해 논의해 보고자 한다.

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해부학적 구조를 이용한 유전자 정보 통합 기법 (Integration Scheme of Gene Information based on Anatomical Structure)

  • 양기철
    • 디지털융복합연구
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    • 제13권2호
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    • pp.153-158
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    • 2015
  • 생물학자들은 특정 암이나 선천성 질병을 이해하는데 핵심정보를 제공할 수 있는 유전자관련 연구를 진행하고 있다. 하지만 생물학적 실험은 실험당시의 여러 가지 요소나 상황의 차이 또는 해석의 차이에 의해 서로 다른 결과를 생성하기도 한다. 따라서 현존하는 연구 결과들은 서로 상이한 정보를 제공할 수 있다. 유전자 정보의 통합을 통하여 이러한 불일치를 찾을 수 있다. 유전자 정보들이 불일치가 없이 통합 된다면 생물학자들은 어떤 유전자 정보를 알기 위해서 여러 연구 결과를 검토하지 않아도 되어 시간과 노력을 절감할 수 있게 된다. 이를 위하여 본 논문에서는 서로 다른 연구에 의해 구축된 유전자 정보를 하나의 정보로 통합 및 확장하는 기법을 소개한다.