• 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
• /
• 제8권10호
• /
• pp.397-402
• /
• 2019

암 환자에게 적절한 치료계획을 제공하기 위해 암의 진행양상 또는 환자의 생존 기간 등에 해당하는 환자의 예후를 정확히 예측하는 것은 생물정보학 분야에서 다루는 중요한 도전 과제 중 하나이다. 많은 연구에서 암 환자의 유전자 발현량 데이터를 이용하여 환자의 예후를 예측하는 기계학습 모델들이 많이 제안되어 오고 있다. 유전자 발현량 데이터는 약 17,000개의 유전자에 대한 수치값을 갖는 고차원의 수치형 자료이기에, 기존의 연구들은 특징 선택 또는 차원 축소 전략을 이용하여 예측 모델의 성능 향상을 도모하였다. 그러나 이러한 접근법은 특징 선택과 예측 모델의 훈련이 분리되어 있어서, 기계학습 모델은 선별된 유전자들이 생물학적으로 어떤 관계가 있는지 알기가 어렵다. 본 연구에서는 유전자 발현량 데이터를 이미지 형태로 변환하여 예후 예측이 효과적으로 특징 선택 및 예후 예측을 수행할 수 있는 기법을 제안한다. 유전자들 사이의 생물학적 상호작용 관계를 유전자 발현량 데이터에 통합하기 위해 Node2Vec을 활용하였으며, 2차원 이미지로 표현된 발현량 데이터를 효과적으로 학습할 수 있도록 합성곱 신경망 모델을 사용하였다. 제안하는 모델의 성능은 이중 교차검증을 통해 평가되었고, 유전자 발현량 데이터를 그대로 이용하는 기계학습모델보다 우월한 예후 예측 정확도를 가지는 것이 확인되었다. Node2Vec을 이용한 유전자 발현량의 새로운 이미지 표현법은 특징 선택으로 인한 정보의 손실이 없어 예측 모델의 성능을 높일 수 있으며, 이러한 접근법이 개인 맞춤형 의학의 발전에 이바지할 것으로 기대한다.

• 한국버섯학회지
• /
• 제19권2호
• /
• pp.96-102
• /
• 2021

표고 톱밥재배용 다수성 품종 육성을 위해 수집균주 중 우량계통의 단포자 교배로 육성한 '다담'의 주요 특성은 다음과 같다. '다담'의 균사생장 적온은 19~22℃, 발이 및 생육온도는 13~20℃, 발생형은 산발형으로 대조품종 '화담'과 유사하였고, 형태는 평편형으로 평반구형인 '화담' 차이가 있었다. 또한, 자실체 갓색은 '화담' 보다 진하고, 갓두께는 얇고, 대길이는 긴 특성을 가졌다. '다담'의 총 재배기간은 135~139일로 '화담'의 138~142과 크게 차이 나지 않았다. '다담'의 3주기까지 수량은 621 g으로 '화담' 371 g 보다 67% 많았다. 주기별 수량 양상을 보면, '다담'과 '화담' 모두 3주기 수량의 80~83%를 2주기 동안 수확할 수 있었다. 특히, '다담'은 1주기 수량비중이 60%로 '화담' 52%보다 1주기에 수량이 집중되는 특성을 보였다. 농가실증시험 결과, '다담'은 농가재배 품종인 'L808' 보다 다소 갓크기는 작고 대길이가 길었고 재배기간과 수량은 큰 차이 없었다. '다담'의 발생한 자실체 개체는 1개 배지에 평균 15개로 'L808'의 47개에 비해 약 3배정도 적어 솎기에 투입되는 노동력을 절감하는 효과가 기대된다.

• 생태와환경
• /
• 제38권3호통권113호
• /
• pp.420-428
• /
• 2005

유해조류의 대발생을 제어하기 위하여 개발되었던 박테리아, 백운몰개, 송사리 등의 직접 및 배양여액이 배양중인 단독형 (solitary) 남조 M. aeruginosa의 성장 및 형태에 어떠한 영향을 주는지 파악하기 위하여 대수기 조류세포에 생물제재를 농도별로 처리하였다. 실험에 사용된 3가지 생물제재의 적접처리시 남조 M. aeruginosa를 효과적으로 감소시켰으며, 특히 2종의 어류는 모두 처리 5일째 조류세포를 완전히 제어하였다. 생물제재의 직접 또는 여액에 의한 조류세포의 군체형성은 생물제재의 종류, 처리유형, 처리농도 등에 따라 차이를 보였는데, 어류의 경우, 여액 처리농도가 높을수록 높은 군체 및 군체당 높은 세포수를 나타냈으나, 살조세균은 농도에 따른 유의한 차이를 보이지 않았다. 결국, 유해조류의 제어를 위한 생물제재의 현장 적용은 남조 M. aeruginosa의 군체형성을 유도함으로서 새로운 조류대발생의 원인이 될 수 있기 때문에 새로운 생물제재나 적용기법 등의 개발이 필요하다고 판단되었다.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
• /
• 한국생물공학회 2001년도 추계학술발표대회
• /
• pp.274-277
• /
• 2001

미생물에 독성영향을 미치는 것으로 알려진 SCN 이 포항제철소내 관리형 매립시설에서 나오는 침출수에 함유된 농도는 미생물에 의해 제거될 수 있었다. 온도에 따른 SBR 운전 결과를 통하여 적응된 이후에 비해서 초기에 긴 적응기간이 필요하다. 온도가 증가함에 따라 초기 직응기간이 짧아지고 수렴하는 SCN 제거소요시간이 짧아짐을 알 수 있었다. $SCN^-$ 이 미생물의 애너지원과 질소, 황, 탄소원으로 사용되어 제거됨을 온도변화에 따른 SBR 운전으로 알 수 있었다.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
• /
• 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XIII)
• /
• pp.504-508
• /
• 2003

본 연구에서 음이온에 안정한 파파인을 얻기 위한 방법으로 방향성분자진화을 이용하였다. 변이체를 선별하기 위한 방법으로는 skin milk agar plate에 음이온성 고분자 물질은 1%농도로 첨가하여 선명한 환이 형성되는 균주를 선별하였다. 이와 같은 방법으로 선별되어진 균주 P38-10을 SDS-PAGE gel로 발현을 확인하였고, 파파인의 정량 분석방법을 통하여 활성을 측정하였다. 개량형 파파인의 발현액에 음이온성 고분자 물질을 일정하게 첨가하여 매 5시간마다 활성을 측정하였다. 이결과 개량형 파파인의 경우 wild type에 비해 10-15배의 활성과 안정성을 유지하는 것으로 확인하였다.

• 응용통계연구
• /
• 제29권3호
• /
• pp.437-448
• /
• 2016

서로 상관있는 유전자들의 발현조절이 질병이나 종양의 발생에 영향을 미치기 때문에 단일유전자 분석 대신 공통의 생물학적 요소를 지닌 유전자 집단 분석이 각광을 받게 되었고 생물학적으로 좀더 설명하기 쉬운 결과를 얻게 되었다. 표현형에 따라 유의한 차이를 보이는 유전자 집단을 찾는 여러 방법들이 있지만, 대부분의 방법들이 집단에 속한 유전자들의 표현형에 따른 발현의 차이를 탐색하거나 유전자들 사이의 공발현 구조가 다른지 탐색하는 것이다. 본 연구에서는 특이발현과 특이공발현의 차이를 모두 고려하는 탐색방법을 제시하였고 p53이란 유전자 자료와 모의자료를 이용하여 제시한 방법의 성능을 알아 보았다.

• 생물환경조절학회지
• /
• 제4권1호
• /
• pp.1-8
• /
• 1995

One of the most destructive forces around greenhouses is wind. Wind loads can be obtained by multiplying velocity pressure by dimensionless wind force coefficient. Generally, wind force coefficients can be determined by wind tunnel experiments. The wind force coefficient distribution on a single - span arched greenhouse was estimated using experimental data and compared with reported values from various countries. The results obtained are as follows : 1. The coefficients obtained from this study agree with the values proposed by G. L. Nelson except about 0.5 of difference in the middle region of roof section. This discrepancy is mainly attributed to the dissimilarity of experimental conditions (or wind tunnel test such as Reynolds number, type of terrain, surface roughness of model, location of the lapping and measuring methods. 2. Considering that the wind force coefficients are varied along the height of a wall at wind direction perpendicular to wall, structural analysis using subdivided wind force coefficient distribution is more resonable for wall. 3. It is recommendable that wind force coefficient distribution on a roof should take more subdivision than the existing four equal divisions for more accurate structural design. 4. Structural design using wind forces close to real values is more advantageous in safety and expense.

• 생물정신의학
• /
• 제14권1호
• /
• pp.14-20
• /
• 2007

Objectives : The diagnosis of depression is based on a highly variable set of symptoms. Therefore, depression should not be viewed as a single disease, but a heterogenous syndrome comprised of different pathophysiologies. There are several subtypes of depression which were already incorporated in DSM-IV. This article provides a systematic review of pharmacological treatments of two recognized subtypes of depression-dysthymic disorder and atypical depression. Methods : Systematic search of relevant literatures on dysthymic disorder and atypical depression was performed by proposed search strategy of the Clinical Research Center for Depression of Korean Health 21 R&D Project. All identified literatures were carefully reviewed and classified according to SIGN grading system and summarized in a narrative manner. Results : For the treatment of dysthymic disorder and atypical depression, selective serotonin reuptake inhibitors( SSRIs) and moclobemide have more evidence than the other antidepressants. SSRIs and moclobemide showed superior tolerability than tricyclic antidepressants. Conclusions : The authors proposed treatment recommendations for dysthymic disorder and atypical depression by the methods of evidence-based medicine(EBM). However, guideline developing methods of EBM also have several inevitable limitations. Therefore, in the absence of clear and significant differences in efficacy, the choice of medication must be individualized for a particular patient based on psychiatrist's own clinical decision.

• 대한수의학회지
• /
• 제34권2호
• /
• pp.267-273
• /
• 1994

Feces samples, obtained from zoo animals around Seoul, were examined for the isolation of Salmonella species, bioserotype and drug resistance for the prevention and treatment of salmonellosis, Salmonella spp were isolated 19(4.7%) from 408 samples of zoo animals. The subspecies in 19 Salmonella were all subspecies 1. The serological identification of Salmonella isolated were 31.6% in Sal typhimurium, 26.3% in Sal hadar, 21.1% in Sal muenchen, 15.8% in Sal enteritidis and 5.3% in Sal ayinde. The antibiotic resistance of Salmonella isolated were 13(68.4%) strains. The multiple resistant patterns of antibiotics in Salmonella were 2 drugs- and 3 drugs-resistance 30.8% respectively. The transferred rate of resistance to recipients(E coli ML 1410 $NA^r$) in Salmonella was 38.5%.

• 한국기계가공학회지
• /
• 제17권1호
• /
• pp.48-56
• /
• 2018

Due to the growing concerns of energy resource depletion and environmental destruction, the mass production of microalgae has been studied. The scale-up of a photobioreactor (PBR) is required for the mass production of biomass. In this paper, the geometric parameters and oxygen transfer rate (OTR) are considered, to scale up a flat panel photobioreactor (FP PBR). The PBR is designed using the goal-driven optimization (GDO) method to accomplish the scale-up. The local sensitivity of each output parameter with respect to the input parameter is analyzed through the design of experiment (DOE), and the design candidates are evaluated with the screening sampling method. The volumetric mass transfer coefficient is measured by the dynamic method.