• Title/Summary/Keyword: 뷰어

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Web-based microarray analysis using the virtual chip viewer and bioconductor. (MicroArray의 직관적 시각적 분석을 위한 웹 기반 분석 도구)

  • Lee, Seung-Won;Park, Jun-Hyung;Kim, Hyun-Jin;Kang, Byeong-Chul;Park, Hee-Kyung;Kim, In-Ju;Kim, Cheol-Min
    • Proceedings of the Korea Inteligent Information System Society Conference
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    • 2005.05a
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    • pp.198-201
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    • 2005
  • DNA microarray 칩은 신약 개발, 유전적 질환 진단, Bio-molecular 상호작용 연구, 유전자의 기능연구 등 폭넓게 사용되고 있다. 이 논문은 cDNA mimcroarray 데이터를 분석하기 위한 웹형태의 시스템 개발에 대한 내용을 다룬다. 하나의 cDNA microarray에는 수 백에서 수 만개의 유전자가 심어져 있으며, 데이터를 분석할 때 대량의 데이터와 다양한 형태의 오류로 인해서 데이터간의 차이를 보정하는 분석 도구와 통계적 기법들이 사용되어야 한다. 본 논문에서는 가상 칩 뷰어를 이용하여 실제 microarray 데이터의 foreground intensity에서 백그라운드의 intensity를 제거하여 일반화된 칩 이미지를 생성한다. 이 가상 칩 뷰어는 여러 가지 필터효과와 서로 다른 두 형광의 차이를 조정하는 global normalization 기법을 사용하여 발현 유전자 분석을 시각적으로 할 수 있고, 중복된 마이크로어레이 칩 데이터를 통하여 시간이 많이 걸리는 분석전 칩의 유효성을 검토할 수 있다. 칩 데이터의 normalization을 위한 통계 방법으로 R 통계 도구와 linear 모델을 사용하여 microarray 칩의 유전자 발현 양상을 분석한다. 통계적 방법을 사용하지 않은 데이터를 추출, 이 데이터의 패턴 그래프 그리고 발현 레벨을 분류하여 마이크로어레이의 각 스팟의 유효성 검토의 정확성을 높였다. 이 시스템은 칩의 유효성 검토, 스팟의 유효성 검토, 유전자 선정에 대해 분석의 용이성과 정확성을 높일 수 있었다.

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The Image Summarization Algorithm for Reviewing the Virtual Reality Experience (가상현실 경험을 복습시켜주는 사진 정리 알고리즘)

  • Kwak, Eun-Joo;Cho, Yong-Joo;Cho, Hyun-Sang;Park, Kyoung-Shin
    • The KIPS Transactions:PartB
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    • v.15B no.3
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    • pp.211-218
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    • 2008
  • In this paper, we proposed a new image summarization algorithm designed for automatically summarizing user's snapshot photos taken in a virtual environment based on user's context information and educational contents, and then presenting a summarized photos shortly after user's virtual reality experience. While other image summarization algorithms used date, location, and keyword to effectively summarize a large amount of photos, this algorithm is intended to improve users' memory retention by recalling their interests and important educational contents. This paper first describes some criteria of extracting the meaningful images to improve learning effects and the identification rate calculations, followed by the system architecture that integrates the virtual environment and the viewer interface. It will also discuss a user study to model the algorithm's optimal identification rate and then future research directions.

Comparison of the Quality of Clavicle Fracture Three-dimensional Model Printing by Open Source and Commercial use Digital Imaging and Communications in Medicine Stereolithography File Conversion Program (공개용과 상업용 DICOM STL 파일변환 프로그램으로 출력한 삼차원 프린팅 쇄골 골절 모델의 품질비교)

  • Oh, Wang-Kyun;Kim, Hyeong-Gyun
    • Journal of radiological science and technology
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    • v.41 no.1
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    • pp.61-66
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    • 2018
  • The recent 3D printing technology is used in various medical, manufacturing, and education fields and is more efficient in terms of production process, time, and cost than existing production. Especially in fracture surgery, interest and research have been focused on improving accuracy, shortening of operation time and recovery time, and reducing reoperation. However, because of the financial and technical problems of the 3D printer and the file conversion program, the 3D printing is made directly at the hospital, and it is not generally used for diagnosis of fracture and surgical research. In this study, to solve those problems, clavicle CT imaging was switched into Osirix Open Source DICOM Viewer, Stereolithography file conversion programs and commercial Terarecon 3D DICOM Viewer, file conversion programs, and then clavicle fracture model was directly made through 3D printer of fused filament fabrication wire additive processing method, and then the accuracy of the shape was compared and analyzed. Clavicle fracture models printed in two methods were blind-tested on clinicians of general hospitals' orthopedics and radiologic technicians with over 10 years of experiences, and then their analysis opinions of resolution reviews were analyzed. The result showed no difference. The 3D printing model with open source DICOM STL file conversion program used was applicable to clinical, so it is considered useful in precision diagnosis of fracture and operation plans.

Implementation of User Interface for Geo-spatail Information Processing Toolkit using Open Source-based PostGIS (공개소스 PostGIS 기반 공간정보 처리 툴 킷 사용자 인터페이스 구현)

  • Han, Sun-Mook;Lee, Ki-Won
    • Korean Journal of Remote Sensing
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    • v.25 no.2
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    • pp.185-192
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    • 2009
  • Recently, open sources for geo-spatial information processing and analysis are being developed, and they are widely adopted for the various application development projects. Open sources in the geo-spatial communities consist in several levels or types: viewer, API-level, engine sources of SDK-level, or toolkits. Among them, spatial database engine of PostgreSQL-PostGIS is used in this study for the portable multi-geospatial information processing toolkit. This work can be extended to target-based applications with domain-specific spatial queries and analyses. Design and implementation are based on C Language Interface (LIBPQ) to PostGIS and OGC library on PostgreSQL database. Conclusively, PostGIS according to this approach is an important alternative to develop most applications dealing with multi-geospatial information due to its availability, extensibility, scalability, and stability.

A Study on the Method of Extracting Shape and Attribute Information for Port IFC Viewing (항만 IFC Viewing을 위한 형상 및 속성 정보 추출 방법에 관한 연구)

  • Kim, Keun-Ho;Park, Nam-Kyu;Joo, Cheol-Beom;Kim, Sung-Hoon
    • Journal of KIBIM
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    • v.11 no.3
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    • pp.67-74
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    • 2021
  • An IFC file is dependent on the IFC schema. Because of this relationship, most IFC-using software reads and interprets the IFC File by employing an early binding method, which uses a standard IFC schema. In the case of most open sources, early binding methods using standard IFC schema have a problem that they cannot express extra information of IFC File out of extended IFC schema. Also, in the case of previous studies, they suggested schema extension, such as adding attribute information to the schema, rather than the interpretation of IFC File. This study research on method of extracting shape and attribute information was conducted by analyzing the IFC File produced through the Port schema, which is an extended IFC schema. Three objects were created using the reference relationship between the Port schema definition and the IFC entity, and, at the end, the three objects were combined into one object. It has been confirmed that the shape and property data were express properly while delivering the combined object to the viewer. The process is possible because of the method of matching IFC schema and IFC File, which is dependent on IFC schema but not early binding method. However, this method has some drawbacks, such that contemporaneously generated many objects consume many memory spaces. Future research to investigate that issue further is needed.

Implementation of Video Signal Delivery Protocols for the Camera Device via the Internet (인터넷을 통한 카메라 디바이스의 영상신호 전달 프로토콜 구현)

  • Lee, Ji-Hoon;Chung, Hae;Baek, Bong-Ki;Jo, Young-Rae
    • Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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    • v.25 no.5
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    • pp.691-700
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    • 2021
  • The IP cameras have rapidly replaced the analog CCTVs as the cameras have the advantages of not only being able to remotely monitor, but also supplying power through the UTP cable, In this paper, we introduce the protocol architecture of the ONVIF standard which is widely applied to the IP camera and other Internet protocols to support it, and implement the ONVIF Device on a commercial board. Although these functions can be controlled by the Client (PC), several functions such as privacy masks, temperature display of the thermal camera, and ROI (Region of Interest) are implemented through a web viewer on the device. Through the experiment, the functions of ONVIF Profile S and web viewer are verified through SOAP messages exchanged between Device (IP camera) and Client program and streamed images.

Interactive Interface Design Through VR Hand Tracking (VR 핸드트레킹을 통한 상호작용 인터페이스 설계)

  • Ju-Sang Lee;Hyo-Seung Lee;Woo-Jun Choi
    • The Journal of the Korea institute of electronic communication sciences
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    • v.18 no.1
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    • pp.213-218
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    • 2023
  • In order to use the VR HMD, operation through separate controllers in both hands is required. Methods for text input in VR include a method of selecting virtual keyboard keys on the screen one by one using a controller, a method of inputting through a keyboard that is a resource of a computer by connecting a computer and VR, or a method of inputting through a keyboard that is a resource of a computer by purchasing a wireless keyboard in VR and wireless keyboard connection method. As such, the text input method in current VR equipment causes inconvenience and additional costs to users. For these reasons, most of the VR-related contents are limited to simple functions such as games or viewers, and there is a risk that VR equipment will be recognized as a simple game machine. Therefore, in this study, a multi-input interface using hand tracking provided by the Oculus Quest2 device is designed and partially implemented. Through this, it is expected that various tasks such as document work and business processing as well as games can be conveniently used using VR equipment.

AndroidTurboVNC Viewer for 3D Design (3D 디자인을 위한 안드로이드 TurboVNC 뷰어)

  • Kim, Tae-Hun;Choi, Jong-Chan;Lee, Jeong-Joon
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2011.04a
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    • pp.1135-1138
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    • 2011
  • 안드로이드 시장이 급성장함에 따라 안드로이드 기반 어플리케이션에 대한 수요가 많아지고 있다. 그로 인해 3D 그래픽적 기능을 요구하는 어플리케이션에 대한 요구도 늘어났다. 그러나 안드로이드 단말기에서는 3D 처리능력이 데스크 탑과 비교하여 성능과 서비스에 한계가 있다. 그렇기 때문에 VNC(Virtual Network Computing)를 사용하여 고성능의 그래픽을 요구하는 프로그램을 실행할 수 있게 된다. VNC 란 클라이언트에서 데스크 탑으로 접속하여 원격으로 제어하고 그 결과를 그래픽으로 확인하는 프로그램이다. 그러나 기존의 Android VNC 는 해상도가 낮고, 이미지 전송 속도가 느리기 때문에 3D 렌더링 이미지 처리가 불가능했다. 또한 Android VNC 는 인터페이스가 불편하여 입력 오류가 많아 사용이 불편했다는 단점 등이 지적되어 왔다. 본 논문에서는 이를 개선하기 위한 Android Turbo VNC 를 제안한다. Android Turbo VNC는 libjpeg-turbo 코덱을 적용하여 3D 이미지 부분에서 기존의 Android VNC 에 비하여 약 80~120%의 이미지 개선과 이미지 압축률을 4 배정도 높여 CAD 와 같은 고성능의 그래픽을 요구하는 프로그램의 사용을 가능하게 한다. 그리고 Android Turbo VNC 에서는 기존 Android VNC 의 불편한 UI 를 개선하였다. 클라우드 서버에서는 CAD, Document, Game, Video, General 총 5 가지의 프로그램을 서비스하여 그에 맞는 테마 별 UI 를 제공한다. libjpeg-turbo 코덱의 적용을 통해 Android-Turbo VNC 는 수십 장의 설계 도면을 굳이 들고 다니지 않더라도 하나의 테블릿 PC 안에서 보는 것이 가능하게 된다. 테마별 UI 중 CAD 테마는 3D CAD 를 사용하는 산업현장에서 적극적으로 활용될 것으로 기대된다.

Construction of Web-Based Medical Imgage Standard Dataset Conversion and Management System (웹기반 의료영상 표준 데이터셋 변환 및 관리 시스템 구축)

  • Kim, Ji-Eon;Lim, Dong Wook;Yu, Yeong Ju;Noh, Si-Hyeong;Lee, ChungSub;Kim, Tae-Hoon;Jeong, Chang-Won
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2021.05a
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    • pp.282-284
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    • 2021
  • 최근 4차 산업혁명으로 의료빅데이터 기반으로 한 AI 기술이 급속도로 발전하고 있다. 특히, 의료영상을 기반으로 병변을 탐색, 분활 및 정량화 그리고 자동진단 및 예측 관련된 기술이 AI 제품으로 출시되고 있다. AI 기술개발은 많은 학습데이터가 요구되며, 임상검증에 단일기관에서 2개 이상 기관의 검증이 요구되고 있다. 그러나 아직까지도 단일기관에서 학습용 데이터와 테스트, 검증용 데이터를 달리하여 기술개발에 활용하고 있다. 본 논문은 AI 기술개발에 필요한 영상데이터에 대한 표준화된 데이터셋 변환 및 관리를 위한 시스템에 대해 기술한다. 다기관 데이터를 수집하기 위해서는 각 기관의 의료영상 데이터 수집 및 저장하는 기준이 명확하지 않아 표준화 작업이 필요하다. 제안한 시스템은 기관 또는 다기관 연구 그룹의 의료영상데이터를 표준화하여 저장할 수 있을 뿐만 아니라 의료영상 뷰어 및 의료영상 리스트를 통해 연구자가 원하는 의료영상 데이터 셋을 검색하여 다양한 데이터셋으로 제공할 수 있기 때문에 수집 및 변환 그리고 관리까지 지원할 수 있는 시스템으로 영상기반의 머신러닝 연구에 활력을 불어넣을 수 있을 것으로 기대하고 있다.

Estimation of Total Cloud Amount from Skyviewer Image Data (Skyviewer 영상 자료를 이용한 전운량 산출)

  • Kim, Bu-Yo;Jee, Joon-Bum;Jeong, Myeong-Jae;Zo, Il-Sung;Lee, Kyu-Tae
    • Journal of the Korean earth science society
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    • v.36 no.4
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    • pp.330-340
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    • 2015
  • For this study, we developed an algorithm to estimate the total amount of clouds using sky image data from the Skyviewer equipped with CCD camera. Total cloud amount is estimated by removing mask areas of RGB (Red Green Blue) images, classifying images according to frequency distribution of GBR (Green Blue Ratio), and extracting cloud pixels from them by deciding RBR (Red Blue Ratio) threshold. Total cloud amount is also estimated by validity checks after removing sunlight area from those classified cloud pixels. In order to verify the accuracy of the algorithm that estimates total cloud amount, the research analyzed Bias, RMSE, and correlation coefficient compared to records of total cloud amount earned by human observation from the Gangwon Regional Meteorological Administration, which is in the closest vicinity of the observation site. The cases are selected four daily data from 0800 LST to 1700 LST for each season. The results of analysis showed that the Bias in total cloud amount estimated by the Skyviewer was an average of -0.8 tenth, and the RMSE was 1.6 tenths, indicating the difference in total cloud amount within 2 tenths. Also, correlation coefficient was very high, marking an average of over 0.91 in all cases, despite the distance between the two observation sites (about 4 km).