• Title/Summary/Keyword: 분자 구조의 이해

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Development of Convergence Education Program for 'Understanding of Molecular Structure' using Machine Learning Educational Platform (머신러닝 교육 플랫폼 활용 '분자 구조의 이해'를 위한 융합교육 프로그램 개발)

  • Yi, Soyul;Lee, Youngjun
    • Journal of The Korean Association of Information Education
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    • v.25 no.6
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    • pp.961-972
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    • 2021
  • In this study, an educational program was developed so that artificial intelligence could be used as a transdisciplinary convergence education with other disciplines. The main educational content is designed for 8 hours using machine learning to help students understand the molecular structure dealt with in high school chemistry. The program developed in this study calculated the I-CVI (Item Content Validity Index) value through expert review, and as a result, none of the items were rejected with a score of .80 or higher. Because the program of this study combines the content elements of the chemistry subject and the information (artificial intelligence) subject academically, it is expected that the learner will be able to increase the convergence talent literacy. In addition, since it is not required to secure a additional number of hours for this educational program, the burden on teachers may be low.

Genomic Sequence alignments and its application for Computing Linear Structure Similarity

  • 조환규;황미녕;강은미;이미경
    • Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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    • 2002.06a
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    • pp.64-88
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    • 2002
  • 생물체의 유전자 서열들간의 유사성을 서로 비교해보는 일은(sequence alignment)는 분자생물학 연구에서 아주 기본적인 작업에 속한다. 이 작업은 컴퓨터 과학적 입장에서 살퍼보면 일종의 스트링 분석작업인데, 그 과정에는 매우 복잡한 생물학적인 가정이 내포되어 있다. 본 발표의 목적은 크게 두가지인데 하나는 컴퓨터과학 연구자들에게 서열정렬(sequence alignment)이 가지는 분자생물학적 의미에 대하여 개략적인 이해를 돕도록 하는 것이며, 다른 한편으로 분자생물학자들에게는 스트링처리방법을 이용한 서열정렬 문제에서 어떤 기술적인 한계가 있으며 그 한계를 극복하기 위한 새로운 방법론에 대하여 소개하여 컴퓨터과학적 이해의 폭을 넓히는 것이다. 그리고 생물체의 서열정보의 정렬과 매우 유사한 개념으로 각종 선형구조체(linear object)를 추상화 할 수 있른데, 그들간의 유사성도 같은 분자생물학적 방법론을 차용하여 분석할 수 있음을 보인다. 동시에 이것을 이용하여 각종 인터넷 문서나 프로그램, 등의 표절과 무단도용 등을 추적할 수 있는 방법론을 기존의 genomic sequence alignment tool을 차용해서 매우 효율적으로 할 수 있음을 보인다.

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Development of a browser for signal transduction network to simulate biochemical reaction in a cell (생체내 반응 시뮬레이션을 위한 신호전달 네트워크 브라우저 개발)

  • Yu, Seok Jong;Lee, Sang Joo
    • Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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    • 2007.11a
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    • pp.539-542
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    • 2007
  • After introducing some experiment methods including immunoprecipitation and yeast two-hybrid screening, the pool of molecular interaction data is growing fast and databases are produced dramatically. But it is difficult to apply the information to molecular kinetic studies for understanding disease. In this paper, we developed a program that can browse and visualize interactions of cellular molecules using importing heterogeneous external data file. This program support 3D view to navigate and understand more easily and making a signal transduction model that user wants and simulating function to research the model. It was tested for signal transduction of chmotaxis in bacteria.

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Na Borosilicate Glass Surface Structures: A Classical Molecular Dynamics Simulations Study (소듐붕규산염 유리의 표면 구조에 대한 분자 동역학 시뮬레이션 연구)

  • Kwon, Kideok D.;Criscenti, Louise J.
    • Journal of the Mineralogical Society of Korea
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    • v.26 no.2
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    • pp.119-127
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    • 2013
  • Borosilicate glass dissolution is an important chemical process that impacts the glass durability as nuclear waste form that may be used for high-level radioactive waste disposal. Experiments reported that the glass dissolution rates are strongly dependent on the bulk composition. Because some relationship exists between glass composition and molecular-structure distribution (e.g., non-bridging oxygen content of $SiO_4$ unit and averaged coordination number of B), the composition-dependent dissolution rates are attributed to the bulk structural changes corresponding to the compositional variation. We examined Na borosilicate glass structures by performing classical molecular dynamics (MD) simulations for four different chemical compositions ($xNa_2O{\cdot}B_2O_3{\cdot}ySiO_2$). Our MD simulations demonstrate that glass surfaces have significantly different chemical compositions and structures from the bulk glasses. Because glass surfaces forming an interface with solution are most likely the first dissolution-reaction occurring areas, the current MD result simply that composition-dependent glass dissolution behaviors should be understood by surface structural change upon the chemical composition change.

Transcriptional Regulatory System by CRP (CRP의 전사 조절계)

  • 최용락
    • Journal of Life Science
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    • v.2 no.1
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    • pp.2-10
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    • 1992
  • cAMP-CRP complex에 의해 전사조절을 받는 관련유전자의 구조, 특징, 조절양상, 기작과 CRP의 생화학적 및 분자생물학적이해 등을 살폈다. 그러나 대장균의 전체유전자의 구조해석이 연구사업으로 실행되어지고 있는 현실에서 볼 때 CRP의 조절하에 있는 유전자군이 보다 더 복잡 다양한 system으로 생각되어져서 CRP조절계의 전체적인 양상으로 해명하기 위한 연구도 이루어질 것으로 생각되어진다. 즉, cAMP-CRP의 조절하에 있는 조절영역의 전체를 파악함은 operon의 발현조절의 해명에 중요한 기틀이 될 뿐만 아니라 개별유전자의 이해를 위한 것보다 복잡한 세포 전체의 제어계를 분자적수준에서 해결하는데 중요한 과제라고 사료되어진다. 몇 가지 연구 결과에서는 cAMP-CRP가 결합은 하면서도 발현조절에는 관여하지 않는다든지, cAMP가 결합하지 않으면서도 전사조절을 받을 수 있는 유전자들이 밝혀지고 있다.

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다양한 구조체 내에서의 고분자 구조분석

  • Lee, Jeong-Min;Kim, Won-Tae;Jang, Rak-U
    • Proceeding of EDISON Challenge
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    • 2015.03a
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    • pp.61-69
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    • 2015
  • 나노과학에 대한 다양한 실험적 연구와 이론적 연구가 활발해지고 전문화 되어감에 따라 나노물질에 대해 연구하는 것은 더욱 중요해지고 있는 추세이다. 현재 고분자 나노물질들은 코팅, 광전자 부품, 자기 매체, 세라믹 등에 활발하게 이용되고 있으며 그 활용 범위가 더 커질 것으로 전망된다. 지난 몇 년간 사각기둥 형태의 구조체 내부에서 존재하는 고분자의 움직임에 대한 연구는 다양하게 진행되어왔다. 그러나 고분자들을 더욱 유용하게 응용하여 이용하기 위해서는 나노입자 기술과 연결시켜 보다 다양한 환경에서의 고분자의 상태를 자세하게 이해해야 할 필요가 있다. 고분자 물질에 대한 이론적 연구는 주로 계산이 용이한 거시적인 모델인 코스그레인(Coarse-grained) 모델을 이용한 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 이루어져왔다. 본 연구에서도 에디슨 서버에 탑재된 코스그레인 모델을 이용한 분자 모델링 시뮬레이션을 통해 제한된 공간 안에서 다양한 구조체들의 내부에서 고분자의 구조를 계산하고, 시뮬레이션의 결과값과 Flory의 공식을 이용한 이론적인 계산값이 얼마나 잘 맞아 떨어지는지에 대해 알아보고자 한다.

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Students' Comprehension and Interpretation Process of InscriptionsRepresenting the Concept of Atom and Molecule (원자 및 분자 개념을 표상한 시각자료에 대한 중학생들의 이해 및 해석 과정)

  • Noh, Tae-Hee;Yoon, Mi-Suk;Han, Jae-Young
    • Journal of the Korean Chemical Society
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    • v.53 no.3
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    • pp.355-367
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    • 2009
  • In this study, the 9th grade students were interviewed to explore their comprehension and interpretation processes of inscriptions representing the concept of atom and molecule. We used a semiotic model for the interview and the analysis of result. The research result revealed that the students performed structuring processes of interpreting inscriptions successfully, but they had a difficulty with translating processes for attaining the target concept or for connecting an inscription with another inscription. Translating processes of connecting inscription with text showed a different result according to achievement level of each student. On the other hand, all the interviewees showed similar sequences in the processes of interpreting inscriptions. Educational implications of these findings were discussed.

STM Study of Self Assembled Monolayer Formed from Binary Mixtures of Substituted Alkyl Chains (치환된 알킬 사슬 혼합물의 자기조립 단분자막 구조지 STM 연구)

  • Son S.B.;Lee H.;Jeon I.C.;Hahn J.R.
    • Journal of the Korean Vacuum Society
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    • v.15 no.2
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    • pp.145-151
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    • 2006
  • The molecular assembly of p-iodo-phenyl octadecyl ether (I-POE), p-iodo-phenyl docosyl ether (I-PDE) and a binary mixture of these two molecules on graphite has been studied using a scanning tunneling microscope. Each molecular system self-assembles on the graphite surface to form a stable monolayer with a head-to-tail configuration. For the binary system, the I-POE and I-PDE molecules do not mix on the surface, preferring instead to form isolated monolayer domains. Here, the I-POE molecules are preferentially adsorbed on the graphite surface, due to the effects of alkyl chain length and the functional group on the monolayer structure.

Study on the Characteristics of the AlAS/GaAs Epitaxial Layers Grown by Molecular Beam Epitaxy (분자선에피택시성장법으로 성장한 AlAS/GaAs 에피택셜층의 특성)

  • No, Dong-Wan;Kim, Gyeong-Ok;Lee, Hae-Gwon
    • Korean Journal of Materials Research
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    • v.7 no.12
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    • pp.1041-1046
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    • 1997
  • 본 연구에서는 분자선 에피택시 방법으로 비대칭 AIAs/GaAs(001)이중 장벽, 삼중장벽구조를 성장한 수 이를 이용하여 2단자 소자를 제작하여 전기적 특성을 분석하였다. 에피층은 쌍결정 X-ray회절 분석과 단면투과 전자현미경을 이용하여 결정성 및 격자 정합성을 확인하였다. 전기적 성능을 보다 향상시키기 위해 n-GaAs에 대한 오믹 접촉등의 소자 제작 공정을 최적화하였다. 삼중장벽 구조를 이용하여 제작한 소자의 전기적 특성 연구 결과 두개의 주요 공진 터널링 전류 피크 사이에 X-valley에 의한 구조를 확인할 수 있었으며, 이중 장벽구조에 제2의 양자우물 구조를 첨가함으로써 낮은 전압위치에서 전류 피크가 향상하는 결과를 얻었다.

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Pre-Service Chemistry Teachers' Awareness of Visually Impaired Students' Learning Situation through Scientific Inquiry about Molecular Structure of Ice in Darkroom (얼음의 분자구조에 대한 암실 속 과학탐구 활동에서 시각장애학생의 학습상황에 대한 예비 화학교사들의 인식)

  • Kim, Hak Bum;Cha, Jeongho
    • Journal of the Korean Chemical Society
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    • v.61 no.5
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    • pp.277-285
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    • 2017
  • The purpose of this study is to investigate the perspective of pre-service chemistry teachers on the learning situations of visually impaired students through scientific inquiry in a darkroom and to propose a teaching and learning method for students with visual impairments. Twenty-one pre-service chemistry teachers from college of education in Gyeongbuk were encouraged to explore individually hands-on model for the molecular structure of ice freely, and had a discussion with a one of the researchers during the activity. All the conversation and discussion were audio-taped and transcribed for analysis. As a result, pre-service chemistry teachers realized that learning situation of the visually impaired students was quite different with their perception while exploring and figuring out hands-on model of the molecular structure of ice in the darkroom. They already learned and could see this model by themselves but also recognized that visually impaired students had inconvenience and difficulty in learning science concepts. Based on these reflections, some pre-service chemistry teachers suggested directions for modification to fit visually impaired students' needs more.