• Title/Summary/Keyword: 분자생물학적 방법

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Genomic Sequence alignments and its application for Computing Linear Structure Similarity

  • 조환규;황미녕;강은미;이미경
    • Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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    • 2002.06a
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    • pp.64-88
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    • 2002
  • 생물체의 유전자 서열들간의 유사성을 서로 비교해보는 일은(sequence alignment)는 분자생물학 연구에서 아주 기본적인 작업에 속한다. 이 작업은 컴퓨터 과학적 입장에서 살퍼보면 일종의 스트링 분석작업인데, 그 과정에는 매우 복잡한 생물학적인 가정이 내포되어 있다. 본 발표의 목적은 크게 두가지인데 하나는 컴퓨터과학 연구자들에게 서열정렬(sequence alignment)이 가지는 분자생물학적 의미에 대하여 개략적인 이해를 돕도록 하는 것이며, 다른 한편으로 분자생물학자들에게는 스트링처리방법을 이용한 서열정렬 문제에서 어떤 기술적인 한계가 있으며 그 한계를 극복하기 위한 새로운 방법론에 대하여 소개하여 컴퓨터과학적 이해의 폭을 넓히는 것이다. 그리고 생물체의 서열정보의 정렬과 매우 유사한 개념으로 각종 선형구조체(linear object)를 추상화 할 수 있른데, 그들간의 유사성도 같은 분자생물학적 방법론을 차용하여 분석할 수 있음을 보인다. 동시에 이것을 이용하여 각종 인터넷 문서나 프로그램, 등의 표절과 무단도용 등을 추적할 수 있는 방법론을 기존의 genomic sequence alignment tool을 차용해서 매우 효율적으로 할 수 있음을 보인다.

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Digit Recognition by Molecular Immunocomputing (분자 면역 컴퓨팅에 의한 숫자 인식)

  • 김수동;신기루;장병탁
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2003.04c
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    • pp.274-276
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    • 2003
  • 신경과학이 발전함에 따라 기억현상의 분자생물학적, 세포생물학적 메커니즘이 밝혀지고 있으며, 신경계의 특징을 계산학적 측면으로 응용한 신경망 분야는 상당한 연구성과가 축적되어 하나의 학문 분야로까지 자리매김하고 있다. 면역학이 발전함에 따라 연역현상의 분자생물학적, 세포생물학적 메커니즘이 밝혀지고 있으며, 특히 연역기억현상의 산물인 항체를 이용한 설러 가지 생물학적 실험 방법이 고안되어 사용되고 있는 한편, 연역 현상의 특징을 계산학적 측면으로 응용하려는 다양한 시도가 근래 이루어지고 있다. 본고에서는 항원과 항체 분자를 이용한 면역생물학적 실험 방범을 적용하여 문자, 인식 문제를 해결하는 분자 면역 컴퓨팅의 개념을 도입하고, 이 개념을 도입하여 숫자를 인식하는 문제에 적용하는 사례를 제시하였다.

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Detection of Waterborne Pathogens in Public Bath Houses by PCR-Reverse Blot Hybridization Assay (PCR-REBA) (분자생물학적 방법인 PCR-REBA를 이용한 대중목욕탕 수질 중 수인성병원성미생물 검출)

  • Song, Woon-Heung;Choi, Seung-Gu;Yang, Byoung-Seon;Lee, Jae-Sang
    • Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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    • v.12 no.8
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    • pp.3517-3522
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    • 2011
  • Contamination of public bath water by waterborne pathogens can cause disease outbreaks and contribute to background rates of disease. The aim of this study is to determine the prevalence of waterborne pathogens in public baths. A total of 30 water samples were collected from 30 different public baths in seoul, Korea. Pathogens in water samples were concentrated by 0.45 ${\mu}m$ nitrocellulose membrane filter, analyzed by both cultivation and polymerase chain reaction-reverse blot hybridization (PCR-REBA) of partial 16S rRNA gene. Various microorganisms including Escherichia coli and Shigella spp. were identified by microbiological cultivation. E. coli, Shigella spp., Salmonella spp., Pseudomonas spp. and Mycobacterium spp. were identified by PCR-REBA. Our results suggest that appropriate hygiene practice and continuous monitoring is needed for reducing health risk associated with public bath houses.

MR 분자영상용 후보물질의 탐색: 예비연구

  • 박지애;장용민;강봉석;이종민;강덕식
    • Proceedings of the KSMRM Conference
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    • 2003.10a
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    • pp.36-36
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    • 2003
  • 목적: 고형성 종양에 특이적으로 발현하는 MR 분자영상용 조영제의 후보물질을 분자생물학적 방법 및 in vitro 분자영상기법을 이용하여 탐색하고자 하였다. 대상 및 방법: 암이 진행됨에 따라 유전자가 과발현되는 세포표면 단백질인 CD44 와 세포막에 존재하는 단백질분해효소의 일종인 MTI-MMP를 일차 선정하여 유전자 수준 및 단백질 수준에서 분자생물학적 방법으로 종양특이성에 대해 검증하였고, 특히 각종 암세포에서 발현양이 증가하는 CD44의 변형인 CD44v6 항체를 이용하여 생세포에서의 표적화에 대한 광학적 검증을 위해 초상자성 나노입자 대신 형광입자(FITC)를 결합하여 confocal microscopy로 실시간 표적화에 대한 분자영상을 획득하였다.

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The Molecular Biological Marker in Bombyx mori and Spodoptera frugiperda Cells (Bombyx mori세포주와 Spodoptera frugiperda세포주의 분자생물학적 표식자)

  • Jin, Byeong-Rae;Je, Yeon-Ho;Gang, Seok-Gwon
    • Journal of Sericultural and Entomological Science
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    • v.38 no.1
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    • pp.53-56
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    • 1996
  • To investigate the molecular biological marker in insect cells, BmN-4 and Sf-0 cells were analysed by SDS-PAGE and random amplification of polymorphic DNA. The results showed that the patterns of total cell protein and random amplification of polymorphic DNA were distinguished between BmN-4 and Sf-9 cells, suggesting that the unique major bands were useful as molecular biological marker in BmN-4 and Sf-9 cells.

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