• Title/Summary/Keyword: 분자검출

Search Result 476, Processing Time 0.04 seconds

Detection of Waterborne Pathogens in Public Bath Houses by PCR-Reverse Blot Hybridization Assay (PCR-REBA) (분자생물학적 방법인 PCR-REBA를 이용한 대중목욕탕 수질 중 수인성병원성미생물 검출)

  • Song, Woon-Heung;Choi, Seung-Gu;Yang, Byoung-Seon;Lee, Jae-Sang
    • Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
    • /
    • v.12 no.8
    • /
    • pp.3517-3522
    • /
    • 2011
  • Contamination of public bath water by waterborne pathogens can cause disease outbreaks and contribute to background rates of disease. The aim of this study is to determine the prevalence of waterborne pathogens in public baths. A total of 30 water samples were collected from 30 different public baths in seoul, Korea. Pathogens in water samples were concentrated by 0.45 ${\mu}m$ nitrocellulose membrane filter, analyzed by both cultivation and polymerase chain reaction-reverse blot hybridization (PCR-REBA) of partial 16S rRNA gene. Various microorganisms including Escherichia coli and Shigella spp. were identified by microbiological cultivation. E. coli, Shigella spp., Salmonella spp., Pseudomonas spp. and Mycobacterium spp. were identified by PCR-REBA. Our results suggest that appropriate hygiene practice and continuous monitoring is needed for reducing health risk associated with public bath houses.

다층 그래핀 필름을 이용한 광섬유 방식 SPR 센서의 생체분자 검출 특성 분석

  • Kim, Jang-A;Kulkarni, Atul;Gang, Jun-Mo;Amin, Rashid;Choe, Jae-Bung;Park, Seong-Ha;Kim, Tae-Seong
    • Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
    • /
    • 2011.08a
    • /
    • pp.389-389
    • /
    • 2011
  • 최근 생체분자 구조 연구가 의료진단, 생명 현상 규명 및 의약품 개발 등 다양한 분야에 응용되고 있으나 대부분의 분석방법이 제한적이어서 새로운 기술 개발의 필요성이 증대하고 있다. 종래의 DNA 등의 생체분자의 분석은 형광염료를 이용한 방법이 주로 이용되었다. 형광염료는 단백질을 포함한 여러 물질들에 대해 반응하지 않기 때문에 분석에 제한이 있으며, 이와 같은 단점을 보완하는 방법으로 SPR (surface plasmon resonance) 분석법이 연구되었다. SPR은 형광염료 분석에 필수적인 레이블링(labeling) 등의 전처리 과정 없이 높은 민감도로 분석이 가능한 장점이 있다. 한편, 그래핀은 뛰어난 전자기적 성질과 기계적 성질 을 가지는 반금속(semimetal)으로, 실험실 규모에서 안정적인 합성이 실현되면서 그 응용 분야에 대한 연구가 활발히 이루어 지고 있다. 그래핀은 큰 표면적 대 부피비를 가지며, 이는 검출물질과의 반응성이 좋아야 하는 센서기술에 있어서 장점으로 작용한다. 특히, 비금속성을 띠는 단층 그래핀을 여러 장 겹치면 금속성을 갖게 되기 때문에 SPR 센서의 금속 필름으로 응용이 가능하다. 본 연구에서는 SPR 현상을 이용하는 광섬유 센서의 감도와 정확도를 증진시키기 위해 광섬유 표면에 그래핀을 적용하였다. 광섬유는 상부 피복과 클래딩을 제거하여 코어를 노출시킨 후, 다층 그래핀 필름을 코팅함으로써 검출부를 구성한다. 그 후, DNA-biotin 용액, DNA-biotin 용액, 그리고 Streptavidin 단백질 복합 용액에 대한 검출기 신호를 분석하였다. 구성된 센서에 각 용액을 1 ${\mu}{\ell}$ 씩 반응시켜 분광계로 파장에 따른 광강도를 측정하는 실험을 수행했으며, 450 nm에서 460 nm 범위의 푸른빛의 광원을 사용하였다. 그래핀 필름의 유무에 따라 확연히 구분되는 경향을 보이는 결과를 얻었고 그래핀 필름이 기존 SPR 센서의 금속박막을 대체 할 수 있음을 확인하였다.

  • PDF

복분자주의 품질 비교

  • 김경은;하현팔;정용진
    • Proceedings of the Korean Society of Postharvest Science and Technology of Agricultural Products Conference
    • /
    • 2003.10a
    • /
    • pp.163.2-164
    • /
    • 2003
  • 생약재로 사용되고 있는 복분자를 식품가공소재로 활용하고자 최적 추출조건에서 얻은 추출물로 복분자 리큐르를 제조하여 시판되고 있는 복분자주(A, B, C)와 성분을 비교하였다. 그 결과, 알콜함량은 복분자 리큐르와 B 제품이 15.6%로 나타났으며 A와 C 제품은 각각 13.2%와 14.0%로 분석되었다. 복분자 리큐르의 당도와 가용성 고형분 함량은 12.1 。 Brix와 6.18%로 B 제품과 유사하였으며 A 제품은 각각 18.2 。Brix와 14.93%로 가장 높게 나타났다. 총 페놀성 화합물은 143.77mg%인 B 제품이 가장 높게 분석되었으며 복분자 리큐르는 93.03mg%로 나타났고 전자공여능은 복분자 리큐르가 77%로 다른 제품(A, B, C)보다 가장 높게 분석되었다. 유리당 분석에서 복분자 리큐르와 A 제품은 glucose가 가장 높게 분석되었으며 fructose함량은 A와 B제품이 높게 나타났으며 galactose는 41.5mg%로 B 제품에서만 분석되었다. 알콜성분 비교 분석결과, acetaldehyde은 A 제품을 제외한 모든 복분자주에서 나타났으며 methanol은 C 제품이 47.25ppm으로 가장 낮게 분석되었고 iso-propanol은 복분자 리큐르와 B 제품만 나타났으며 n-propanol은 복분자 리큐르에서만 검출되었고 iso-amylalcohol은 복분자 리큐르를 제외한 A, B 및 C제품에서 모두 분석되었다. 이상과 같은 차이는 원료, 주류의 제조방법에 따른 것으로 나타났다.

  • PDF

Molecular holographic QSPR analysis on the reactivity between glycine and ninhydrin analogues as latent fingerprints detector (잠재지문 검출제로서 Ninhydrin 유도체들과 Glycine과의 반응성에 관한 분자 홀로그래픽적인 QSPR 분석)

  • Kim, Se-Gon;Jang, Seok-Chan;Cho, Yun-Gi;Hwang, Tae-Yeon;Park, Sung-Woo;Sung, Nack-Do
    • Analytical Science and Technology
    • /
    • v.20 no.4
    • /
    • pp.339-346
    • /
    • 2007
  • To search the ninhydrin derivatives that have high chromogenic and fluorogenic properties, molecular holographic quantitative structure property relationship (HQSPR) models on the reactivity between glycine and ninhydrin analogues as latent fingerprint detector were derived and investigated quantitatively. The ${\varepsilon}LUMO$ (e.v.) energy of ninhydrin molecule was an important factor to reactivity of ninhydrin. And, it is suggested that the nucleophilic reaction by orbital-controlled reaction from the frontier molecular orbital (FMO) interaction between glycine and ninhydrin derivatives was more superior than that of electrophilic reaction by charged controlled reaction. The analytical results in atomic contribution maps also shows that the reactivity of ninhydrin was increased by meta-substituents as strong electron withdrawing groups on the benzo ring. Therefore, it is sugested by HQSPR and QSPR model that the 5,6-dinitroninhydrin molecule would increase the reactivity as much as three times as compared to none substituted ninhydrin molecule.

Divergence Analysis of 16S rRNA and rpoB Gene Sequences Revealed from the Harmful Cyanobacterium Microcystis aeruginosa (유해 남조세균 Microcystis aeruginosa의 16S rRNA 및 rpoB 유전자 염기서열 변이 분석)

  • Ki, Jang-Seu
    • Korean Journal of Microbiology
    • /
    • v.46 no.3
    • /
    • pp.296-302
    • /
    • 2010
  • Microcystis (Cyanobacteria, Chroococcales) is one of the green tide-causing organisms in freshwaters, and some species produce microcystin that is hepatotoxin. In the aspects of freshwater quality controls and health concerns, therefore it is necessary to manage the harmful organisms. In the present study, RNA polymerase beta subunit (rpoB) gene sequences of Microcystis were determined and characterized in order to use a potential marker for the molecular detections of the species. Microcystis rpoB showed high divergences of DNA similarity and genetic distances when compared with those of 16S rRNA, and the molecular differences were statistically significant (Student t-test, p<0.05). Parsimony analyses showed the rpoB gene evolves more than 2-fold faster than 16S rRNA. In addition, phylogeny of the rpoB gene separated each M. aeruginosa strain more clearly compared with a 16S rRNA tree. This study found that the order Chroococcales, including Microcystis, has approximately two rRNA operons and single copy of the rpoB gene in their chromosomes. These results suggest that the rpoB gene is a useful marker for the molecular phylogenetics and the detection of Microcystis.

Development of DNA Probe Assay System for Salmonella Species using Glass as substrate

  • Jeong, U-Seong;Lee, Ung-Hui;Baek, Se-Hwan
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
    • /
    • 2001.11a
    • /
    • pp.235-236
    • /
    • 2001
  • We developed a DNA probe analytical system with a patterned array of oligonucleotide molecules immobilized on glass surfaces. The detection capability of the system depended mainly on the way the capture probes were attached to the support as wen as the sequence. We optimized major variables to graft DNA molecules onto a glass support and the DNA probe assay was eventually accomplished without purification of the PCR product.

  • PDF

Fluorescence photon counting rate as a function of dye concentration: Effect of dead time of photon detector (색소 농도에 따른 형광 광자의 계수율 : 광자 검출기의 dead time 효과)

  • 고동섭
    • Korean Journal of Optics and Photonics
    • /
    • v.8 no.4
    • /
    • pp.353-355
    • /
    • 1997
  • A single molecule detection system, which consists of confocal fluorescence microscope and single photon counter, has been used to observe the dye concentration dependence of photon counting rate. With increasing concentration, a saturation effect of counting is observed and demonstrated on the basis of the dead time of photon detector. The equations presented here show the relations between the counting rate and some parameters such as probe volume, quantum efficiency of detector, and fluorescence photon number entered onto detector. The signal-to-noise ratio is also discussed briefly.

  • PDF

Covalent Binding of DNA onto Glass Support for the Construction of Genosensor

  • Jeong, U-Seong;Baek, Se-Hwan
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
    • /
    • 2000.11a
    • /
    • pp.709-710
    • /
    • 2000
  • Genosensor technology utilizes a patterned array of DNA molecules immobilized on solid supports for biomedical analysis. The detection capability of the sensor depended mainly on the way the capture probes are attached to the support as well as the sequence. We compared two different. coupling methods currently used to covalently graft DNA molecules onto a glass surface.

  • PDF