Deletions between UASG and the GALI TATA box reduced glucose repression and allowed constitutive expression of the gene product in the absence of galactose. The relative inducer level (ratio of galactose/glucose concentrations) affected the extent of gene expression and glucose repression. Glucose repression was reduced by a factor of 2 to 5 as the relative inducer level increased. In the medium containing galactose only, induction of ${\beta}$-galactosidase synthesis by galactose increased with plasmid copy number. On the contrary, plasmid copy number did not affect significantly ${\beta}$-galactosidase synthesis in the medium containing both glucose and galactose (2% glucose+2% galactose), which might be due to glucose repression caused by high glucose concentration. However, when the medium contained the relatively high inducer level (0.4% glucose+0.8% galactose), ${\beta}$-galactosidase synthesis increased with plasmid copy number, indicating that the beneficial effect of higher galactose concentration was weaker than the repressive effect of higher glucose concentration.
Autoimmune regulator gene (Aire) is expressed in the thymus and controls the expression of peripheral self-antigens, known as promiscuous genes. Aire and promiscuous genes are involved in T cell tolerance and autoimmunity in the thymus. Here, we identified Aire-expressing fibroblastic reticular cell (FRC), which was derived from mouse lymph node and also expressed in insulin promiscuous antigen. The expression of insulin was increased in cultured FRC over-expressed with Aire. These data suggest that Aire regulates promiscuous gene expression in FRC, and that this function might be under peripheral selection control.
Lee Young-Keun;Chang Hwa-Hyoung;Jang Yu-Sin;Huh Jae-Ho;Hyung Seok-Won;Chung Hye-Young
Korean Journal of Environmental Biology
/
v.22
no.3
/
pp.472-477
/
2004
To study the radiation related gene expression in mutants of Bacillus lentimorbus WJ5 induced by gamm radiation, the simultaneous gene expression was analyzed by DNA micro array. We constructed DNA chips including two thousand randomly digested genome spots of B. lentimorbus WJ5 and compared its quantitative aspect with seven mutants induced by gamma radiation $(^{60}/Co)$. From the cluster analysis of gene expression pattern, totally 408 genes were expressed and 27 genes were significantly upregulated by the gamma radiation in all mutants. Especially, genes involved in repair (mutL, mutM), energy metabolism (acsA, sdhB, pgk, yhjB, citB), protease (npr), and reduction response to oxidative stress (HMM) were simultaneously upregulated. It seems that the induction of the direct and/or indirect repair related genes in mutants induced by gamma radiation could be remarkably different from the adaptive responses against acute exposure to radiation.
A prokaryotic cell has various histone-like proteins also known as nucleoid-associated proteins (NAPs). These proteins bind AT-rich sequence at DNA, which induce DNA wrapping, bending, and bridging, and subsequently regulate the gene expression in bacteria. Because NAPs function in transcriptional silencing of virulence genes, it is important to study their roles in gene silencing and specific mechanisms of these proteins. In this review, we discussed two well-known NAPs, H-NS, and HU, and summarized their roles for gene expression in Escherichia coli and Salmonella Typhimurium. Through the oligomerization and filamentation of H-NS, it represses the expression of virulence genes in human pathogenic bacteria, such as Salmonella Typhimurium, and it works with other NAPs positively or negatively. Recently, H-NS also regulates typhoid toxin expression, which causes typhoid fever and systemic disease in human. Additionally, HU regulates the expression of genes related to both virulence and physiology of Salmonella. Therefore, we suggest that NAPs like H-NS and HU are crucial factors to reveal the molecular mechanisms of virulence gene expression in bacteria.
Kim, Byung-Lip;Baek, Jung-Eun;Kim, Chun-Sug;Lee, Hyeok-Weon;Ahn, Jung-Oh;Lee, Hong-Weon;Jung, Joon-Ki;Lee, Eun-Gyo;Kim, In-Ho
KSBB Journal
/
v.23
no.3
/
pp.205-212
/
2008
The efficient soluble expression of human epidermal growth factor (hEGF) was achieved by using functional fusion partners in cytoplasm and periplasm of Escherichia coli (E. coli). hEGF was over-expressed in inactive inclusion body form in cytoplasm of E. coli due to improper disulfide bond formation and hydrophobic interaction, yielding about 5.9 mg/L in flask culture. Six functional fusion partners were introduced by linking to N-terminal part of hEGF gene for the high-level expression of soluble and active hEGF in cytoplasm and peri plasm region. Three fusion partners for cytoplasmic expression such as acidic tail of synuclein (ATS), thioredoxin (Trx) and lipase, and three fusion partners for periplasmic expression such as periplasmic cystein oxidoreductases (DsbA and DsbC) and maltose binding protein (MBP) were investigated. hEGF fused with ATS and DsbA showed over 90% of solubility in cytoplasm and periplasm, respectively. Especially DsbA was found to be an efficient fusion partner for soluble and high-level expression of hEGF, yielding about 18.1 mg/L and three-fold higher level compared to that of insoluble non-fusion hEGF in cytoplasm. Thus, heterologous proteins containing complex disulfide bond and many hydrophobic amino acids can effectively be produced as an active form in E. coli by introducing a suitable peptide or protein.
Kim, Jin-Hee;Lee, Kyoung-Ran;Kim, Hyeon-Kyeong;No, So-Hyeon;Yoo, Hye-Min;Moon, Chan-Il;Yang, Hyun-Won
Development and Reproduction
/
v.15
no.4
/
pp.349-357
/
2011
Since nesfatin-1/NUCB2 involved in the control of appetite and energy metabolism was discovered for the first time in hypothalamus, many reports have shown its expression in various tissues. We also recently demonstrated that nesfatin-1/NUCB2 was expressed in the reproductive organs of mouse. However, no data exist on nesfatin-1/NUCB2 expression, regulation, and secretion in the uterus. Therefore, we examined the expression of nesfatin-1/NUCB2 in mouse uterus and the effects of PMSG and estrogen on its expression. NUCB2 mRNA expression in the uterus was determined by conventional and real-time PCR and nesfatin-1 protein expression was detected by western blotting. In immunohistochemistry staining, nesfatin-1 protein was localized at the epithelial cells of the uterine glands and endometrium. Nesfatin-1 protein binding sites were displayed at the epithelial cells of uterine glands and specific granulocytes including neutrophils. Additionally, to examine if the nesfatin-1/NUCB2 expression in the uterus is regulated by gonadotropin or estrogen, ovariectomized mice were treated with PMSG or $17{\beta}$-estradiol. The expression levels of NUCB2 mRNA in the uterus was significantly increased in the control mice after PMSG treatment, but not in the ovariectomized mice. In contrast, NUCB2 mRNA expression was dramatically increased in the ovariectomized mice after treatment with $17{\beta}$-estradiol. We report here for the first time that nesfatin-1/NUCB2 mRNA and protein express in the mouse uterus and its expression is regulated by estrogen secreted from the ovary, but not gonadotropin from the pituitary.
Purpose : Patients with chronic granulomatous disease (CGD) have genetic mutations in a component of the NADPH oxidase enzyme that is necessary for the generation of the superoxide anion. The profound defect in innate immunity is reflected by the patients susceptibility to catalase-positive bacteria and fungi. In addition, CGD patients display signs of persistent inflammation, which is not associated only with deficient superoxide anion production. The aim of this study was to elucidate the cytokine responses in CGD patients after $TNF-{\alpha}$ stimulation. Methods : Heparinized blood samples were collected from 8 CGD patients and 10 healthy volunteers. Monocytes ($1{\times}10^6cell/well$) isolated by the magnet cell isolation system were incubated with a constant amount of $TNF-{\alpha}$ (10 ng/mL) at $37^{\circ}C$ for 6 h. Incubated cells were harvested at 60-min intervals for IL-8 and IL-10 mRNA analysis, and the supernatant was collected at the same intervals to determine IL-8 and IL-10 expression. Monocytes from healthy volunteers were also incubated with antioxidants followed by $TNF-{\alpha}$ stimulation for IL-8 and IL-10 expression. Results : In CGD patients, a high expression of IL-8 together with a significantly higher IL-10 expression than in the healthy controls was seen after $TNF-{\alpha}$ stimulation. Moreover, normal monocytes treated with antioxidants exhibited increased IL-8 responses. Conclusion : The absence of phagocyte-derived reactive oxidants in CGD might be associated with a dysregulated production of pro- and antiinflammatory cytokines. Additional research related to reactive oxidants is needed to clarify the role of cytokines in CGD patients.
This study was carried out to examine the expression of the circadian clock genes in the mouse ovary and testis at different developmental stages. Expression of Period1(Per 1), Period2(Per2), Period3(Per3), Cryptochrome1(Cry1), Cyptochrome2(Cry2), Clock Small and Prokineticin1 and Prokineticin2 receptor(Prok1r, Prok2r) genes in mouse ovary was explored by semiquantitative reverse transcription Polymerase chain reaction(RT-PCR) according to the developmental stage(post partum day; ppd 1, 7, 10, 21 and 35). Immunohistochemistry using PER1 antibody was also analyzed. The differential expression pattern of clock genes was presented according to stages of the mouse ovarian development (ppd 1, 7, 10, 21 and 35). In the cases of ovaries, at the starting point of follicle growth at ppd 7 and 10, the clock gene expression patterns were changed vastly. According to the developmental stages, the clock genes were highly expressed at ppd 7 and 10 in mouse testis also. Receptors for Prok2, the circadian output molecule of SCN, were also expressed in ovary at ppd 7 and in testis at ppd 1 and 7, respectively. Immnunohistochemical analysis of PER1 showed positive signals in the cytoplasm of oocytes and granulosa cells. The level or PER1 expression was increased in cells at the spermatogonia and the condensing spermatids. The expression pattern of Perl and localization of PER1 were showed similar patterns according to the developmental stages in ovary and testis. Taken together, it could be observed that the expression of clock genes was highly correlated with gonadal development and germ cell differentiation in mice. Therefore, in this study, circadian programming of the genes in the ovary and testis is strongly imposed across a wide range of core reproductive cycles and normal development of gametes. Although the existence of circadian genes is clearly investigated, further studies on the direct evidence is required for the understanding of the relationship between circadian genes and regulation of gonadal differentiation and germ cell development.
Park, Jun Eun;Choi, Kang Duk;Kim, Sung Hwan;Hahm, Dae-Hyun;Seo, Jong Jin
Clinical and Experimental Pediatrics
/
v.48
no.7
/
pp.779-788
/
2005
Purpose : Echinacea, a traditional plant medicine has been used as immune-stimulant. Recent studies have revealed that extract of Echinacea has immunostimulatory effects on human blood mononuclear cells. This study was designed for the purpose of screening the genes associated with immunologic effects of Echinacea on monocytes and dendritic cells using a cDNA microarray chip. Methods : $CD14^+$ monocyte cells were cultured for one day with Echinacea extract(final concentration : $50{\mu}g/mL$) in experiment 1, but were cultured without Echinacea in experiment 2. The gene expression of these cultured monocytes was analyzed using the cDNA microarray chip. Dendritic cells produced from $CD14^+$ monocyte were cultured for five days with GM-CSF and IL-4, and then cultured for one day with Echinacea in experiment 3, but were done without Echinacea in experiment 4. Results : In experiments 1 and 2, there were 17 significantly expressed genes with average expression ratios above 2.5, including interferon gamma-inducible protein 30(IFI 30), CDC(cell-division-cylcle)-like kinase 2(CLK 2), syndecan binding protein(syntenin), superoxide dismutase 2, etc. In experiments 3 and 4, there were 24 gene, with significantly expressed genes were 24 genes, which were insulin-like growth factor 2(somatomedin A), methyl-CpG binding domain protein 3, IFI 30, small inducible cytokine subfamily A, member 22, etc. The genes encoding CD44, IFI 30, mannose receptor C type 1(MRC 1), chemokine receptor 7(CCR 7), CLK 2, syntenin and cytochrome C oxidase subunit VIII were significantly expressed in both monocytes and dendritic cells cultured with Echinacea. Conclusion : This study employed a cDNA microarray chip to elicit the immune-associated gene profile; the expression was enhanced by Echinacea in CD14+ monocytes and dendritic cells. Thus we laid the basis for the quantitative and functional analysis of genes induced by Echinacea in monocytes and monocyte-derived dendritic cells.
Kim, Hee-Sun;Baik, Won-Jin;Lee, Won-Jae;Shin, Duk-Seop
The Journal of the Korean bone and joint tumor society
/
v.9
no.2
/
pp.178-189
/
2003
Purpose: The current study was designed to investigate the expression pattern of chemokine in musculoskeletal tumors, and between primary osteosarcoma and recurred, and postchemotherapy one. Materials and methods: Ten primary soft tissue and bone tumors, one primary, one recurred, one post-chemotherapy osteosarcoma, and one normal control patients were included in the current study. RT-PCR and RPA were used for the investigation of the expression of cytokines and chemokines. Fisher's exact test in SPSS was used for the statistical analysis. Results: IL-8 and TNF-${\alpha}$ were expressed in all tumor tissues, IFN-${\gamma}$ was in all except two cases, RANTES was in 5 soft tissue tumors and 4 bone tumors, GRO-${\alpha}$was in one soft tissue tumor and 2 bone tumors, and MCP-1 and IP-10 were in two bone tumors and in all the other group. In recurred osteosarcoma all the cytokines and chemokines were expressed, and the degree of the expression was stronger than the primary, except IFN-${\gamma}$. After chemotherapy, RANTES, IFN-${\beta}$ and TGF${\beta}_1$ among the TGF${\beta}$isoforms were expressed. Conclusion: There were differences in the expression of cytokines and chemokines in some different bone and soft tissue tumors, even though it was impossible to support this statistically due to small numbers of cases. The expression pattern of IFN-${\gamma}$and TGF-${\beta}$ isoform in osteosarcoma could be used for the study of tumor recurrence and the changes after chemotherapy.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.