• 제목/요약/키워드: 반점 형태 모형

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2차원 전기영동 영상의 단백질 반점 정합을 위한 비대칭 확산 모형 (Asymmetric Diffusion Model for Protein Spot Matching in 2-DE Image)

  • 최관덕;윤영우
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제15B권6호
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    • pp.561-574
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    • 2008
  • 2차원 전기영동 영상 분석 프로그램의 반점 검출 단계는 영상 분할 알고리즘을 사용해서 겔 영상을 반점 영역으로 분할하고 각 반점 영역을 반점 형태 모형에 정합하여 다음 단계에 필요한 반점 정보를 정량화한다. 현재 영상 분할 알고리즘으로는 분수령 기법이 일반적으로 사용되며, 대표적인 반점 형태 모형으로는 가우스 모형, 확산 모형이 있다. 확산 모형이 가우스 모형보다 실제의 반점 형태에 좀 더 가깝기는 하지만, 반점 형태는 매우 다양하며 특히 x-축과 y-축에 대해서 비대칭적인 형태를 보인다. 반점이 비대칭적 형태인 이유는 2-DE 처리가 통상 이상적인 환경 하에서 이루어질 수 없기 때문에 단백질이 완전히 확산되지 못하기 때문으로 알려져 있다. 따라서 본 논문에서는 비대칭 확산 모형을 제안한다. 비대칭 확산 모형은 초기에는 단백질이 하나의 원으로부터 확산되지만, 시간이 흐름에 따라 x-축과 y-축에 대해서 비대칭적으로 확산된다고 가정한 모형이다. 실험으로서 19개의 겔 영상에 대해서 세 모형별로 반점 정합을 수행하고 세 모형의 비교를 위해서 SNR의 평균을 구하였다. 실험결과인 SNR의 평균은 가우스 모형이 14.22dB, 확산 모형이 20.72dB, 비대칭 확산 모형이 22.85dB이었다. 실험결과로써 비대칭 확산 모형이 가우스 모형과 확산 모형에 비해서 반점 정합에 보다 더 효율적이며 적합한 모형임을 확인하였다.

비치오놀 설폭사이드, C12H6Cl4O3S의 결정구조 (Crystal Structure of Bithional Sulfoxide, $C_{12}H_6Cl_4O_3S$)

  • 신현소;송현
    • 대한화학회지
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    • 제38권4호
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    • pp.283-287
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    • 1994
  • 비치오놀 설폭사이드, $C_{12}H_6Cl_4O_3S$의 결정구조를 흑연으로 단색화된 $Mo-K\alpha방사선을$ 이용하는 CAD-4 회절기를 사용하여 수집한 2295개의 독립된 회절반점을 이용하여 해석하였다. 결정계는 단사정계이며, 공간군은 P2$_1$/n이고, 격자상수는 a = 12.448(4), b = 9.740(1), c = $11.815(2)\AA$, $\beta$ = $100.06^{\circ}$, $\mu$ = 9.02 $cm^{-1}$, Dm = 1.76 g/$cm^3$, Dc = 1.75 g/$cm^3$, F(000) = 744, and Z = 4이다. 구조는 직접법으로 해석하였으며, 최소자승법으로 정밀화하여 최종 신뢰도 R=0.037인 모형을 구하였다. 분자의 전체적인 형태는 비치오놀의 경우와 비교하여 2개의 페닐링 중 한 개와 설폭사이드기를 축으로 삼아 대략 $180^{\circ}$ 정도로 회전하였음을 알 수 있었으며, 이와 같은 구조적인 변화는 S-O(3)---H-O(1)형의 분자내 수소결합의 존재와 설폭사이드기와 다른 페닐링간의 입체장에 현상 때문이다. 두 개의 페닐링은 평면구조를 나타내며, 두 평면간의 이면각은 $99.22^{\circ}$이다. 결정구조는 O(3)---H-O(2)형 분자간 수소결합에 의해 결합되어 있다.

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