• 제목/요약/키워드: 단백세균

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COG 알고리즘을 통한 Proteobacteria의 보존적 유전자 파악 (Detection of Conserved Genes in Proteobacteria by using a COG Algorithm)

  • 이동근;강호영;이재화;김철민
    • KSBB Journal
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    • 제17권6호
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    • pp.560-565
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    • 2002
  • 생태계에서 중요한 역할을 담당하는 단백세균(Proteobacteria)의 보존적유전자(conserved gene)를 파악하고 서로간의 유연 관계를 밝히고자 clusters of orthologous groups of proteins(COG) 알고리즘을 이용한 접근법을 시도하였다. 42종의 원핵생물과 33종의 진정세균, 16종의 단백세균으로 가면서 보존적유전자가 증가하는 것을 확인하였다. 분석대상 원핵생물 모두에서 75종의 COG 즉 보존적 유전자가 관찰되었다. COG0195, COG0358 그리고 COG0528은 원핵생물에서만 관찰되어 새로운 분류의 parameter로 이용될 가능성이 있는 것으로 추측되었다. 64종류의 보존적 유전자가 33종의 진정세균(eubacteria)에서 관찰되었다. 이는 각 분류단계를 특징짓는 새로운 COG의 추가에 의한 결과로 사료되었다. 각 단백세균 그룹은 독자적인 COG 레퍼토리를 소유하였으며 물질대사에 관련된 보존적 유전자는 beta 그룹이 다른 그룹에 비해 다양한 것을 확인하였다. 본 연구는 단백세균의 기원과 진화적 유연관계를 파악하는데 도움을 줄뿐만 아니라 향후 세균분류학과 생명공학에 필수적인 유용유전자 탐색 등에서도 충분한 연구가치가 있는 것으로 사료되었다.

Corynebacterium 속 식물병원세균에 관한 연구(III) - 식물병원세균의 아미노산 조성 (Studies on the Plant Pathogenic Corynebacteria(III) -The amino acid composition of some plant pathogenic bacteria-)

  • 김종완
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.209-213
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    • 1975
  • 본 실험은 Corynebacterium속 식물병원세균에 관한 연구의 일환으로서 Corynebacterium속 식물병원세균의 종 및 속으로서의 특성을 구명하기 위하여 행하여진 것으로서 균체구성단백의 정량은 Lang의 Messier 변법을 사용하였으며 균채 구성단백의 아미노산정량은 미생물 정량에 의하였다. Corynebacterium 속 식물병원세균은 타속의 병원세균에 비하여 다소 적은양의 균체 구성단백을 가지고 있었으며 균체구성단백의 아미노산; Cystein, Trypthophane, Histidine, Phenylalanine 및 Isoleucin에 있어서도 같은 결과를 나타내었다. 허나 이 현상은 종적 혹은 개체의 균주의 특성으로서 분류에는 관계를 갖지 않고 있음이 밝혀졌다

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COG 알고리즘으로 파악한 Proteobacteria의 보존적 유전자

  • 이동근;이진옥;이재화
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XII)
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    • pp.715-718
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    • 2003
  • Clusters of orthologous groups of proteins (COG) 알고리즘을 이용하여 42 종의 원핵생물, 33종의 진정세균, 16종의 단백세균 수준에서의 보존적 유전자 (conserved gene)를 파악하였다. 분석대상 원핵생물 모두 75종의 COG 즉 보존적 유전자가 관찰되었다. COG0195, COG0358 그리고 COG0528은 원핵생물에서만 관찰되었고 64종류의 보존적 유전자가 33종의 Bacteria에서 관찰되었다. 각 분류단계를 특징짓는 새로운 COG의 추가를 확인하였고 각 단백세균 그룹은 독자적인 COG 레퍼토리를 소유하였으며 물질대사에 관련된 보존적 유전자는 beta 그룹이 다른 그룹에 비해 다양한 것을 확인하였다. 본 연구는 Proteobacteria의 기원과 진화적 유연관계를 파악하는데 도움을 줄 뿐만 아니라 향후 세균분류학과 생명공학에 필수적인 유용유전자 탐색 등에서도 충분한 연구가치가 있는 것으로 사료되었다.

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열이 있는 3개월 이하의 영아에서 수막염의 예측에 대한 연구 (Predictors of Meningitis in Febrile Infants Aged 3 Months or Younger)

  • 송향순;김은옥;장영택
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제16권1호
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    • pp.40-46
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    • 2009
  • 목 적: 3개월 이하의 열이 있는 영아에서 세균성 수막염의 진단에 도움이 되는 유용한 예측인자를 알아보고자 연구를 시작하였다. 방 법: 2003년 1월부터 2008년 4월까지 전주예수병원에 직장 체온으로 $38^{\circ}C$ 이상의 발열을 주소로 내원한 3개월 이하의 영아 652명을 대상으로, 내원 당시 체온, 말초 혈액에서 총 백혈구수, 대호중구수, 절대호중구수, C-반응 단백, 혈액 배양검사를 하였고, 세균성 수막염과 연관있는 인자를 분석하였다. 결 과: 세균성 수막염과 관련된 인자로는 C-반응 단백, 대호중구수, 절대호중구수, 연령의 P value가 각각 0.036, 0.037, 0.036, 0.001로 모두 통계학적인 의의가 있었다. C-반응 단백, 대호중구수, 절대호중구수, 연령의 곡선하면적은 각각 0.969, 0.946, 0.765, 0.235이었으며, C-반응 단백의 민감도, 특이도 및 차단점은 각각 83%, 96%, 8 mg/dL, 대호중구수는 각각 83%, 95%, $2,500/mm^3$, 절대호중구수는 각각 83%, 62%, $5,100/mm^3$이었다. C-반응 단백이 7 mg/dL 미만에서는 우도가 0.17이고, 사후확률은 0.1%, 음성예측도가 91% 이어서 세균성 수막염을 배제할 수 있었으며, C-반응단백이 9 mg/dL 이상인 경우 우도는 20.1로, 대호중구수의 16.6, 절대호중구수의 2.18, 연령의 0.61보다 높아서, 혈청 C-반응 단백이 세균성 수막염을 예측하는데 가장 유용한 것으로 판단되었다. 결 론: 3개월 이하의 영아가 발열이 있는 경우 C-반응 단백, 대호중구수, 절대호중구수가 높은 경우에는 세균성 수막염과 관련이 더 많았으며, 특히 혈청 C-반응 단백이 가장 유용한 인자로, 7 mg/dL 미만인 경우는 세균성 수막염을 배제하는데 도움이 되었고, 9 mg/dL 이상인 경우에는 세균성 수막염의 강한 예측인자가 되어 뇌척수액 검사를 적극적으로 고려해야 할 것으로 사료되었다.

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폐섬유자원의 발효공학적 이용에 관한 연구 제4보 섬유소자화세균의 분리 및 동정

  • 성낙계;심기환
    • 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물생명공학회 1976년도 제8회 학술발표회
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    • pp.186.2-186
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    • 1976
  • 폐섬유자원을 기질로 하여 섬유소 단세포 단백을 생산할 목적으로 225종의 균원시료에서 252주의 섬유소 자화세균을 분리하였으며 이들 중 섬유소 자화력이 아주 강한 균 1주를 동정하고 그 성상을 조사한 결과는 다음과 같다.(중략)

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혼합 비티 독소단백질과 아이코사노이드 생합성 억제자를 이용한 약효 증진 기술 (A Technique to Enhance Insecticidal Efficacy Using Bt Cry Toxin Mixture and Eicosanoid Biosynthesis Inhibitor)

  • 엄성현;박영진;김용균
    • 농약과학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.301-311
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    • 2015
  • Bacillus thuringiensis (비티)의 약효를 증가시키기 위한 일환으로 Cry 독소단백질의 혼합효과를 검정하였다. 서로 다른 네 가지 비티 균주에서 분리된 Cry 독소단백질 추출물들은 각각 좁은 적용해충범위를 나타냈다. 이들 Cry 독소단백질을 혼합한 결과 적용범위가 현격하게 증가했다. Xenorhabdus nematophila (Xn) 세균 배양액은 조사된 모든 곤충의 세포성 면역을 억제하고 Cry 독소단백질의 살충력을 증가시켰다. 이 Xn 세균배양액을 혼합 Cry 독소단백질에 추가한 결과 적용해충범위와 살충력을 모두 증가시켰다.

농산폐자원의 미생물학적 이용에 관한 연구 (제4보) 직유소 단세포단백의 생산

  • 배무;김병홍
    • 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물생명공학회 1974년도 학술발표논문집
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    • pp.124.3-124
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    • 1974
  • 규정농도의 $NH_4OH로$ 처리한 볏짚을 기질로 분리ㆍ동경 한 섬유소 자화세균 Cellulomonas flavige na KIST 321 및 C. aurogena nov species KIST 11을 배양하여 구체단백을 생산할 때 최적 조건을 살펴 본 결과 다음과 같다.(중략)

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농산폐자원의 미생물학적 이용에 관한 연구 (제7보) 섬유소 단세포 단백 생산에 있언서 기질의 특이성에 대하여

  • 고영희;이계준;배무
    • 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물생명공학회 1976년도 제7회 학술발표회
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    • pp.183.1-183
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    • 1976
  • 우리나라에서 쉽게 얻을 수 있는 각종 섬유소 폐기물을 유일한 탄소원으로 하여 전보에서 분리 동정한 섬유소 자화 세균 Cellulomonas flavigena KIST 321을 배양하여 균단백의 생산에 대하여 살펴본 결과는 다음과 같다. 1) 당류를 탄소원으로 했을 때 cellulose꼭 xylose에서 균체생성량이 제일 많았다.(중략)

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총산폐자원의 징생물학적 이용에 관한 연구 (제3보) 섬유소자화 세균의 기질로서 볏짚의 전처리 효과

  • 배무;김병홍
    • 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물생명공학회 1974년도 학술발표논문집
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    • pp.124.2-124
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    • 1974
  • 전보에서 분리ㆍ등정한 섬유소 분해력이 강한 세균을 이용하여 볏짚에서 단세포단백을 생산할 목적으로 각종 알카리에 의한 볏짚의 전처리 효과를 살펴보았다. 즉, 규정농도의 알카리 용액에 24시간 실온에서 침지하여 중성이 될때까지 수세하고 건조시켜 무기염 용액에 4%첨가하여 5일간 진탕 배양한 후 균체량 증가 및 기질의 감소를 측정하여 다음과 같은 결과를 얻었다.(중략)

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