• Title/Summary/Keyword: 기능유전체

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Improving ncRNA Prediction using RNA common-structural Desciptor (RCSD) Committee Machine (RNA 공통 구조 기술자 Committee Machine을 이용한 ncRNA 예측 성능 향상 기법)

  • Nam Jin-Wu;Kim Sung-Kyu;Joung Je-Gun;Zhang Byoung-Tak
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2005.11b
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    • pp.265-267
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    • 2005
  • 최근 포유동물의 유전체에는 알려진 것보다 훨씬 많은 RNA 전사체가 발현되고 있음이 밝혀지고 있으며, 그 중에 많은 부분이 non-coding RNA로 알려지고 있다. 세포 내에서 non-coding RNA의 기능이 훨씬 다양해지고, 중요해지고 있는 상황에서 새로운 non-coding RNA를 정의하고, 탐색하는 것은 가장 시급한 과제이다. 본 연구에서는 이전 연구에서 RNA 공통 구조 학습을 위해 제안되었던, esRCSG (evolutionary search for RNA common-structural grammar) 알고리즘의 성능 향상을 위해, committee machine을 도입한다. Committee machine은 마지막 세대에서 최적화된 RNA 공통 구조 기술자 (RCSD)와 차상위로 최적화된 기술자들 중 양성데이터와 음성데이터의 치역을 합쳤을 때 특이도는 거의 변화가 없으면서 민감도의 증가가 가장 큰 기술자들의 집합이다. Committee machine은 특히 family type의 서열의 가진 특정 ncRNA에서 좋은 성능 향상을 보인다. microRNA를 이용한 성능평가에서 특이도의 변화가 거의 없이 민감도의 성능이 약 1.5배 향상되는 결과를 보였다. 이러한 특이도와 민감도가 높은 기술자를 이용함으로써 새로운 non-coding RNA를 예측하는 것을 약속할 수 있을 것이다.

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High-efficiency and Rapid Agrobacterium-mediated genetic transformation method using germinating rice seeds (벼 발아초기 종자를 이용한 고효율 단기형질전환 방법)

  • Lee, Hye-Jung;Abdula, Sailila E.;Jee, Moo-Geun;Jang, Dae-Won;Cho, Yong-Gu
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • v.38 no.4
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    • pp.251-257
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    • 2011
  • Rice is the most important crop as a model plant for functional genomics of monocotyledons. Rice is usually transformed using Agrobacterium tumefaciens. However, the transformation efficiency using previous method is still low. In this study, we established a new method by modifying the general Agrobacterium protocol especially in the inoculation and co-cultivation step. We directly inoculated Agrobacterium containing a CIPK15 gene under the control of CaMV 35S promoter and NOS terminator in the pCAM1300 vector into the pre-soaked seeds in N6D media for 24 hours. After 7 days of culture at $25^{\circ}C$, calli were formed on seeds cultured on the co-cultivation medium containing an antioxidant compound (1 mM dithiothreitol) and of Agrobacterium growth-inhibiting agent (3 mg/L silver nitrate). We obtained 35 and 22 transgenic plants in rice cultivars, Gopumbyeo and Ilpumbyeo, with increase of transformation efficiency by 30.4% and 22.6%, respectively compared to the general transformation method. The new method in this study would lead to reduction of substantial labor and time to generate transgenic plants.

UNDERSTANDING OF EPIGENETICS AND DNA METHYLATION (후생유전학 (Epigenetics)과 DNA methylation의 이해)

  • Oh, Jung-Hwan;Kwon, Young-Dae;Yoon, Byung-Wook;Choi, Byung-Jun
    • Maxillofacial Plastic and Reconstructive Surgery
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    • v.30 no.3
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    • pp.302-309
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    • 2008
  • Epigenetic is usually referring to heritable traits that do not involve changes to the underlying DNA sequence. DNA methylation is known to serve as cellular memory. and is one of the most important mechanism of epigenetic. DNA methylation is a covalent modification in which the target molecules for methylation in mammalian DNA are cytosine bases in CpG dinucleotides. The 5' position of cytosine is methylated in a reaction catalyzed by DNA methyltransferases; DNMTl, DNMT3a, and DNMT3b. There are two different regions in the context of DNA methylation: CpG poor regions and CpG islands. The intergenic and the intronic region is considered to be CpG poor, and CpG islands are discrete CpG-rich regions which are often found in promoter regions. Normally, CpG poor regions are usually methylated whereas CpG islands are generally hypomethylated. DNA methylation is involved in various biological processes such as tissue-specific gene expression, genomic imprinting, and X chromosome inactivation. In general. cancer cells are characterized by global genomic hypomethylation and focal hypermethylation of CpG islands, which are generally unmethylated in normal cells. Gene silencing by CpG hypermethylation at the promotors of tumor suppressor genes is probably the most common mechanism of tumor suppressor inactivation in cancer.

Analysis on Patent Trends for Transparent Electronic Devices (투명전자소자 분야의 특허 동향 분석)

  • Lee, B.N.;Park, W.;Hwang, C.S.
    • Electronics and Telecommunications Trends
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    • v.25 no.1
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    • pp.124-131
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    • 2010
  • 지속적인 발전을 해 온 디스플레이 시장은 LCD 시장이 주도하고 있으며, LCD는 2006년 600억 달러에서 2009년에는 62% 성장한 약 980억 달러의 시장규모에 달할 것으로 전망되고 있다. 디스플레이 분야 중에서 최근에 각광받는 투명전자소자 관련 분야는 투명반도체, 투명전극, 투명유전체를 기반으로 제조된 전자소자에 관한 기술 분야이며, 투명전자소자는 정보인식, 정보처리, 정보표시의 기능을 투명한 전자기기로 구현함으로써 기존 전자기기의 공간적/시각적 제약을 해소할 수 있다. 투명전자소자는 u-IT 스마트 창에 사용될 수 있으며 스마트 창은 스마트 홈이나 스마트 자동차용 창으로 응용하는 것이 가능하다. 나아가서는 투명전자소자를 이용한 스마트 창, 스마트 쇼 윈도, 투명 내비게이터 등 투명 IT 전자기기는 2010년부터 시장을 형성해 2015년에 200억 달러 규모로 급성장될 것으로 예측되고 있다. 이에 본 고에서는 투명전자소자 분야에 대한 시장 동향과 전세계 특허 동향을 심층 분석해보고, 아울러 미국에 출원된 특허를 대상으로 해당 기술 분야에서 우리나라의 국제경쟁력을 분석하여 향후 투명전자소자 분야의 연구개발 방향을 모색해 보고자 한다.

Current Status and Outlook of pNFS and Its Implementation (pNFS 표준화 및 연구개발 동향)

  • Park, J.S.;Kim, S.Y.;Cha, M.H.;Kim, D.O.;Kim, Y.C.;Kim, H.Y.
    • Electronics and Telecommunications Trends
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    • v.26 no.5
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    • pp.55-65
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    • 2011
  • 요즘 신산업으로 떠오르고 있는 개인 유전체 분석이나 차세대 시퀀싱 기술과 같은 고성능 컴퓨팅 응용들은 data-intensive한 작업들을 요구하며, 이러한 응용을 지원하기 위한 고성능 파일 시스템 기술에 대한 연구들이 다수 진행 중이다. 그러나 그 결과물들은 업체별로 보유한 고유 기술로서, 상호 호환성 등의 문제로 인해 표준화의 필요성이 제기되어 왔다. 현재 파일 시스템과 관련하여 거의 모든 IT 업체에서 사용하고 있는 실질적인 표준은 NFS(Network File System)이다. IETF(Internet Engineering Task Force)에서는 이러한 요구사항들을 반영하여 2010년에 NFSv4.1 표준을 공표하였고, 특히 I/O 성능을 향상시키기 위한 pNFS(parallel NFS)는 NFSv4.1의 핵심 기능으로서 다수업체들과 연구기관들에서 많은 관심을 받고 있다. 본 고에서는 pNFS 표준화 및 연구개발 동향과 관련된 이슈들에 대해 기술하고자 한다.

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Micro robot using actuators based on dielectric elastomer (고분자 구동기를 이용한 마이크로 로봇)

  • 최혁렬;정광목;남재도
    • Proceedings of the Korean Society of Precision Engineering Conference
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    • 2003.06a
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    • pp.334-337
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    • 2003
  • In this paper. we introduce a novel actuation method based on dielectric elastomer. Along with basic principles of actuation using dielectric elastomer a new design of actuator is discussed. The proposed design has advantageous features in reduction in size, speed of response, ease and ruggedness of operation. Using the actuator. a three-degree-of-freedom actuator module is developed, which can provide up-down. and two rotational degree-of-freedom motion. In the application of the proposed actuation method, a micro-robot mimicking the motion of an inchworm is developed.

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Analysis on Evolution of Apoptotic Protein(AIF) through Comparative Genomics (비교 유전체학을 통한 세포사멸 단백질의 진화적 분석)

  • Heo, Jae-Rin;Jo, Byung-Gwan;Kim, Min Jung;Choi, Jae-Won;Kim, Hak Yong
    • Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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    • 2017.05a
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    • pp.299-300
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    • 2017
  • 세포사멸(Apoptosis)은 유전자에 의해 일어나는 세포의 능동적인 죽음을 의미한다. 본 연구에서는 식물의 세포사멸과 동물의 세포사멸을 진화적 관점에서 접근함으로써 세포사멸이라는 기작을 분석하고자하였다. 먼저 인간에서는 세포사멸에 관여하는 단백질이지만 식물과 효모에서는 다른 기능을 하는 단백질 정보를 확인하였다. 확인한 단백질 정보를 바탕으로 다른 생물종과의 유전체 비교분석을 통해 해당 단백질과 세포사멸기작에 대한 정보를 확인 할 수 있었다.

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제3세대 백금착체 항암제 신약개발 4. Mutagenicity study of SKI 2053R

  • 하광원;장성재;오혜영;정해관;허옥순;손수정;한의식;김노경
    • Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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    • 1993.04a
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    • pp.162-162
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    • 1993
  • 제 3세대 platinum complex인 SKI 2053R에 의한 Salmonella typhimurium의 복귀변이빈도, CHL세포(Chinese Hamster Lung)에 대한 염색체이상 유발율 및 ddY계 마우스에서의 골수분화세포에 대한 염색체이상유발로 기인한 소핵의 빈도수를 관찰하여 SKI 2053R의 유전독성을 평가하였다. Salmonella typhimurium를 이용한 복귀돌연변이시험에서 SKI 2053R은 매우 경미한 정도의 돌연변이 유발성을 가지는 것으로 판단되며, 균주 특이적 돌연변이 유발성으로 보아 염기쌍치환형의 돌연변이를 유발하는 것으로 사료되며 포유류배양세포를 이용한 염색체이상실험에서 대사 활성 부재 및 존재하의 모든 시험 농도에서 10% 이상의 염색체이상을 가진 세포가 관찰되었으며 염색체 상의 종류로는 염색분체형 교환 (cse)이 가장 많이 관찰되었다. 설치류를 이용한 소헥시험에서는 ddY계 마우스 골수세포의 분화과정에서 염색체이상을 유발하며, 다염성적혈구의 정염성적혈구에 대한 출현비율이 감소하는 결과로 볼때 방추체기능의 저해를 일으키는 것으로 판단된다. 그러므로 본 시험조건데 있어서 SKI 2053R은 소핵을 유발하는 물질로 결론지었다.

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최근에 연구개발되는 백신에 대하여

  • 한명국
    • KOREAN POULTRY JOURNAL
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    • v.33 no.3 s.377
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    • pp.104-106
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    • 2001
  • 작년 6월에 인간 유전자 지도의 초안이 작성된 이후 지난 2월 11일에 신문과 방송은 사람이 게놈지도가 완성되었다고 주요뉴스로 보도하였다. 1990년 8월에 인간게놈 연구계획이 발표된지 11년여간의 연구 끝에 이룩한 연구결과이다. 최근, 학문의 급속한 발전으로 질병의 진단과 치료에 새로운 지평이 열리고 있다 수의분야에서도 예외는 아니다. 특히 질병예방에 있어 중요한 백신의 연구개발에 있어서도 괄목할 만한 발전이 있었다. 유전공학의 발전과 여러 병원체의 병원성 인자와 체내의 면역기능과의 관련성 연구결과로 여러질병이 백신으로 예방이 가능하게 되었으며 보다 안전하고 효과적인 새로운 개념의 백신도 개발되고 있다. 새로운 백신, 즉 신백신은 유전자 조작(재조합)에 의한 병원성이 약해진 백신에서부터 여러 질병을 동시에 예방하려고 공안된 벡터백신, 그리고 유전자를 접종하는 DNA 백신 등이 대표적이다. 이들 백신은 기존백신에 사용되고 있는 백신보다 안전하고 경제적이며 우수한 효능을 발휘하도록 고안되고 있다.

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고강도 LTCC 소재에서 glass 조성의 영향

  • Gu, Sin-Il;Sin, Hyo-Sun;Yeo, Dong-Hun;Kim, Jong-Hui;Park, Eun-Tae;Nam, San
    • Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
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    • 2008.06a
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    • pp.61-61
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    • 2008
  • 이동 통신의 급격한 발전에 따라 이동통신 기기의 부품들이 소형화되고 다양한 기능이 요구되어지고 있다. 이동 통신용 부품은 패턴의 미세화와 비아 수의 증가 등 고집적화로 인한 강도 요구로 LTCC 소재의 사용이 증가되고 있다. 또한 glass의 조성이 결정상 생성 및 복합체의 미세 구조에 영향을 미칠 것으로 기대되지만 유리의 조성에 관한 연구는 아직 미비하다. 본 연구에서는, anorthite를 생성시키는 LTCC composite용 glass에서 융점 및 Tg에 영향을 주는 것으로 알려진 B와 Zn의 양을 변화시키고 2가 금속(Mg, Sr, Ba)원소를 첨가함에 따라 compostite에서 아노사이트 상을 비롯한 결정상의 생성과 이에 따른 미세구조의 변화를 살펴 보았다. 조성변화에 따라 제조된 glass는 Tg를 측정하고, 제조된 glass를 $Al_2O_3$ filler와 혼합하여 tape casting 공정으로 시트를 제작하였다. 제조된 시트를 소결한 후에, 강도, 유전 특성, 밀도를 측정하였다. 소결체는 미세구조와 상분석을 통해 LTCC 소재와 글래스 조성과의 상관관계를 확인하고자 하였다.

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