• Title/Summary/Keyword: 구조계산

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Molecular Modeling Study on Morphine Derivatives Using Density Functional Methods and Molecular Descriptors (범밀도 함수법과 Molecular Descriptor를 이용한 모르핀 유도체에 대한 분자 모델링 연구)

  • Cotua, Jose;Cotes, Sandra;Castro, Pedro;Castro, Fernando;Mora, Liadys
    • Journal of the Korean Chemical Society
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    • v.54 no.4
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    • pp.363-373
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    • 2010
  • Computational studies were carried out on the opiates morphine, heroin, codeine, pentazocine, and buprenorphine, under the density functional theory. The geometric parameters of the pharmacophore and substituents were evaluated at the B3LYP/6-31+G(d) level of theory. The electronic structure calculations were performed using the same hybrid functional at the B3LYP/6-311++G (d,p) level of theory. The atomic charges were obtained by Mulliken population analysis. Given the reported biological activity, calculated partition coefficients, and electronic and geometric analysis, pentazocine and buprenorphine were chosen as models for proposed analogues. These analogues were then studied and compared with the model molecules. The study reveals that the geometry and electronic structure of the pharmacophore remains consistent in the presence of different substituents. Because the proposed analogues preserve the studied properties of the model molecules, it is likely that these analogues display biological activity.

Computational Model for Hydrodynamic Pressure on Radial Gates during Earthquakes (레디얼 게이트에 작용하는 지진 동수압 계산 모형)

  • Phan, Hoang Nam;Lee, Jeeho
    • Journal of the Computational Structural Engineering Institute of Korea
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    • v.32 no.5
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    • pp.323-331
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    • 2019
  • In this study, a computational model approach for the modeling of hydrodynamic pressures acting on radial gates during strong earthquakes is proposed. The use of the dynamic layering method with the Arbitrary Lagrangian Eulerian (ALE) algorithm and the SIMPLE method for simulating free reservoir surface flow in addition to moving boundary interfaces between the fluid domain and a structure due to earthquake excitation are suggested. The verification and validation of the proposed approach are realized by comparisons performed using the renowned formulation derived by the experimental results for vertical and inclined dam surfaces subjected to earthquake excitation. A parameter study for the truncated lengths of the two-dimensional fluid domain demonstrates that twice the water level leads to efficient and converged computational results. Finally, numerical simulations for large radial gates with different curvatures subjected to two strong earthquakes are successfully performed using the suggested computational model.

Predicting RNA Pseudoknots Using a Genetic Algorithm (유전자 알고리즘을 이용한 RNA Pseudoknot 예측)

  • 이동규;한경숙
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2002.04a
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    • pp.682-684
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    • 2002
  • RNA 분자의 pseudoknot 구조는 이차 구조의 loop에 있는 염기와 이 loop 외부에 있는 염기와의 결합으로 생성되는 삼차 구조 요소이다. pseudoknot은 삼차 구조 형성에 필수적인 구조 요소일 뿐만 아니라, RNA 분자의 기능에 중요한 영향을 미친다. pseudoknot을 포함한 RNA 구조를 예측하는 문제는 매우 어려우며 많은 계산을 필요로 한다. 현재까지, 병렬 구조를 갖는 수퍼 컴퓨터에서 유전자 알고리즘을 이용한 프로그램의 예측 결과가 가장 우수하다고 알려져 있다. 그러나 이 프로그램은 수퍼 컴퓨터에서만 운용되기 때문에 일반 연구자가 쉽게 사용하기 어려운 단점이 있다. 본 논문은 유전자 알고리즘을 이용한 PC 기반의 pseudoknot 예측 프로그램에 대하여 기술한다. 실헙 결과는 PC 기반에서도 유전자 알고리즘을 이용하여 pseudoknot을 포함한 RNA 구조를 효과적으로 예측하고 있음을 보인다.

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Application of Information Flow Statistics to Micrometeorological Data to Identify the Ecosystem State (생태계의 상태 파악을 위한 정보 흐름 통계의 미기상학적 자료에의 적용)

  • Kim, Sehee;Yun, Juyeol;Kang, Minseok;Chun, Junghwa;Kim, Joon
    • Proceedings of The Korean Society of Agricultural and Forest Meteorology Conference
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    • 2013.11a
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    • pp.26-27
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    • 2013
  • 산림생태계의 에너지, 물질, 정보의 교환 과정과 그 변화를 이해하려면 먼저 생태계의 구조와 기능이 어떻게 상호작용하는지를 이해해야 한다. 생태계의 기능은 한, 두 가지의 특징에 의해서만 이루어지는 것이 아니다. 그렇기 때문에 그 기능을 파악하고 적절히 이용하거나 대응하기 위해서는 한 생태계와 주변 환경 전체를 바라볼 수 있는 시스템 사고가 필요하다. 이에 우리는 생태계의 '구조'를 파악함으로써 생태계의 '상태'를 이해하고자 한다. 본 연구에서는 Ruddell and Kumar (2009)의 접근법을 따라, 어떻게 한 생태계의 상태를 파악할 수 있는가라는 질문을 광릉활엽수림에 적용하여 답하고자 한다. 즉, 우리는 산림생태계가 열린 복잡계라고 가정하고, 생태계 내에서 다양한 프로세스들 간의 시시각각 변하는 네트워크의 구조가 각 시점의 시스템의 상태를 나타내는 지표가 될 수 있다고 가정하였다. 이 연구에서는 그 구조적 특징을 정량화하여 나타내는데 초점을 맞추었다. 각각의 프로세스를 대표하는 상태 변수들 간의 정보 흐름의 양과 방향, 시간 규모를 계산해냄으로써 네트워크 구조를 파악하고자 하였다. 온대 산악지형 활엽수림인 GDK의 2008년 순생태계교환량(NEE), 총일차생산량(GPP), 생태계호흡량(RE), 현열플럭스(H), 잠열플럭스(LE), 하향단파복사(Rg), 강수량(Precipitation), 기압(Pressure), 기온(T), 포차(VPD)의 시계열 자료를 월별로 나누어 최장 18 시간 규모의 정보 흐름을 계산하였다. 정보 흐름의 구조를 파악하기 위하여 변수들 간의 전이엔트로피(Transfer entropy)와 상호정보(Mutual Information)를 계산하는 방법을 사용하였다. 또한 시계열 자료를 이용함으로써 변수들 간에 정보가 전달되는 시간 규모의 특성을 파악할 수 있었다. 최종적으로, 계산한 정보 흐름을 시각화하여 프로세스 네트워크 구조를 나타내었다. 결과는 월별로 생태계의 정보 흐름의 종류, 방향과 시간 규모, 그에 따른 프로세스 간 상호 작용의 특징 등을 보여준다. 이를 통해 계절적 환경 변화에 따라 시스템의 네트워크 구조와 상태가 어떻게 변화하는지 이해할 수 있을 것이다. 이 연구는 추후 우리 연구실에서 생산한 8 년 자료에 적용함으로써 다양한 날씨 및 기후변화와 환경 변화에 따라 생태계의 구조와 상태가 어떻게 변화하는지 연구하는 시작점이 될 것이다. 이 접근법은 단위나 차원에 무관하게 다양한 종류의 자료에 적용할 수 있는 반면에, 일관성 있게 정의된 시스템의 상태 및 그 상태를 구성하는 주요 하부 시스템들의 네트워크 상태를 이해하는데 이용될 수 있다. 본 연구는 비평형 열역학과 복잡계의 관점에서 바라 본 시스템 사고를 적용하려 하는 여러 연구 분야에 새로운 도전을 촉발할 좋은 선행연구가 될 것이라 기대된다.

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An improved electrode structure of the Patterned Vertical Aligned Liquid Crystal Cell for high transmittance (새로운 전극구조를 통한 수직배향 액정 셀의 투과특성 향상)

  • Choi, Yong-Hyun;Son, Jung-Hee;Lee, Gi-Dong
    • Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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    • v.11 no.9
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    • pp.1724-1728
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    • 2007
  • In this paper we propose a novel electrode structure for high transmittance in the Patterned Vertical Alignment (PVA) LC cell. We use the 'TechWiz LCD' for calculation of the director configuration and optical characteristics. We studied the area decreasing the transmittance through the electrode structure for wide viewing angle and proposed new electrode design to change LC director configuration in the area. We show the comparison of the calculated optical transmittance between the conventional PVA mode and the proposed PVA mode. From the results, we confirm that the optical transmittance of the proposed structure of the PVA cell becomes higher.

Scattering Model of TM Polarized Electromagnetic Wave by Finite I-Shaped Metamaterial Array Based on Surface Current Model (표면 전류를 기반으로 한 유한 배열 I-모양 메타물질의 TM 편파 전자기 산란 모델)

  • Jang, Ji-Woong;Lee, Haeseung;Koh, Il-Suek;Seo, Ilsung;Lee, Yongshik
    • The Journal of Korean Institute of Electromagnetic Engineering and Science
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    • v.25 no.6
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    • pp.664-670
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    • 2014
  • Generally, the properties of metamaterials are analyzed based on the infinite array of the unit cells. In real application of the metamaterial, however, the array has to be finite. Hence, it is important that a method can analyze the effect of the finite array of the metamaterial. In this paper, a model is proposed which can calculate the scattering by a large-size finite array of an I-shaped metamaterial without a full-wave simulation. The proposed model is based on the surface current estimation of each unit cells. The ratio of the current distribution on a finite array of the metamaterial to that of the infinite array of the same metamaterial for a TM polarized incident wave is approximated as a quartic polynomial. The coefficients of the polynomial are a function of the physical dimension of the metallic patch. Hence, the current distribution of the finite metamaterial can be estimated based on the proposed polynomial and the current of the infinite array. The scattered field is calculated by using the surface current model. The proposed model is numerically and experimentally verified by comparing calculated and measured RCS(Radar Cross Section) data.

The Motion Estimator Implementation with Efficient Structure for Full Search Algorithm of Variable Block Size (다양한 블록 크기의 전역 탐색 알고리즘을 위한 효율적인 구조를 갖는 움직임 추정기 설계)

  • Hwang, Jong-Hee;Choe, Yoon-Sik
    • Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea SD
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    • v.46 no.11
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    • pp.66-76
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    • 2009
  • The motion estimation in video encoding system occupies the biggest part. So, we require the motion estimator with efficient structure for real-time operation. And for motion estimator's implementation, it is desired to design hardware module of an exclusive use that perform the encoding process at high speed. This paper proposes motion estimation detection block(MED), 41 SADs(Sum of Absolute Difference) calculation block, minimum SAD calculation and motion vector generation block based on parallel processing. The parallel processing can reduce effectively the amount of the operation. The minimum SAD calculation and MED block uses the pre-computation technique for reducing switching activity of the input signal. It results in high-speed operation. The MED and 41 SADs calculation blocks are composed of adder tree which causes the problem of critical path. So, the structure of adder tree has changed the most commonly used ripple carry adder(RCA) with carry skip adder(CSA). It enables adder tree to operate at high speed. In addition, as we enabled to easily control key variables such as control signal of search range from the outside, the efficiency of hardware structure increased. Simulation and FPGA verification results show that the delay of MED block generating the critical path at the motion estimator is reduced about 19.89% than the conventional strukcture.

An empirical formula for the calculation of lattice parameters of the huntite-borate crystals (Huntite-borate결정의 격자상수 산출을 위한 계산식의 도출)

  • Kiyoshi Shimamura;Valery l. Chani;;Tsuguo Fukuda
    • Journal of the Korean Crystal Growth and Crystal Technology
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    • v.8 no.1
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    • pp.91-96
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    • 1998
  • An empirical relationship which can be calculated to the lattice constants $a_0$ and $c_0$ for the borate crystals with huntite structure were determined. Different compositions of twenty-eight were used for the calculations. These empirical formulas can be used to predict lattice parameters of unknown compositions as a function of the average ionic radii in the trigonal and octahedral sites of the huntite structure.

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Calculation and Allocation of Transmission Loss Under Competitive Power Industry System (경쟁적 전력산업체제에서 송전손실에 대한 계산과 분배)

  • Hahn, T.K.;Kim, J.H.;Kim, S.S.;Park, J.K.
    • Proceedings of the KIEE Conference
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    • 1999.07c
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    • pp.1334-1336
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    • 1999
  • 전력산업의 구조개편으로 기존의 한국전력 독점체제에서 다수의 전력회사로 나누어 질 것이다. 따라서 손실과 공급의 신뢰도 확보 등의 책임분배와 비용분배의 문제가 새로이 나타날 것으로 예상된다. 손실에 대한 비용의 경우 계산법과 이러한 비용을 분배하는 방법이 중요한 문제가 되고 있다. 본 논문은 전력산업구조개편이 이미 이루어진 선진국들의 손실비용의 처리방법을 비교하였다. 그리고 손실에 대한 비용계산 방법을 모의 시스템에 각각 적용시켜보고 결과를 비교하였다.

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An Accurate Closed-form Green's Function for the Planar Structure with General Sources (일반적인 전원을 포함하는 평판구조에 대한 정확한 Closed-form 그린함수)

  • Kang Yeon-Duk;Lee Taek-Kyung
    • Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea TC
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    • v.41 no.6 s.324
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    • pp.79-86
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    • 2004
  • In the integration of Sommerfeld type for space domain Green's function, a accurate closed-from Green's function method provides more exact solution than the typical complex image method and two-level method. The accurate closed-form Green's function method is applied to obtain the space domain Green's functions of planar structures with general sources. Please put the abstract of paper here.