• Journal of Life Science
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• v.33 no.7
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• pp.565-573
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• 2023

In light of the complex interactions between the host animal and its resident gut microbiomes, studies of these microbial communities as a means to improve cattle production are important. This study was conducted to analyze the intestinal microorganisms of Holstein (HT) and Jersey (JS), raised in Korea and to clarify the differences in microbial structures according to cattle species through next-generation sequencing. The alpha-diversity analysis revealed that most species richness and diversity indices were significantly higher in JS than in HT whereas phylogenetic diversity, which is the sum of taxonomic distances, is not significant. Microbial composition analysis showed that the intestinal microbial community structure of the two groups differed. In the both groups, a significant correlation was observed among the distribution of several microbes at the family level. In particular, a highly significant correlation (p<0.0001) among a variety of microbial distributions was found in JS. Beta-diversity analyis was to performed to statistically verify whether a difference exists in the intestinal microbial community structure of the two groups. Principal coordinate analysis and unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering analysis showed separation between the HT and JS clusters. Meanwhile, permutational multivariate analysis of variance (PERMANOVA) revealed that their microbial structures are significantly different (p<0.0001). LEfSe biomarker analysis was performed to discover the differenc microbial features between the two groups. We found that several microbes, such as Firmicutes, Bacilli, Moraxellaceae and Pseudomonadales account for most of the difference in intestinal microbial community structure between the two groups.

• Proceedings of the Korean Society of Medical Physics Conference
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• 2003.09a
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• pp.36-36
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• 2003

목적 : 고감도 형광판과 필름을 이용하여 실시간으로 선량을 측정하여 IMRT 선량분포를 검증하는데 사용하는 가능성을 알아보고자 하였다. 대상 및 방법 : 본 연구에서 개발한 물팬텀은 지름 25cm 아크릴 원통과 원통의 중앙부분에 삽입되는 고감도 형광판으로 구성되어 있다. 이를 사용하여 dose linearity correction factor를 구하기 위해 dmax 지점에서 6MV x-ray를 고감도형광판에 조사하여 blurring correction factor를 구하였다. CCD를 이용하여 고감도 형광판에서 나오는 영상을 수집하였다. 고감도 형광판에서 수집한 영상의 x축 profile은 RTP에서 얻은 profile과 비교하였고, 이온전리함으로 scanning한 데이터를 이용하여 고감도 형광판과 물에서 빛에 의한 산란선 때문에 발생하는 blurring effect를 교정하였다. 여기서 계산된 blurring effect factor를 고감도 형광판에서 수집된 영상에 적용하였다. 결과 : CCD 카메라는 형광판의 전 영역을 감지할 수 있고, 조사시간은 형광판의 중첩된 영상의 선량에 비례하였다. 물팬텀에서 형광판의 blurring effect 는 가우시안 분포로 표현할 수 있었다. 또한 Deconvolution kernel은 원통 팬텀에서 지름 $\pm$5cm 이내의 범위에 위치하였고, 따라서 형광판 영상으로부터의 실제 선량분 포를 뽑아낼 수 있었다. RTP 에서 계산된 선량분포와 blurring correction factor로 교정한 후 중첩시켜 얻은 고감도 형광판 영상의 선량분포는 일치하였다. 결론 : 정기적인 IMRT 선량 검증에 대한 실시간 선량측정 방법이 개발되었다. 고감도 형광판 영상과 CCD 카메라를 사용한 물팬텀으로, IMRT 치료계획에 대한 선량분포를 검증할 수 있는 가능성을 보였다.비의 회전에 의한 오차 보정, 필름의 광학적 밀도에 관한 보정 등 여러 가지 계통적 오차들에 대한 보정들이 선량분포 확인과정의 이해와 그 기준마련에 도움이 되겠지만 우리가 다룬 원점 불일치에 비해서 상대적으로 무시할 수 있었다. 마지막으로 선량분포 확인의 최종목표인 3 차원 선량분포 확인의 실제 적용을 위한 연구가 최적화 알고리듬을 이용하여 실험 중에 있다.\times$5cm, 10$\times$10cm, 15$\times$l5cm, 20$\times$20cm인 경우, 측정하여 얻은 PSF가 0.8%, 0.2%, 0.4%, 0.2%로 약간 높지만, 두 값은 매우 유사한 것으로 나타났다. 그리고, 기존의 BSF를 이용해 구한 TAR과 BJR 25에서 권고하는 PSF를 이용해 구한 TAR을 비교한 결과 field size 에 따라 약 1%-1.5% 정도로 BSF를 이용하여 구한 TAR보다 PSF를 이용하여 구한 TAR이 1.3% 정도 높게 나타났지만, 이것은 두 값의 절대적인 차이일 뿐, 실제로는 PSF를 이용하여 구한 TAR이 측정해서 구한 TAR과는 매우 유사한 값을 보여주고 있다. 결론 : 기존의 BSF를 이용해 구한 TAR과 PSF를 이용해 구한 TAR을 비교하였을 때, 약 1.3% 정도 높게 내고 있지만, 기존의 TAR보다는 PSF를 이용해 구한 TAR이 BJR 25와 잘 일치하고 있으므로 Co-60 원격치료용 방사선 조사장치를 사용할 경우 BSF보다는 PSF를 사용하는 것이 타당한 것으로 사료된다.tokines의 변화는 비록 통계학적인 차이는 없지만 비타민 C를 사용한 환자의 cytokines이 모두 사용하지 않은 환자에 비해 감소하였음을 보였다. 비타민 C는 부작용이 거의 없는 안전한 약으로서 말기 암 환자에서 비타민 C사용은 임상 증상을 호전시키는 데 도움

• Journal of Life Science
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• v.14 no.6 s.67
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• pp.938-950
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• 2004

We used portions of mitochondrial 125 ribosomal RNA gene sequences (339 bp) to investigate the phylogenetic and population genetic characteristics of the Japanese anchovy, Engraulis japonicus, in Korean waters. A total of 35 mtDNA haplotypes were obtained from the samples collected in 3 locations (the southern area of the Yellow Sea, the western coast of Jejudo, and the eastern area of the South Sea) in Korean waters. One haplotype, AN8T103, obtained from the southern area of the Yellow Sea, was formed according to an independent phylogenetic individual in the PAUP analysis, which was separated from the others by a $0.2-4.1\%$ sequence divergence. This distinct haplotype appeared to be one that was carried by immigrants from another study area, but further study is necessary. Genetic divergence, except for AN8T103, was moderate to substantial $(0.2-3.8\%)$ and nucleotide diversity within populations was 0.015 for Yellow Sea, 0.013 for Jejudo, and 0.D15 for South Sea, respectively. The female gene flow was substantial or high (Nm=25.5-36.4), and the genetic distances between regions were not statistically significant $(P>0.01)$. These results indicated that the Japanese anchovy populations occurring in Korean waters were consisted of individuals randomly dispersed over geographic areas.

• Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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• 2006.05a
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• pp.1150-1155
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• 2006

대부분의 도시지역은 불투수면적 비율이 상당히 높은 특징으로 인한 유출용적 및 첨두유출량의 증가와 외수위보다 낮은 지반고의 지형학적 특징으로 인한 내수배제의 불량으로, 저지대의 침수위험도가 상당히 높다. 이러한 이유로, 빈도별 설계홍수량을 산정하여 침수위험지역을 파악하고 관리하는 공간적인 치수관리가 이루어지고 있지만, 효율적인 치수관리를 위해서는 공간적인 측면뿐 아니라, 침수위험지역 내 침수발생의 시간적인 측면도 고려하는 것이 필요하다. 본 연구에서는 침수위험지역 내 내수침수발생에 대하여 공간적.시간적으로 살펴보고, 내수침수발생 위험지역 및 우선관리지역을 선정하였다. 대상유역으로는 안양천 유역에서 대부분의 침수가 발생하는 서울시에 포함된 안양천 하류유역으로 하였다. 서울시에 포함된 안양천 하류지역에서 내수침수발생의 주원인으로는 외수위보다 낮은 지반고와 배수계통의 통수능력 부족으로 나타나고 있어, 이들 지역의 침수위험지역을 파악하기 위해 하도 및 관거의 유출해석에 우수한 SWMM 모형의 EXTRAN block을 이용하여 모의를 실시하고 맨홀이 월류되는 지역을 내수침수 위험지역으로 선정하였다. 각 빈도별 지속시간별 모의결과, 목감천 하류부의 고척 1동, 신월 1동, 화곡 2동, 도림천과 봉천천, 대방천이 만나는 구로동, 대림 1동, 대방동에서 침수가 발생하기 시작하였다. 이들 지역은 또한 10년에서 30년 빈도별 모의에서도 모두 침수위험이 높은 지역으로 선정되어, 우선관리지역으로 선정하였다. 우선관리지역의 선정은 홍수예.경보 측면에서는 주민의 신속한 대피와 같은 홍수대처능력과 치수관리측면에서는 소요되는 자원의 효율적 배분을 기대할 수 있을 것으로 판단된다. 대상으로 홍수범람모의시스템을 구축하여 분석결과를 피해지역주민 및 관련기관 실무자들에게 제공함으로써 시간과 공간에 구애받지 않는 재해관리와 신속한 재해 상황 대처가 가능해 질 것으로 사료된다.는 또 다른 형태의 주제도라고 볼 수 있으며, 이를 구축하기 위해서는 자료변환 및 가공이 필요하다. 즉, 각 상습침수지구에 필요한 지형도는 국립지리원에서 제작된 1:5,000 수치지형도가 있으나 이는 자료가 방대하고 상습침수지구에 필요하지 않은 자료들을 많이 포함하고 있으므로 상습침수지구의 데이터를 인터넷을 통해 서비스하기 위해서는 많은 불필요한 레이어의 삭제, 서비스 속도를 고려한 데이터의 일반화작업, 지도의 축소.확대 등 자료제공 방식에 따른 작업 그리고 가시성을 고려한 심볼 및 색채 디자인 등의 작업이 수반되어야 하며, 이들을 고려한 인터넷용 GIS기본도를 신규 제작한다. 상습침수지구와 관련된 각종 GIS데이타와 각 기관이 보유하고 있는 공공정보 가운데 공간정보와 연계되어야 하는 자료를 인터넷 GIS를 이용하여 효율적으로 관리하기 위해서는 단계별 구축전략이 필요하다. 따라서 본 논문에서는 인터넷 GIS를 이용하여 상습침수구역관련 정보를 검색, 처리 및 분석할 수 있는 상습침수 구역 종합정보화 시스템을 구축토록 하였다.N, 항목에서 보 상류가 높게 나타났으나, 철거되지 않은 검전보나 안양대교보에 비해 그 차이가 크지 않은 것으로 나타났다.의 기상변화가 자발성 기흉 발생에 영향을 미친다고 추론할 수 있었다. 향후 본 연구에서 추론된 기상변화와 기흉 발생과의 인과관계를 확인하고 좀 더 구체화하기 위한 연구가 필요할 것이다.게 이루어질 수 있을 것으로 기대된다.는 초과수익률이 상

• Korean Journal of Microbiology
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• v.50 no.1
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• pp.8-14
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• 2014

The objective of this work is to investigate and compare several functional properties of lactic acid bacteria (LAB), Lactobacillus casei SK-7 isolated from home-made yogurt and Lactobacillus bulgaricus YK-11 from commercial yogurt. Initially, physiological and biochemical properties of SK-7 and YK-11 were characterized. Phylogenetic analysis using 16S rRNA sequencing were performed to identify the strains, and the strain could be assigned to Lactobacillus casei and Lactobacillus bulgaricus, designated as L. casei SK-7 and L. bulgaricus YK-11. Phylogenetic tree of SK-7 and YK-11 was plotted based on 16S rRNA sequence comparisons. Production of lactic acid and organic acid, and pH changes in the cultures of SK-7 and YK-11 were monitored during 72 h. During the incubation period, several functional properties of L. casei SK-7 and L. bulgaricus YK-11 were examined. L. casei SK-7 and L. bulgaricus YK-11 cultures eliminated 93.9% and 88.2% of nitrite, respectively. Antioxidant activity of cultural supernatants of SK-7 and YK-11 were 62.6%, 54.9%, and activity of ${\beta}$-galactosidase were 14.9 units/mg and 13.1 units/mg, respectively. The antimicrobial activities were examined with 20-fold concentrated culture supernatants from the cultures of SK-7 and YK-11. The activities of SK-7 supernatants were clearly observed against all microorganisms in this work, whereas no activities were observed in YK-11 supernatants. Although it might be conducted additional functional research, functional properties of LAB isolated from home-made yogurt have been shown to be better than those of commercial yogurt in this work.

• Journal of Korean Medical classics
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• v.13 no.1
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• pp.146-183
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• 2000

통과이상적연구(通過以上的硏究), 장상한학술적성숙기(將傷寒學術的成熟期), 칙지명대여청대관여상한의학사적내용정리(則至明代與淸代關與傷寒醫學史的內容整理) 여하(如下). 1. 명청시대적시대배경사상한학적내용갱풍부(明淸時代的時代背景使傷寒學的內容更豊富), 촉진상한학술적발전(促進傷寒學術的發展) 병차출현료흔다관여상한적저작(幷且出現了?多關與傷寒的著作), 단실제상야출현료상한론내용적중복여지론술일반부분(但實際上也出現了傷寒論內容的重複與只論述一般部分), 혹저자립안조잡적처방지폐단(或著者立案粗雜的處方之弊端). 차기우출현각종상한학파적리유(此期又出現各種傷寒學派的理由), 시인위당시류행적사조(是因爲當時流行的思潮), 칙정주리학적영향여명대문단부고(則程朱理學的影響與明代文壇復古), 의고적추향(擬古的趨向), 환유금원시대적백가쟁오등(還有金元時代的百家爭嗚等), 성료형성상한학파적기초(成了形成傷寒學派的基礎). 2. 위료불실거상한론적본래의식(爲了不失去傷寒論的本來意識), 주장정리화고정원문회부왕숙화이전모양적착간중정파시왕안도기료개단(主張整理和考訂原文恢復王叔和以前模樣的錯簡重訂派是王安道起了開端), 방유집확대료기의식(方有執擴大了其意識). 유창여침명종시대표저학파학자(喩昌與沈明宗是代表這學派學者), 장로(張?) 정응모(程應?) 주양준(周揚俊) 오겸등수료저학설(吳謙等隨了這學說). 3. 주장(主張)'존왕(尊王)(숙화(叔和))찬성(贊成)(무기(无己))'적유호구론파(的維護舊論派), 주장료불능수변개상한론삼음삼양편적배렬여순서(主張了不能隨變改傷寒論三陰三陽篇的排列與順序), 문자(文字), 구문(句文), 문장(文章), 고세식(高世?), 진념조등인(陳念祖等人). 4. 주장상한론적정수재어변증론치(主張傷寒論的精髓在於辨證論治), 선우운용칙능득상한핵심리론적학파시변증론치학파(善于運用則能得傷寒核心理論的學派是辨證論治學派). 저학파분사개계통(這學派分四?系統), 이처방수집증상적의가유허굉(以處方收集證狀的醫家有許宏), 가금(柯琴), 서대춘(徐大椿); 이치법수집증상적의가유오인구(以治法收集證狀的醫家有吳人駒), 우이(尤怡); 이분유륙경찰증상적의가유진념조(以分有六經察證狀的醫家有陳念祖), 포성(包誠); 이증상분류증후적의가유류순(以證狀分類證候的醫家有劉純), 왕긍당(王肯堂), 진지정(秦之楨), 침금오등인(沈金鰲等人). 5. 회통파유량종류형(?通派有兩種類型), 일시수통상한여온병적학파(一是誰通傷寒與溫病的學派), 간칭회통파(簡稱?通派), 대표의가유도화(代表醫家有陶華), 오정(吳貞), 유근초등인(兪根初等人), 령일개유회통중의여서의적립장상해석상한적의가당종해(?一?有?通中醫與西醫的立場上解釋傷寒的醫家唐宗海). 6. 경전학파시이상한론위보귀적경전래인식(經典學派是以傷寒論爲保貴的經典來認識), 병차지유숭상차경여사상적학파(幷且持有崇尙此經與思想的學派), 차리분량개편우원문적고증래연구적경전고증파(此里分兩?偏于原文的考證來硏究的經典考證派), 화인위지유상한론(和認爲只有傷寒論), 재능총괄치료외감병(才能總括治療外感病), 부정온병학설병배척적경전림상파(否定溫病學說幷排斥的經典臨床派).

• Journal of Life Science
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• v.15 no.4 s.71
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• pp.607-612
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• 2005

Heat shock protein 70 (HSP70) is a multigene family composed of constitutively expressed members(Hsc70) and stress-inducible members (Hsp70). In the mammalian nervous system, a considerable amount of HSPs is also synthesized under normal conditions suggesting that they play an important role in the metabolism of unstressed cells. In this study we examined the expression of Hsp70 in the synapses of rat cerebellar neurons. Immunohistochemistry using specific antibodies revealed that both Hsp70 and Hsc70 are expressed in the cerebellar tissue, with strongest expression in Purkinje cells followed by granule cells. Neurons in deep cerebellar nuclei were also intensely stained by Hsp70 antibody. Immunocytochemical stainings of cultured cerebellar cells showed that Hsp70 is expressed in both Purkinje and granule cells. The expression was punctate in the soma and along dendritic trees, and the punctae were colocalized with those of PSD95, a postsynaptic marker. Immunoblotting also indicates that Hsp70 is associated with the postsynaptic density fraction. Taken together, our results indicate that the Hsp70 is expressed in cerebellar neurons in normal conditions, and that some are localized in the synapses.

• Weed & Turfgrass Science
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• v.5 no.3
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• pp.111-125
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• 2016

Cordgrass (Spartina spp.) is recognized as a highly invasive plant in estuaries throughout the world because of remarkable versatility and resiliency, significant reproduction, strong adaptability, rapid spreading, and vigorous growth. In this review, therefore, to provide insights on the effective management practices, the previous research works were summarized and discussed. Spartina spp. is a perennial halophyte, warm-season (C4) grass that reproduces both sexually through seeds and asexually by rhizomes. Management strategies for cordgrass have included various physical, biological, and chemical controls. Herbicides are usually the most cost-effective means of control. Currently, glyphosate, imazapyr, fluazifop and haloxyfop have been practically used. To improve the control efficacy, a combination of two more than methods (example, mowing-spraying) is needed to be applied consistently every year for at least 3 to 4 years and to be sprayed with enough dry time (>4-6 hr) at an early growth stage (before flowering). Consistently repeated application of same herbicide have to be avoided to prevent an unexpected emergence of herbicide-resistant lines. On the other hand, Spartina spp. have many positive functions for agricultural and eco-engineering purposes. Thus, we have to give more intensive research for effectively managing advantages and disadvantages of Spartina plantations.

• Journal of Plant Biotechnology
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• v.41 no.1
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• pp.19-25
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• 2014

The total production volume has been sharply increased from year 2008 in Gyeongnam province, South Korea by the policy of preservation and promotion of indigenous balloon flower germ lines. In an attempt to assist the Gyeongnam province's policy, in this study, we tried to establish a technique to differentiate the indigenous balloon flower germ lines with those collected within South Korea and China. Our preliminary results indicated that RAPD analyses with five different primers exhibited high frequency of polymorphic DNA bands up to 76.9% and phylogenetic tree indicated that some of the indigenous lines can be easily differentiated with others. However, it was suggested that more advanced techniques such as single nucleotide polymorphic markers need to be developed in particular, by using extra-chromosomal DNA.

• Journal of Life Science
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• v.29 no.5
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• pp.524-529
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• 2019

Medicinal plants resources are becoming important assets since their usages have been expanded to the development of functional foods for human health, cosmetics and pharmaceutical industries. However, their phylogenetic origins and names are different from each country and quite often they are mixed each other resulting in the confusion for consumers. Particularly when they are very similar based on their morphological characteristics and distributed, it is extremely difficult to differentiate their origins even by specialists. Therefore, identification of each plant species is important for standardizing herbal medicine. Thistle is a medicinal and perennial plant. Obtaining information about the genetic diversity of plant populations is highly important for conservation and germplasm utilization. Although thistle is an important medicinal plant species registered in South Korea, no molecular markers are currently available to distinguish from other similar species from different countries. In this study, we developed single nucleotide polymorphism (SNP) markers derived from chloroplast genomic sequences to identify distinct Korean-specific thistle species via high resolution melting (HRM) curve analyses. We performed molecular authentication of four different kinds of thistle species from different regions using DNA sequences in the trnL-F and matK chloroplast intergenic region. The SNP markers developed in this study are useful for rapidly identifying specific thistle species from different country.