• Title/Summary/Keyword: 계층적 군집방법

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Extraction of higher yeast protein-protein interaction with hierarchical clustering from textual data (계층적 군집화를 통한 이스트(Yeast) 단백질의 고차 상호작용 추출)

  • 엄재홍;장병탁
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2002.10d
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    • pp.364-366
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    • 2002
  • 본 논문에서는 텍스트 형태로 구성된 특정 생물에 대한 문헌 데이터에서 해당 생물의 주요 단백질간의 이진(binary) 관계를 추출하여 이들을 특징별로 계층적으로 군집화 함으로써 특정 현상을 나타내는 단백질간의 주요 관계를 추출하는 방법을 제시한다. 텍스트 데이터에서 단백질간의 이진관계는 기본적인 데이터마이닝 기법을 사용하여 연관규칙(association rule)의 형태로 추출하게 된다. 본 논문에서는 실험을 위해 PUBMED에서 추출한 Yeast의 주요 단백질간의 관계를 포함하고 있는 논문 데이터인 MEDLINE Abstract와 몇몇 공개 데이터베이스를 사용하였다. 실험 결과 SH3와 같이 기존에 알려진 단백질간의 단일 관계를 추출하는 것 이외에 이러한 관계들을 이용하여 클러스터링을 행한 결과 공통 현상에 작용하는 주요 단백질간의 관계들이 서로 군집화 됨을 확인 할 수 있었다. 또한 단순 이진관계가 아닌 클러스터링을 이용한 보다 상위 단계에서 단순 규칙들 간의 관계를 살펴봄으로써 단백질간의 이진관계를 추출하기 위한 데이터로 사용한 문헌 데이터에 나타나 있지 않은 1차 이상의 관계를 고찰 해 볼 수 있었다. 논문에서는 규칙 추출의 전체 과정과 함께 사용된 추출 시스템의 각 부와 데이터에 대한 설명을 다룬다.

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Medical Document Clustering using the Growing Hierarchical SOM (신경망 GHSOM을 이용한 의료 문헌 정보의 군집화)

  • Heo, Jin-Seok;Kim, In-Cheol
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2002.04a
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    • pp.519-522
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    • 2002
  • 일반적으로 PubMed와 같은 인터넷을 이용한 대규모 의료 문헌정보 검색시스템에서 포괄적인 주제어나 간결한 주제어를 이용한 검색을 시도할 경우, 종종 매우 다양한 세부주제의 문헌리스트들이 다량으로 검색된다. 이러한 경우 이용자는 실제로 본인이 원했던 세부주제에 부합되는 문헌들을 찾기 위해서는 검색결과로 주어진 긴 문헌리스트상의 문헌 하나하나에 대해 다시 문헌제목이나 혹은 요약 등의 내용을 직접 읽어보고 내용을 확인하여야 한다. 이러한 작업은 매우 번거럽고 시간과 노력을 많이 필요로 한다. 따라서 본 논문에서는 이러한 노력을 줄이기 위한 한 가지 방안으로, PubMed 시스템의 주제어 검색결과로 주어진 문헌들에 대해 내용의 유사성과 차별성에 따라 자동으로 몇 개의 그룹으로 나누어주는 군집화시스템 MedCluster의 설계와 구현에 대해 소개한다. MedCluster의 큰 특징은 기존의 문서 군집화 방법과는 다른 신경망 GHSOM을 이용한 군집화 방법을 사용하는 점이다. GHSOM은 미리 문서 그룹의 개수를 정해줄 필요가 없고 다양한 레벨의 문서 그룹들을 얻을 수 있는 계층적 군집화를 이루어낸다는 장점을 가지고 있다. 본 논문에서는 신경망 GHSOM의 구조와 특성에 대해 간략히 살펴보고, GHSOM을 채용한 의료문헌 군집화시스템 MedCluster의 설계와 구현에 대해 설명한다.

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Cluster analysis by month for meteorological stations using a gridded data of numerical model with temperatures and precipitation (기온과 강수량의 수치모델 격자자료를 이용한 기상관측지점의 월별 군집화)

  • Kim, Hee-Kyung;Kim, Kwang-Sub;Lee, Jae-Won;Lee, Yung-Seop
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • v.28 no.5
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    • pp.1133-1144
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    • 2017
  • Cluster analysis with meteorological data allows to segment meteorological region based on meteorological characteristics. By the way, meteorological observed data are not adequate for cluster analysis because meteorological stations which observe the data are located not uniformly. Therefore the clustering of meteorological observed data cannot reflect the climate characteristic of South Korea properly. The clustering of $5km{\times}5km$ gridded data derived from a numerical model, on the other hand, reflect it evenly. In this study, we analyzed long-term grid data for temperatures and precipitation using cluster analysis. Due to the monthly difference of climate characteristics, clustering was performed by month. As the result of K-Means cluster analysis is so sensitive to initial values, we used initial values with Ward method which is hierarchical cluster analysis method. Based on clustering of gridded data, cluster of meteorological stations were determined. As a result, clustering of meteorological stations in South Korea has been made spatio-temporal segmentation.

Supporting Two Layer Bandwidth Allocation for MPEG Video on ATM Networks (ATM 망에서의 MPEG 비디오를 위한 2계층 대역폭 할당 기법)

  • 박성구;황종선
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2004.04a
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    • pp.841-843
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    • 2004
  • 비디오 스트링의 표준이라 할 수 있는 MPEG은 데이터 발생량의 변화가 심한 군집성(bursty) 트래픽으로 망의 대역폭을 효율적으로 사용하는 전송방식을 구현하기가 매우 어렵다. 본 연구에서는 최소한의 품질을 보장하면서도 망 자원의 효율적 이용을 위하여 2계층 구조의 새로운 대역폭 할당 기법을 제안하였다. 사용자에게 최소한의 품질을 보장하면서 망에 대역폭의 여유가 있는 경우 보다 고품질의 서비스가 가능토록 하는 방안으로 ATM망의 CBR 클래스와 VBR 클래스를 복합적으로 사용하는 방법을 제안하였다. 이의 구현을 위하여 2계층 구조의 MPEG 부호화기를 설계하였고 모의실험으로 기존의 단일 계층 CBR 클래스와 비교 평가하였다.

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A Study on Fuzzy Logic based Clustering Method for Radar Data Analysis (레이더 데이터 분석을 위한 Fuzzy Logic 기반 클러스터링 기법에 관한 연구)

  • Lee, Hansoo;Kim, Eun Kyeong;Kim, Sungshin
    • Journal of the Korean Institute of Intelligent Systems
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    • v.25 no.3
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    • pp.217-222
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    • 2015
  • Clustering is one of important data mining techniques known as exploratory data analysis and is being applied in various engineering and scientific fields such as pattern recognition, remote sensing, and so on. The method organizes data by abstracting underlying structure either as a grouping of individuals or as a hierarchy of groups. Weather radar observes atmospheric objects by utilizing reflected signals and stores observed data in corresponding coordinate. To analyze the radar data, it is needed to be separately organized precipitation and non-precipitation echo based on similarities. Thus, this paper studies to apply clustering method to radar data. In addition, in order to solve the problem when precipitation echo locates close to non-precipitation echo, fuzzy logic based clustering method which can consider both distance and other properties such as reflectivity and Doppler velocity is suggested in this paper. By using actual cases, the suggested clustering method derives better results than previous method in near-located precipitation and non-precipitation echo case.

Study on Scaling Exponent for Classification of Regions using Scaling Property (스케일 성질을 이용한 군집 지역에서의 스케일 인자에 대한 연구)

  • Jung, Younghun;Kim, Sunghun;Ahn, Hyunjun;Heo, Jun-Haeng
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2015.05a
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    • pp.504-504
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    • 2015
  • 수공구조물을 설계하기 위해서는 설계수문량을 빈도해석을 통해 산정할 수 있다. 빈도해석 중 지점빈도해석을 보완한 지역빈도해석을 적용하기 위해서는 군집분석을 통한 지역구분이 무엇보다 중요하다. 또한 스케일 성질(scaling property)은 강우의 시 공간적 특성을 지속기간별 관측된 강우자료를 이용하여 재현기간에 대한 지속기간의 함수로 강우의 IDF곡선을 제시할 수 있는 방법이다. 따라서 스케일 성질을 통해 군집된 지역에서의 강우자료에 적용하여 스케일 인자(scaling exponent)를 추정한 후 수문학적 동질성을 통계적 특성으로 설명하고자 한다. 본 연구를 수행하기에 앞서 군집 분석은 4개의 군집방법(평균연결법, Ward방법, Two-Step방법, K-means방법)을 적용하였고, 한강유역에 위치한 104개의 강우지점은 4개의 지역으로 구분하는 것이 적절하다고 판단되어 비계층적 방법인 k-means방법을 이용하여 지역을 구분하였다. 본 연구에서는 군집된 결과를 바탕으로 4개의 지역으로 구분된 지역에 포함된 강우지점을 대상으로 스케일 인자를 추정하고 수문학적 동질성을 통계적 방법으로 제시하고자 한다.

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Non-hierarchical Clustering based Hybrid Recommendation using Context Knowledge (상황 지식을 이용한 비계층적 군집 기반 하이브리드 추천)

  • Baek, Ji-Won;Kim, Min-Jeong;Park, Roy C.;Jung, Hoill;Chung, Kyungyong
    • Journal of the Institute of Convergence Signal Processing
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    • v.20 no.3
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    • pp.138-144
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    • 2019
  • In a modern society, people are concerned seriously about their travel destinations depending on time, economic problem. In this paper, we propose an non-hierarchical clustering based hybrid recommendation using context knowledge. The proposed method is personalized way of recommended knowledge about preferred travel places according to the user's location, place, and weather. Based on 14 attributes from the data collected through the survey, users with similar characteristics are grouped using a non-hierarchical clustering based hybrid recommendation. This makes more accurate recommendation by weighting implicit and explicit data. The users can be recommended a preferred travel destination without spending unnecessary time. The performance evaluation uses accuracy, recall, F-measure. The evaluation result was shown 0.636 accuracy, 0.723 recall, and 0.676 F-measure.

Exploratory Analysis of Gene Expression Data Using Biplot (행렬도를 이용한 유전자발현자료의 탐색적 분석)

  • Park, Mi-Ra
    • The Korean Journal of Applied Statistics
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    • v.18 no.2
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    • pp.355-369
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    • 2005
  • Genome sequencing and microarray technology produce ever-increasing amounts of complex data that needs statistical analysis. Visualization is an effective analytic technique that exploits the ability of the human brain to process large amounts of data. In this study, biplot approach applied to microarray data to see the relationship between genes and samples. The supplementary data method to classify new sample to known category is suggested. The methods are validated by applying it to well known microarray data such as Golub et al.(1999), Alizadeh et al.(2000), Ross et al.(2000). The results are compared to the results of several clustering methods. Modified graph which combine partitioning method and biplot is also suggested.

Object Image Classification Using Hierarchical Neural Network (계층적 신경망을 이용한 객체 영상 분류)

  • Kim Jong-Ho;Kim Sang-Kyoon;Shin Bum-Joo
    • Journal of Korea Society of Industrial Information Systems
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    • v.11 no.1
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    • pp.77-85
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    • 2006
  • In this paper, we propose a hierarchical classifier of object images using neural networks for content-based image classification. The images for classification are object images that can be divided into foreground and background. In the preprocessing step, we extract the object region and shape-based texture features extracted from wavelet transformed images. We group the image classes into clusters which have similar texture features using Principal Component Analysis(PCA) and K-means. The hierarchical classifier has five layes which combine the clusters. The hierarchical classifier consists of 59 neural network classifiers learned with the back propagation algorithm. Among the various texture features, the diagonal moment was the most effective. A test with 1000 training data and 1000 test data composed of 10 images from each of 100 classes shows classification rates of 81.5% and 75.1% correct, respectively.

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Proximate Word Filtering by Hierarchical Clustering (계층적 군집화를 이용한 근사 단어 필터링 기법)

  • Kim, Sung-Hwan;Cho, Hwan-Gue
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2012.04a
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    • pp.1101-1104
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    • 2012
  • 단어 필터링은 유해정보를 차단위한 기본적인 기능이다. 그러나 악의적인 사용자는 필터링 시스템을 우회하기 위하여 금지 단어에 의도적인 변형을 가한다. 이에 대응하기 위해 일정 오류를 허용하여 필터링을 수행하는 근사 단어 필터링이 있다. 근사 단어를 검색하기 위한 문자열 색인 방법으로는 주로 기준 단어(Pivot)을 이용한 유클리드 공간에의 사상을 이용하는데, 이는 단어 필터링에 응용하기에는 근본적인 구조상의 한계점이 있다. 본 논문에서는 필터링 대상이 되는 단어 집합 내에서 군집화를 수행하여 계층적인 자료구조를 구성하고, 단어 필터링을 위한 필터링 질의(Filtering query)를 정의한 뒤 그에 적합한 탐색 상의 적용에 관하여 설명한다. 실험 결과 기존의 기준 단어(Pivot)을 이용한 색인 기법에 비하여 16.9%~26.6%의 탐색 속도 향상을 확인할 수 있었다.