Microarray is a new technique for gene expression experiment, which has gained biologist's attention for recent years. This technology enables us to obtain hundreds and thousands of expression of gene or genotype at once using microarray Since it requires manual work to analyze patterns of gene expression, we want to develop an effective and automated tools to analyze microarray image. However it is difficult to analyze DNA chip images automatically due to several problems such as the variation of spot position, the irregularity of spot shape and size, and sample contamination. Especially, one of the most difficult problems in microarray analysis is the block and spot addressing, which is performed by manual or semi automated work in all the commercial tools. In this paper we propose a new algorithm to address the position of spot and block using a new concept of regular structure grid searching. In our algorithm, first we construct maximal I-regular sequences from the set of input points. Secondly we calculate the rotational angle and unit distance. Finally, we construct I-regularity graph by allowing pseudo points and then we compute the spot/block address using this graph. Experiment results showed that our algorithm is highly robust and reliable. Supplement information is available on http://jade.cs.pusan.ac.kr/~autogrid.
Park, Ju-Hyun;Son, Hui-Jeong;Lim, Tak-Hyoung;Lee, Seung-Bok;Yun, Ki-Seok;Yoon, Soon-Gil;Shin, Dong-Ryul;Song, Rak-Hyun
Journal of the Korean Electrochemical Society
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v.10
no.1
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pp.7-13
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2007
We synthesized and investigated $La_{0.75}Sr_{0.25}FeO_3$ by Glycine Nitrate Process(GNP) method used as cathode materials for SOFC(solid oxide fuel cell). Optimized amount of glycine is 3.17 mol. ICP elemental composition analysis indicated that the stoichiometry of the synthesized powders have nearly nominal values. SEM images and XRD patterns reveal that the synthesized powder has uniform size distribution and high degree of crystallinity. The sample powders were isostatically pressed to form a pellet. The green body was sintered at $1200^{\circ}C$ and the relative density of the sintered specimens were measured by Archimedes mettled. We measured electrochemical performance of LSF by AC impedance spectroscopy. Resistance of LSF shows lower value than that of LSM throughout all temperature region. The anode-supported solid oxide fuel cell showed a performance of $342mW/cm^2(0.7V,\;488mA/cm^2)$ at $750^{\circ}C$. The electrochemical characteristics of the single cell were examined by at impedance method.
Journal of the Korean Institute of Illuminating and Electrical Installation Engineers
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v.13
no.4
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pp.152-159
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1999
This paper describes the rmtion characteristics of a particle in GIS under AC voltage. To measure the motion characteristics of the particle, a model gas chamber and parallel plain electrodes were designed and manufactured lift-off voltages of wire and spherical particles on the electrode were calculated and rreasured, and electric charge was calculated. By using a high speed carrera, the rmtion characteristics of various particles with aw}ied voltages, such as motion pattern, lift-off time, lift-off height, were analyzed 1be lift-off voltages were greatly affected by diarreters of wire and spherical particles. At voltage around lift-off voltage, the stand-up particle in vertical state rmved up and down between electrodes and the height of the lift-off particle was low. At voltage around breakdown voltage, the particle repeated vertical rotation a few times while they were being lifted off, and then, they were floating between the electrodes.trodes.
Korean Journal of Air-Conditioning and Refrigeration Engineering
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v.15
no.6
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pp.533-542
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2003
This study aims to propose a simplified mathematical model for calculating vertical air temperature distribution in a four-sided atrium. In the first stage of the mathematical modeling, the computer model combined zonal model and solar radiation model using Monte Carlo method and Ray tracing technique went through a computer simulation with architectural variables applied to a four-sided atrium in summer. In the next stage, Curve Expert, a computer program that gets the most suitable solution ac-cording to the least squares method, is used to analyze the results of the computer simulation and to derive the mathematical model. The accuracy of the mathematical model was evaluated through a comparison of calculation results from a mathematical model and computer simulation. In this validation step using the least square method, the R2 value of the Zones 1, 2 and 3 showed higher than 0.945. Zone 4 has an R2 value of 0.911, lower than the previous three zones. However the relative error was below 0.5%, which is considered very small.
This paper describes a current sensor for precision current measurement of an electronic watt-hour meter that is going to install in houses in the future. As the current sensor is based on an cored principle (the Rogowski principle) it is not subject to usual limitations of saturation and non-linearity of general current transformers. An advantage of the developed current sensor is that non-linearity error in low current range is improved and the construction can be kept simple using an air core. We present a magnetic field analysis of the sensor using a finite-element solver. We compared the measured values versus the calculated values.
Journal of the Korean Society for Aeronautical & Space Sciences
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v.31
no.1
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pp.97-103
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2003
Numerical research has been done for the transverse jet behind a rearward-facings step in turbulent supersonic flow without chemical reaction. Purpose of transverse jet is to enhance mixing of the fuel in the combustor. Two-dimensional unsteady flowfields generated by slot injection into supersonic flow are numerically simulated with the Navier-Stokes equations with two-equation k-$\varepsilon$ turbulence model. Numerical method is used high-order upwind TVD scheme. Eight cases are computed for different slot momentum flux ratios and slot position at downstream of the step. The flow is very similar to the cavity flow, because the jet acts as an obstacle. The numerical results thus show the periodic phenomenon.
Journal of the Korean Institute of Illuminating and Electrical Installation Engineers
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v.18
no.3
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pp.149-155
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2004
This paper presents how to find proper operating points of FACTS devices to enhance the steady-state security level considering line contigency analysis. Three generic types of FACTS devices such as series controllers, shunt controllers, and series-shunt controllers are introduced and applied to moximize a security margin and to minimize security indices. Security indices related to line flows and bus voltages are utilized and minimized iteratively in this paper. Contingency analysis is performed to detect the most severe single line fault. In various load conditions, FACTS devices are tested to establish appropriate preventive or corrective action without generation re-dispatching or load shedding. The FACTS operation scheme is verified on the IEEE 57-bus system in a line-faulted contingency.
The Magazine of the Society of Air-Conditioning and Refrigerating Engineers of Korea
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v.17
no.6
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pp.696-707
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1988
This study simulates a typical solar system using the transient simulation program TRNSYS, and calculates the maximum cooling load of the model room of $50m^2$. In this study, energy rate control method is used in calculating a maximum cooling load. On the ground of the maximum cooling load of the model room, the variables that have an effect on the solar collection performance of the solar system are made a selection. Also in this study the trend of the solar collection performance is shown as the variables change. The results show that the variables which have an effect on the collection performance are collector area, collector mass flow rate, collector slope and the volume of storage tank, and the optimal value of Ac/Vt is not constant but varies as the collector area and the collector mass flow rate. Also the results show that for cooling system the optimal value of the collector slope is latitude minus $15^{\circ}$ during the seasonal operations, and twenty percent of the maximum cooling load is saved with the aid of the solar energy.
Kim, Tae-Hyeon;Seo, Jang-Cheol;Im, Jeong-Uk;Mun, Seung-Il;Park, Jong-Geun;Han, Byeon-Mun
The Transactions of the Korean Institute of Electrical Engineers A
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v.48
no.7
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pp.824-831
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1999
This paper presents new methods to resolve the important limits in the decoupled UPFC model for power flow, by which conventional power flow program can be performed with addition of two buses per one UPFC. In order to operate UPFC to the desired value, the series voltage and shunt current of UPFC should be computed. So a method of calculating these by simple equations after power flow is derived. However, the calculated magnitude of series voltage and/or shunt current of UPFC may not be allowed because of the UPFC limit \ulcorner to the ratings of inverters. In this case, the active power and the reactive power (or the voltage magnitude) of UPFC buses should be revised to resolve the limit. This paper proposes the Newton Raphson method to resolve these limits. Particularly, when resolving the series voltage magnitude, three strategies are proposed according to the priority of the active power and the reactive power (or the voltage magnitude).
The objectives of this paper are to develop the structural condition evaluation technique using Falling Weight Deflectometer deflections and propose the structural condition criteria for asphalt pavements. To figure out correlation between surface deflections and critical pavement responses, the synthetic database has been established using the finite element pavement structural analysis program. A regression approach was adopted to develop the pavement response model that can be used to compute the stresses and strains within pavement structure using the FWD deflections. Based on the pavement response model, the procedure for assessing the structural condition of pavement layers was proposed in this study. To validate the condition evaluation procedure for asphalt pavements, the FWD test, dynamic cone penetrometer test, and repeated triaxial compression test were conducted on 11 sections of national highway and 8 sections of local road. Test results indicate that the tensile strain at the bottom of AC layer and AC elastic modulus were good indicators for estimating the stiffness characteristics of AC layer. For subbase layer, the BDI value and compressive strain on top of the subbase layer were appropriate to predict the structural capacity of subbase layer. The BCI value and compressive strain on top of the subgrade were found to be good indicators for evaluating the structural condition of the subgrade. The evaluation criteria for structural condition in asphalt pavements was also proposed in this paper.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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