Ha, Woo-Seok;Kim, Soo-Mee;Park, Min-Jae;Lee, Dong-Soo;Lee, Jae-Sung
Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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v.43
no.5
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pp.459-467
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2009
Purpose: The maximum likelihood-expectation maximization (ML-EM) is the statistical reconstruction algorithm derived from probabilistic model of the emission and detection processes. Although the ML-EM has many advantages in accuracy and utility, the use of the ML-EM is limited due to the computational burden of iterating processing on a CPU (central processing unit). In this study, we developed a parallel computing technique on GPU (graphic processing unit) for ML-EM algorithm. Materials and Methods: Using Geforce 9800 GTX+ graphic card and CUDA (compute unified device architecture) the projection and backprojection in ML-EM algorithm were parallelized by NVIDIA's technology. The time delay on computations for projection, errors between measured and estimated data and backprojection in an iteration were measured. Total time included the latency in data transmission between RAM and GPU memory. Results: The total computation time of the CPU- and GPU-based ML-EM with 32 iterations were 3.83 and 0.26 see, respectively. In this case, the computing speed was improved about 15 times on GPU. When the number of iterations increased into 1024, the CPU- and GPU-based computing took totally 18 min and 8 see, respectively. The improvement was about 135 times and was caused by delay on CPU-based computing after certain iterations. On the other hand, the GPU-based computation provided very small variation on time delay per iteration due to use of shared memory. Conclusion: The GPU-based parallel computation for ML-EM improved significantly the computing speed and stability. The developed GPU-based ML-EM algorithm could be easily modified for some other imaging geometries.
Respiratory viruses are one of the most infectious agent in human. Six different respiratory tract viruses were detected from Busan while working on the preventive surveillance in 1997-2000. The isolation rate from suspected specimens were 8.4%. Influenza virus A, B type, parainfluenza virus, adenovirus, mumps virus, and measles virus were examined from throat swabs, serum, and secretions of patients. Influenza A/Sydney/05/97(H3N2)-like, A/Johanesburg/33/94(H3N2)-like, A/Beijing/262/95(H1N1)-like and Influenza B/Beijing/262/95-like, B/Harbin/07/94-like, B/Guangdong/08/93-like were found. Adenovirus serotype 1, 2, 3 and 5 were detected, antibody of mumps both IgM and IgG were shown and outbreaks of measles were confirmed. Different antigenic types of influenza virus were detected every year, one outbreak of parainfluenza in 1999, mumps outbreak in 1999 and 2000, and incidence of measles in 2000 were noticeable. Monthly outbreaks were November through following March with influenza virus, January through June with adenovirus, February through May and December with mumps, April through August and November, December with measles, respectively. The size of isolated viruses were 130 nm with influenza virus B type, non-enveloped, icosahedron with 70 nm with adenovirus, 170 nm with mumps virus and 180 nm with parainfluenza virus in diameter, respectively.
Kim, Mi-Hui;Na, Hyun-Jung;Chae, Ki-Joon;Bang, Hyo-Chan;Na, Jung-Chan
Journal of KIISE:Information Networking
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v.32
no.3
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pp.279-290
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2005
Recently, as the serious damage caused by DDoS attacks increases, the rapid detection and the proper response mechanisms are urgent. However, existing security mechanisms do not effectively defend against these attacks, or the defense capability of some mechanisms is only limited to specific DDoS attacks. In this paper, we propose a detection architecture against DDoS attack using data mining technology that can classify the latest types of DDoS attack, and can detect the modification of existing attacks as well as the novel attacks. This architecture consists of a Misuse Detection Module modeling to classify the existing attacks, and an Anomaly Detection Module modeling to detect the novel attacks. And it utilizes the off-line generated models in order to detect the DDoS attack using the real-time traffic. We gathered the NetFlow data generated at an access router of our network in order to model the real network traffic and test it. The NetFlow provides the useful flow-based statistical information without tremendous preprocessing. Also, we mounted the well-known DDoS attack tools to gather the attack traffic. And then, our experimental results show that our approach can provide the outstanding performance against existing attacks, and provide the possibility of detection against the novel attack.
Ha, Jimyeong;Lee, Jeeyeon;Oh, Hyemin;Shin, Il-Shik;Kim, Young-Mog;Park, Kwon-Sam;Yoon, Yohan
Journal of Food Hygiene and Safety
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v.35
no.1
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pp.37-44
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2020
This study investigated the probability of foodborne illness caused by raw oyster consumption contaminated with high risk Vibrio species such as V. vulnificus and V. cholerae. Eighty-eight raw oyster samples were collected from the south coast, west coast and Seoul areas, and examined for the prevalence of high risk Vibrio species. The growth patterns of V. vulnificus and V. cholerae in raw oysters were evaluated, and consumption frequency and amounts for raw oyster were investigated from a Korean National Health and Nutrition Examination Survey. With the collected data, a risk assessment simulation was conducted to estimate the probability of foodborne illness caused by intake of raw oysters, using @RISK. Of 88 raw oysters, there were no V. vulnificus- or V. cholerae-positive samples. Thus, initial contamination levels of Vibrio species in raw oysters were estimated by the statistical methods developed by Vose and Sanaa, and the estimated value for the both Vibrio spp. was -3.6 Log CFU/g. In raw oyster, cell counts of V. vulnificus and V. cholerae remained unchanged. The incidence of raw oyster consumers was 0.35%, and the appropriate probabilistic distribution for the consumption amounts was the exponential distribution. A risk assessment simulation model was developed with the collected data, and the probability of the foodborne illness caused by the consumption of raw oyster was 9.08×10-15 for V. vulnificus and 8.16×10-13 for V. cholerae. Consumption frequency was the first factor, influencing the probability of foodborne illness.
A matter of primary concern about all design is concentrated on how to create more valuable things to allow people to live an affluent life. However, it is very difficult to achieve the goal because every design work is changed in accordance with given situatio ns. In this sense, it is significant to study on biodesign because it can be both a basic principle and a fudamantal index to show the way of new design direction. Accordingly, the main purpose of the thesis is to catch every meaning of bio-design and to close analyze its factors in order to generate more fresh ideas and put them into practice. The thesis is composed of five Chapters: Introduction, Background of bio-design, Principle of bio-design, Practice of bio-design, and Conclusion. In Introduction, the purpose and background of the study are presented. I n Chapter 2, source of design orgin, vernacular design, and design for life are researched. In Chapter 3, organic order. the survial of the fittest, and subjective & objective are considered. In Chapter 4, hi-tech & hi-touch, criteria of problem -solving, and harmony with nature are searched. In Conclusion, some suggestive words on the study are mentioned.
In this study, we developed Rapid Enrichment Broth for Vibrio parahaemolyticus (REB-V), a broth capable enriching V. parahaemolyticus from 100 CFU/mL to 106 CFU/mL within 6 hours, which greatly facilitates the rapid detection of V. parahaemolyticus. Using a modified Gompertz model and response surface methodology, we optimized supplement sources to rapidly enrich V. parahaemolyticus. The addition of 0.003 g/10 mL of D-(+)-mannose, 0.002 g/10 mL of L-valine, and 0.002 g/10 mL of magnesium sulfate to 2% (w/v) NaCl BPW was the most effective combination of V. parahaemolyticus enrichment. Optimal V. parahaemolyticus culture conditions using REB-V were at pH 7.84 and 37℃. To confirm REB-V culture efficiency compared to 2% (w/v) NaCl BPW, we assessed the amount of enrichment achieved in 7 hours in each medium and extracted DNA samples from each culture every hour. Real-time PCR was performed using the extracted DNA to verify the applicability of this REB-V culture method to molecular diagnosis. V. parahaemolyticus was enriched to 5.452±0.151 Log CFU/mL in 2% (w/v) NaCl BPW in 7 hours, while in REB-V, it reached 7.831±0.323 Log CFU/mL. This confirmed that REB-V enriched V. parahaemolyticus to more than 106 CFU/mL within 6 hours. The enrichment rate of REB-V was faster than that of 2% (w/v) NaCl BPW, and the amount of enrichment within the same time was greater than that of 2% (w/v) NaCl BPW, indicating that REB-V exhibits excellent enrichment efficiency.
Won-Woo Seo;Hongki Kang;Wansang Yoon;Pyung-Chae Lim;Sooahm Rhee;Taejung Kim
Korean Journal of Remote Sensing
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v.39
no.6_1
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pp.1211-1224
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2023
Clouds cause many difficult problems in observing land surface phenomena using optical satellites, such as national land observation, disaster response, and change detection. In addition, the presence of clouds affects not only the image processing stage but also the final data quality, so it is necessary to identify and remove them. Therefore, in this study, we developed a new cloud detection technique that automatically performs a series of processes to search and extract the pixels closest to the spectral pattern of clouds in satellite images, select the optimal threshold, and produce a cloud mask based on the threshold. The cloud detection technique largely consists of three steps. In the first step, the process of converting the Digital Number (DN) unit image into top-of-atmosphere reflectance units was performed. In the second step, preprocessing such as Hue-Value-Saturation (HSV) transformation, triangle thresholding, and maximum likelihood classification was applied using the top of the atmosphere reflectance image, and the threshold for generating the initial cloud mask was determined for each image. In the third post-processing step, the noise included in the initial cloud mask created was removed and the cloud boundaries and interior were improved. As experimental data for cloud detection, CAS500-1 L2G images acquired in the Korean Peninsula from April to November, which show the diversity of spatial and seasonal distribution of clouds, were used. To verify the performance of the proposed method, the results generated by a simple thresholding method were compared. As a result of the experiment, compared to the existing method, the proposed method was able to detect clouds more accurately by considering the radiometric characteristics of each image through the preprocessing process. In addition, the results showed that the influence of bright objects (panel roofs, concrete roads, sand, etc.) other than cloud objects was minimized. The proposed method showed more than 30% improved results(F1-score) compared to the existing method but showed limitations in certain images containing snow.
Sunyong Lee;Da Hyun Lee;Jae Ho Lee;Sungsoo Lee;Kyunghwa Han;Chul Hwan Park;Tae Hoon Kim
Journal of the Korean Society of Radiology
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v.82
no.3
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pp.670-681
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2021
Purpose This study aimed to investigate the optimal threshold value in Hounsfield units (HU) on CT to detect the solid components of pulmonary subsolid nodules using pathologic invasive foci as reference. Materials and Methods Thin-section non-enhanced chest CT scans of 25 patients with pathologically confirmed minimally invasive adenocarcinoma were retrospectively reviewed. On CT images, the solid portion was defined as the area with higher attenuation than various HU thresholds ranging from -600 to -100 HU in 50-HU intervals. The solid portion was measured as the largest diameter on axial images and as the maximum diameter on multiplanar reconstruction images. A linear mixed model was used to evaluate bias in each threshold by using the pathological size of invasive foci as reference. Results At a threshold of -400 HU, the biases were lowest between the largest/maximum diameter of the solid portion of subsolid nodule and the size of invasive foci of the pathological specimen, with 0.388 and -0.0176, respectively. They showed insignificant difference (p = 0.2682, p = 0.963, respectively) at a threshold of -400 HU. Conclusion For quantitative analysis, -400 HU may be the optimal threshold to define the solid portion of subsolid nodules as a surrogate marker of invasive foci.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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