• 제목/요약/키워드: $V_6$ exon

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Genetic Association of the Porcine C9 Complement Component with Hemolytic Complement Activity

  • Khoa, D.V.A.;Wimmers, K.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제28권9호
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    • pp.1354-1361
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    • 2015
  • The complement system is a part of the natural immune regulation mechanism against invading pathogens. Complement activation from three different pathways (classical, lectin, and alternative) leads to the formation of C5-convertase, an enzyme for cleavage of C5 into C5a and C5b, followed by C6, C7, C8, and C9 in membrane attack complex. The C9 is the last complement component of the terminal lytic pathway, which plays an important role in lysis of the target cells depending on its self-polymerization to form transmembrane channels. To address the association of C9 with traits related to disease resistance, the complete porcine C9 cDNA was comparatively sequenced to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) in pigs of the breeds Hampshire (HS), Duroc (DU), Berlin miniature pig (BMP), German Landrace (LR), Pietrain (PIE), and Muong Khuong (Vietnamese potbelly pig). Genotyping was performed in 417 $F_2$ animals of a resource population (DUMI: $DU{\times}BMP$) that were vaccinated with Mycoplasma hyopneumoniae, Aujeszky diseases virus and porcine respiratory and reproductive syndrome virus at 6, 14 and 16 weeks of age, respectively. Two SNPs were detected within the third exon. One of them has an amino acid substitution. The European porcine breeds (LR and PIE) show higher allele frequency of these SNPs than Vietnamese porcine breed (MK). Association of the substitution SNP with hemolytic complement activity indicated statistically significant differences between genotypes in the classical pathway but not in the alternative pathway. The interactions between eight time points of measurement of complement activity before and after vaccinations and genotypes were significantly different. The difference in hemolytic complement activity in the both pathways depends on genotype, kind of vaccine, age and the interaction to the other complement components. These results promote the porcine C9 (pC9) as a candidate gene to improve general animal health in the future.

Rett 증후군 34례의 MECP2 유전자 변이에 관한 연구 (Mutational Analysis of MECP2 Gene in 34 Rett Syndrome)

  • 박상조;황태규;손병희;김철민
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제45권10호
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    • pp.1263-1272
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    • 2002
  • 목 적 : 레트증후군이란 1966년 Andreas Rett에 의해 처음 기술되었으며 생후 6개월에서 18개월 정도까지 비교적 정상 발달을 한 후 두위 발달의 감소와 함께 습득했던 인지 및 운동능력의 상실, 언어기능의 상실, 그리고 특징적인 손동작(상동행동)을 보이는 X 염색체 우성유전으로 생각되는 질환이다. 1999년 미국에서 그 결함 유전자인 MECP2 유전자가 Xq28에서 밝혀졌으나 우리 나라에서는 이 질환에 대한 전반적 이해가 부족하며 유전자 연구는 거의 전무한 상태이다. 이에 저자들은 우리 나라의 Rett 증후군 환아에서 MECP2 유전자의 결함이 어느 정도 나타나는지를 알고자 이 연구를 시행하였다. 방 법 : 2000년 2월부터 2001년 3월까지 본원을 방문한 Rett 증후군 환아 34례의 말초혈액을 EDTA (Ethylenediaminetetraacetic acid) 처리하여 5 cc 채취하여 냉동 보관한 후 해빙하여 DNA 표본을 추출했다. DNA의 추출은 E.Z.N.A blood DNA kit을 사용하였다. MECP2 유전자 네 종류의 axon은 PCR을 이용해 증폭하였고 primer sequence는 1999년 Amir 등에 의해 디자인 된 것(AF030876)을 사용하였다. ABI 377 DNA sequencer와 ABI PRISM dye cycle sequencing reaction kit을 사용하여 DNA sequencing을 시행하였고 우리 나라에서 최초로 발견된 유전자 변이에 대해서는 RFLP 분석을 통해 확인하였다. 결 과 : 1) MECP2 유전자의 변이를 보인 환아는 23례로 67.6%에서 관찰되었다. 2) 9종의 missense mutation과 3종의 nonsense mutation을 합해 총 12종의 유전자 변이가 관찰되었다. 3) 이들 돌연 변이 중 L100V, G161E, 그리고 T311M은 전세계적으로 우리 나라에서 처음 발견된 변이이다. 4) 23례의 유전자 변이는 대부분(78.3%) MBD와 TRD라는 기능영역에서 발견되었다. 5) 본 연구에서 T158M, R270X, 그리고 R306C가 자주 나타나는 유전자 변이였다. 결 론 : 우리 나라의 Rett 증후군 환아에서도 MECP2 유전자의 변이는 비교적 흔히 관찰되어 MECP2 유전자의 이상이 Rett 증후군을 유발하는 주 유전자 이상임을 확인하였고 Rett 증후군 환아의 확진을 위해 MECP2 유전자 검사가 필요할 것으로 사료된다.

Mutational Analysis of Korean Patients with Phenylketonuria

  • Koo, Soo Kyung;Lee, Kwang-Soo;Jung, Sung-Chul;Lee, Jong-Eun;Lee, Dong Hwan
    • 대한유전성대사질환학회지
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    • 제4권1호
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    • pp.5-12
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    • 2004
  • Purpose Phenylketonuria is an inborn error of metabolism, which is inherited as an autosomal recessive trait. PKU is resulting from deficiency of phenylalanine hydroxylase. PAH gene spans about 90 kb on chromosome 12q and comprises 13 exons. In order to define the genetic basis of PKU and the frequencies and distribution of PAH mutations in the Korean population, we analyzed PAH gene in independent 80 patients with PKU. Methods All 13 exons including exon-intron boundaries and 2 kb of 5' upstream region of the PAH gene were analyzed by PCR-direct sequencing methods. Results PAH gene analysis revealed 39 different mutations including 10 novel mutations. The novel mutations consisted of 9 missense mutations (P69S, G103S, N207D, T278S, P281A, L293M, G332V, S391I and A447P) and a novel splice site variant (IVS10-3C>G). R243Q, IVS4-1G>A, and E6-96A>G were the most relevant mutations and they accounted in the whole for 38% of the mutant alleles identified in this study. We also observed that. $BH_4$ responsibility was. associated with genotype of R241C, R53H and R408Q. Conc1ustion Our present study with 80 participants extends the previous results to more comprehensive understanding of PAH allele distribution and frequency in Koreans. Although Korean mutation profile of PAH is similar to those of the nearest oriental populations (Japanese, Chinese, and Taiwanese), several different characteristic features are revealed. The characterization of the genotype-phenotype relationship was also performed. Our data would be very useful information for diagnosis, genetic counseling and planning of dietary and therapeutic strategies in Korean PAH patients.

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한국인에서 peroxisome proliferator-activated receptor alpha Leu162Val 유전자 다형성과 대사증후군간의 관련성 (Association between Genetic Polymorphism of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Alpha Leu162Val and Metabolioc Syndrome in Korean)

  • 신승철;송혜순;홍영습;곽종영;유병철;이용환
    • 생명과학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.199-205
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    • 2006
  • Peroxisome proliferator-activated receptors alpha (PPAR $\alpha$)는 지질대사와 관련하여 대사증후군 발생과 관련이 있을 수 있는 강력한 잠재 유전자로 고려되고 있으므로 한국인에 있어서 PPAR$\alpha$ L162V 유전자 다형성과 대사증후군과의 연관성을 확인하고자 고신대학교 복음병원에서 2004년 12윌에서 2005년 7월 사이에 건강진단을 받았던 수진자 542명(대사 증후군 : 262명, 정상인 : 280명)을 대상으로 신장, 체증, 체질량지수, 허리둘레와 수축기와 이완기 혈압, 공복 혈당, 총콜레스테롤, HDL 콜레스테롤, LDL 콜레스테롤과 중성지방 수치를 측정하였으며, 대사증후군의 정의는 혈압, 공복 혈당, HDL 콜레스테롤, 중성지방은 NCEP ATP III의 기준을 적용하였고, 허리둘레는 WHO 아시아-서태평양 기준을 적용하였다. PCR-ASO (polymerase chain reaction allele-specific oligonucleotide) 방법에 의해 대상자들의 PPAR$\alpha$ L162V 유전자 다형성을 확인하였다. 연구결과 PPAR$\alpha$ 484번 염기서열의 $C{\rightarrow}G$ 돌연변이가 나타난 사람은 조사대상자 542명 가운데 1명(0.2%) 이었다. 한국인에서는 PPAR$\alpha$ L162V 유전자 다형성이 거의 일어나지 않았으며, 이의 확인을 위하여 더욱 많은 사람을 대상으로 연구가 진행되어야 할 필요가 있을 것으로 생각된다.