• 제목/요약/키워드: ${\delta}$-sequence

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Cloning된 효모의 RNAI 유전자의 특성에 관하여 (Characterization of the cloned RNA1 gene of Saccharomyces cerevisiae)

  • 송영환;김대영;김진경
    • 한국어병학회지
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    • 제6권2호
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    • pp.93-101
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    • 1993
  • 효모의 RNAI유전자는 RNA processing에 관여 하는지 혹은 RNA transport에 관여 하는지 아직까지 유전자의 기능이 정확히 알려져 있지 않은 실정이다. 효모의 RNAI 유전자의 기능을 파악하기 위한 방법으로 본 연구에서는 rna1-1 mutant gene을 cloning하여 이에 대한 DNA sequence를 조사함으로써 RNAI 유전자와 rna1-1 유전자의 차이점을 이해하고자 하였다. rna1-1 marker를 갖는 yeast strain(R49)로 부터 genomic DNA를 추출하여 이를 BglII로 절단하여 genomic southern blotting을 행한 결과 wild type의 경우와 동일하게 3.4 kb에서 hybridization되는 signal을 얻었으며, RNAl 및 rna1-1이 yeast genome내에 single site로 존재함을 보여 주는 결과를 얻었다. mutant strain으로 부터 얻은 3.4 kb의 BglI fragment를 pUC19의 BamHI site에 subcloning하여 transformant들을 얻었고, wild type RNAl 유전자를 probe로 하여 rna1-1 mutant 유전자를 cloning할 수 있었다. pUC19에 cloning된 RNA1유전자 및 rna1-1유전자로부터 다양한 Ba131유도체를 얻어 이들에 대한 염기 서열을 비교한 결과 transcription initation site에서부터 down stream쪽으로 17 아미노산위치에 TCC가 TTC로 대치되어 있었으며 그 결과 serine이 phenylalanine으로 변환되는 결과를 얻었다. Wild type RNAI gene의 5'-region에는 3군데의 TATA-like sequence가 true TATA box인지 확인하기 위하여 Bal3I deletion에 의해 -103nt까지 deletion된 유도체를 얻었으며 ${\Delta}RNAI$, rna1-1, 81-2-6 clone이 rna1-1 allele와 complementation한지 확인하였으나 ${\Delta}RNAI$은 TS-complementation을 하지 못하였다. 따라서 현재까지 TATA-box라고 알려진 부분은 promoter로 작용하지 못함을 확인하였다.

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Detection of planetary signals in extremely weak central perturbation microlensing events via next-generation ground-based surveys

  • Chung, Sun-Ju;Lee, Chung-Uk
    • 천문학회보
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    • 제38권2호
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    • pp.72.1-72.1
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    • 2013
  • Even though current microlensing follow-up observations focus on high-magnification events due to the high efficiency of planet detection, it is very difficult to do a confident detection of planets in high-magnification events with extremely weak central perturbations (i.e., the fractional deviation is ${\delta}{\leq}0.02$). For the confident detection of planets in the extremely weak central perturbation events, it is needed both the high cadence monitoring and the high photometric accuracy. A next-generation ground-based observation project, KMTNet (Korea Microlensing Telescope Network), satisfies both the conditions. Here we investigate how well planets in high-magnification events with extremely weak central perturbations are detected by KMTNet. First, we determine the probability of occurrence of events with ${\delta}{\leq}0.02$. From this, we find that for ${\leq}100M_E$ planets in the separation of $0.2AU{\leq}d{\leq}20AU$, events with ${\delta}{\leq}0.02$ occur with a frequency of more than 70%, in which d is the projected planet-star separation. Second, we estimate the efficiency of detecting planetary signals in the events with ${\delta}{\leq}0.02$ via KMTNet. We find that for main-sequence and subgiant source stars, ${\geq}1M_E$ planets can be detected more than 50% in a certain range that has the efficiency of ${\geq}10%$ and changes with the planet mass.

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n-$\Delta$ Delay-Lock Loops의 성능 해석 (Performance Analysis of Extended n-$\Delta$ Dely-Lock Loops)

  • 류승문;은중관;김재균
    • 대한전자공학회논문지
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    • 제18권1호
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    • pp.16-24
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    • 1981
  • Delay-lock loop(DLL)는 상단관련이 있는 두 파형 사이의 지연차이를 추적하는한 최적장치이다. 본 논문에서는 지연시간이 n- 로 확장된 한 DLL의 구조와 동기상실 주파수등 저역주파수대의 성능이 해석되었다. 본 DLL은 correlator와 개선된 PN 신호장치로 구성되었으며,상관 특성은 확장된 S-커브의 형태를 가지고 있다. 잡음이 크더라도 추적범위와 초기동기시간이 좋은 특성을 가지고 있다. 3- DLL을 1- DLL과 비교하면 직렬동기방식에서 초기동기시간이 3배나 빠르며, doppler shift에 대한 저항이 2배나 큰 것으로 나타났다.

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카르보닐 탄소원자의 친핵치환 반응 (제5보). 아세톤 용매속에서의 Dialkylcarbamoyl Chloride의 할로겐 교환반응에 관한 속도론적 연구 (Nucleophilic Substitution at a Carbonyl Carbon Atom (V). Kinetic Studies on Halogen Exchange Reactions of N,N-Dialkylcarbamoyl Chlorides in Dry Acetone)

  • 김시준;이익춘
    • 대한화학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.11-15
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    • 1975
  • Carbonyl 탄소원자의 반응성에 대한 연구의 일환으로 N,N-dimehtylcarbamoyl chloride와 N,N-diethylcarbamoyl chloride의 할로겐 교환반응을 아세톤 용매속에서 방사성 할라이드 이온을 사용하여 두 온도에서 속도론적으로 연구하였다. 그 결과를 alkylchloroformate의 경우와 비교하면, 친핵성의 순서는 비슷한 경향을 나타내나, 반응속도는 가용매분해나 alkylchloroformate의 경우보다 느리다. 활성화 피라미터 ${\Delta}H^*$${\Delta}S^*$$Cl^{\rightarrow}Br^{\rightarrow}I^-$는순서로 감소한다. 이 결과를 용매화 효과, bond-breaking, bond-formation 및 electronic requirment로 설명하였다.

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유황의 친핵 치환반응 (제3보). 아세톤 용매속에서의 Dimethylsulfamoyl Chloride의 할라이드 교환반응에 관한 속도론적 연구 (Nucleophilic Displacement at Sulfur Center (III). Kinetic Studies on Halide Exchange Reactions of Dimethylsulfamoyl Chloride in Dry Acetone)

  • 이익춘;김시준
    • 대한화학회지
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    • 제17권6호
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    • pp.406-410
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    • 1973
  • Dimethylsulfamoyl chloride의 할라이드 교환반응을 무수 아세톤 용매속에서 방사성 할라이드 이온을 사용하여 두 온도에서 속도론적으로 연구하였다. 그 결과를 benzensulfonyl chloride의 경우와 비교해 보면 친핵성에 있어서는 거의 비슷한 경향성을 나타내나, 반응속도는 dimethylsulfamoyl chloride 쪽이 $10^{-2}$배 이상이나 느린 경향을 나타낸다. 또한 활성화 파라미터, ${\Delta}H^{\neq}$${\Delta}S^{\neq}$는 benzensulfonyl chloride의 경우와는 반대로 dimethylsulfamoyl chloride의 경우는 $Cl^-\;>\;Br^-\;>\;I^-$의 순서로 감소함을 나타낸다. 이 결과를 bond-breaking, bond formation, electronic requirment 및 HSAB 원리로 설명하였다.

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Characterizations of Lie Triple Higher Derivations of Triangular Algebras by Local Actions

  • Ashraf, Mohammad;Akhtar, Mohd Shuaib;Jabeen, Aisha
    • Kyungpook Mathematical Journal
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    • 제60권4호
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    • pp.683-710
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    • 2020
  • Let ℕ be the set of nonnegative integers and 𝕬 be a 2-torsion free triangular algebra over a commutative ring ℛ. In the present paper, under some lenient assumptions on 𝕬, it is proved that if Δ = {𝛿n}n∈ℕ is a sequence of ℛ-linear mappings 𝛿n : 𝕬 → 𝕬 satisfying ${\delta}_n([[x,\;y],\;z])\;=\;\displaystyle\sum_{i+j+k=n}\;[[{\delta}_i(x),\;{\delta}_j(y)],\;{\delta}_k(z)]$ for all x, y, z ∈ 𝕬 with xy = 0 (resp. xy = p, where p is a nontrivial idempotent of 𝕬), then for each n ∈ ℕ, 𝛿n = dn + 𝜏n; where dn : 𝕬 → 𝕬 is ℛ-linear mapping satisfying $d_n(xy)\;=\;\displaystyle\sum_{i+j=n}\;d_i(x)d_j(y)$ for all x, y ∈ 𝕬, i.e. 𝒟 = {dn}n∈ℕ is a higher derivation on 𝕬 and 𝜏n : 𝕬 → Z(𝕬) (where Z(𝕬) is the center of 𝕬) is an ℛ-linear map vanishing at every second commutator [[x, y], z] with xy = 0 (resp. xy = p).

Molecular Characterization of crp, the Cyclic AMP Receptor Protein Gene of Serratia marcescens KTCC 1272

  • Yoo, Ju-Soon;Kim, Hae-Sun;Chung, Soo-Yeol;Choi, Yong-Lark
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제10권5호
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    • pp.670-676
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    • 2000
  • Several clones obtained from Serratia marcescens stimulated E. coli TP2139 (${\Delta}lac, \;{\Delta} crp$) cells to use maltose as a carbon source. The crp gene clone, pCKB12, was confirmed to stimulate the $\beta$-galactosidase activity, by Southern hybridization [31]. The nucleotide sequence of the crp region consisting of 1,979 bp was determined. The sequencing of the fragment led to the identification of two open reading frames: One of these, the crp gene, encoded 210 amino acid and the other encoded a truncated protein. The S. marcescens and E. coli crp genes showed a higher degree of divergence in their nucleotide sequence with 120 changes, however, the corresponding amino acid sequences showed only two amino acid differences. Yet, an analysis of the amino acid divergence revealed that the catabolite gene activator protein, the crp gene product, was the most conserved protein observed so far. Using a crp-lac protein fusion, it was demonstrated that S. marcescens CRP could repress its own expression, probably via a mechanism similar to that previously described for the E. coli crp gene.

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Cloning and Strong Expression of a Bacillus subtilis WL-3 Mannanase Gene in B. subtilis

  • Yoon, Ki-Hong;Lim, Byung-Lak
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권10호
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    • pp.1688-1694
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    • 2007
  • A gene encoding the mannanase of Bacillus subtilis WL-3, which had been isolated from Korean soybean paste, was cloned into Escherichia coli and the nucleotide sequence of a 2.7-kb DNA fragment containing the mannanase gene was subsequently determined. The mannanase gene, designated manA, consisted of 1,080 nucleotides encoding a polypeptide of 360 amino acid residues. The deduced amino acid sequence was highly homologous to those of mannanases belonging to glycosyl hydrolase family 26. The manA gene was strongly expressed in B. subtilis 168 by cloning the gene downstream of a strong B. subtilis promoter of plasmid $pJ27{\Delta}88U$. In flask cultures, the production of mannanase by recombinant B. subtilis 168 reached maximum levels of 300 units/ml and 450 units/ml in LB medium and LB medium containing 0.3% locust bean gum, respectively. Based on the zymogram ofthe mannanase, it was found that the mannanase produced by recombinant B. subtilis could be maintained stably without proteolytic degradation during the culture time.

Stacking 방법과 층수에 따른 2 차원 화합물 반도체인 GaS 의 전자구조 변화

  • 양하늘;차선경
    • EDISON SW 활용 경진대회 논문집
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    • 제5회(2016년)
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    • pp.313-318
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    • 2016
  • 2차원 화합물 반도체인 Metal monochalcogenides (MMC)는 원자 4층으로 이루어진 tetralayer (TL)가 층상으로 쌓여진 구조이다. 서로 이웃한 tetralayer들이 쌓이는 방법에 따라 4가지의 stacking sequence를(${\beta}$, ${\varepsilon}$, ${\gamma}$, ${\delta}$) 고려할 수 있으며 물질에 따라 상대적인 안정성이 달라진다. GaS는 ${\beta}-type$이 가장 안정하다고 알려져 있다. 이 연구에서는 GaS의 층수를 4층까지 쌓으며, ${\beta}$${\varepsilon}$의 stacking sequence의 모든 경우를 다루어 van der Waals interaction을 고려한 LCAO-DFT 제일원리 계산을 수행하였다. 그 결과를 원자구조의 변화, 에너지 안정성, 전자구조의 변화로 나누어 분석하였다. TL 층이 많을수록 TL의 thickness가 감소하고 더 높은 에너지 안정성을 나타냈다. 또한 stacking sequence를 고려하였을 때 ${\varepsilon}$ stacking을 한 결과가 더 안정한 에너지가 나왔다. 이후 ${\varepsilon}$ stacking을 하였을때의 전자구조 변화를 energy band와 projected density of states를 이용해 관찰하였다.

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Function of rax2p in the Polarized Growth of Fission Yeast

  • Choi, Eunsuk;Lee, Kyunghee;Song, Kiwon
    • Molecules and Cells
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    • 제22권2호
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    • pp.146-153
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    • 2006
  • Cell polarity is critical for the division, differentiation, migration, and signaling of eukaryotic cells. RAX2 of budding yeast encodes a membrane protein localized at the cell cortex that helps maintain the polarity of the bipolar pattern. Here, we designate SPAC6f6.06c as $rax2^+$ of Schizosaccharomyces pombe, based on its sequence homology with RAX2, and examine its function in cell polarity. S. pombe $rax2^+$ is not essential, but ${\Delta}rax2$ cells are slightly smaller and grow slower than wild type cells. During vegetative growth or arrest at G1 by mutation of cdc10, deletion of $rax2^+$ increases the number of cells failing old end growth just after division. In addition, this failure of old end growth is dramatically increased in ${\Delta}tea1{\Delta}rax2$, pointing to genetic interaction of $rax2^+$ with $tea1^+$. ${\Delta}rax2$ cells contain normal actin and microtubule cytoskeletons, but lack actin cables, and the polarity factor for3p is not properly localized at the growing tip. In ${\Delta}rax2$ cells, and endogenous rax2p is localized at the cell cortex of growing cell tips in an actin- and microtubule-dependent manner. However, ${\Delta}rax2$ cells show no defects in cell polarity during shmoo formation and conjugation. Taken together, these observations suggest that rax2p controls the cell polarity of fission yeast during vegetative growth by regulating for3p localization.