• 제목/요약/키워드: ${\alpha}$-oxidase

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Crystal Structure of Acyl-CoA Oxidase 3 from Yarrowia lipolytica with Specificity for Short-Chain Acyl-CoA

  • Kim, Sangwoo;Kim, Kyung-Jin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권4호
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    • pp.597-605
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    • 2018
  • Acyl-CoA oxidases (ACOXs) play important roles in lipid metabolism, including peroxisomal fatty acid ${\beta}$-oxidation by the conversion of acyl-CoAs to 2-trans-enoyl-CoAs. The yeast Yarrowia lipolytica can utilize fatty acids as a carbon source and thus has extensive biotechnological applications. The crystal structure of ACOX3 from Y. lipolytica (YlACOX3) was determined at a resolution of $2.5{\AA}$. It contained two molecules per asymmetric unit, and the monomeric structure was folded into four domains; $N{\alpha}$, $N{\beta}$, $C{\alpha}1$, and $C{\alpha}2$ domains. The cofactor flavin adenine dinucleotide was bound in the dimer interface. The substrate-binding pocket was located near the cofactor, and formed at the interface between the $N{\alpha}$, $N{\beta}$, and $C{\alpha}1$ domains. Comparisons with other ACOX structures provided structural insights into how YlACOX has a substrate preference for short-chain acyl-CoA. In addition, the structure of YlACOX3 was compared with those of medium- and long-chain ACOXs, and the structural basis for their differences in substrate specificity was discussed.

Expression and Significance of Hypoxia Inducible Factor-1α and Lysyl Oxidase in Non-small Cell Lung Cancer

  • Ping, Wei;Jiang, Wen-Yang;Chen, Wen-Shu;Sun, Wei;Fu, Xiang-Ning
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권6호
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    • pp.3613-3618
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    • 2013
  • Object: To detect expression of hypoxia inducible factor-$1{\alpha}$ (HIF-$1{\alpha}$) and lysyl oxidase (LOX) in non-small cell lung cancer (NSCLC) and explore their roles in prognosis. Methods: The mRNA levels of HIF-$1{\alpha}$ and LOX were investigated by real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction in 40 cases of tumour and paired normal tissues. In addition, protein expression of HIF-$1{\alpha}$ and LOX was examined by immunohistochemistry in 82 cases of tumour and 45 paired normal tissues. The relationship between HIF-$1{\alpha}$ or LOX and clinicopathologic characteristics, as well as the correlation between HIF-$1{\alpha}$ and LOX, were also examined. Kaplan-Meier survival curves and the log-rank test were used to analyze progression-free survival. Results: HIF-$1{\alpha}$ or LOX mRNA levels in tumor tissues was significantly higher than those in paired normal tissues (p<0.01). Positive HIF-$1{\alpha}$ or LOX protein expression in tumor tissues was noted in 46/82 (56.1%) and 49/82 (59.8%) of the cases, respectively, being significantly higher than those in paired normal tissues (p<0.05). There was significant correlation between the expression of HIF-$1{\alpha}$ or LOX and tumor size, lymph node metastasis and pathological stage (p<0.05). The expression of HIF-$1{\alpha}$ and LOX had a significant inverse impact on survival of patients with NSCLC. Conclusion: HIF-$1{\alpha}$ and LOX may play a pivotal role in the development of NSCLC, and may act in synergy to promote the progression of NSCLC.

PYRANOSE OXIDASE HAVING A COVALENTLY BOUND FAD AS A COENZYME

  • Kwon, Jae-Youl;Kang, Sa-Ouk
    • 한국생물물리학회:학술대회논문집
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    • 한국생물물리학회 1996년도 정기총회 및 학술발표회
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    • pp.45-45
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    • 1996
  • Flavin-peptides were purified from pyranose oxidase (EC 1.1.3.10) after tryptic- chymotryptic and tryptic digestion. The spectral and chromatographic properties of these flavin peptides showed that the FAD of pyranose oxidase appears to be bound, by way of the 8${\alpha}$-methylene group, to the N-l position of the imidazole ring of the histidine. Automated sequence analysis showed that the amino acid sequence of the tryptic-chymotryptic flavin-peptide from pyranose oxidase is Ser-Thr-X-Trp and that of the tryptic flavin-peptide is Met-Ser-Thr-X-Trp. (omitted)

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품종이 다른 오디(Morus alba L.)의 성인병 관련 효소 억제효과 (Inhibitory Effects of Various Mulberry Fruits (Morus alba L.) on Related Enzymes to Adult Disease)

  • 채정우;박혜진;강선애;차원섭;안동현;조영제
    • 생명과학회지
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    • 제22권7호
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    • pp.920-927
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    • 2012
  • 생리활성을 갖는 새로운 기능성 물질을 개발할 목적으로 9종의 오디(Morus alba L.)를 이용하여 물과 60% 에탄올 추출물을 제조하고 이들의 angiotensin converting enzyme 활성억제효과, xanthine oxidase 활성억제효과, ${\alpha}$-amylase 활성억제효과 및 ${\alpha}$-glucosidase 활성억제효과를 탐색하여 본 결과, 페놀함량이 청일뽕과 강원3호 품종의 오디에서 물추출물에서 청일뽕과 강원3호 두품종이, 에탄올 추출물에서 대엽조생, 청일뽕, 강원3호, 희학 및 카타네오 등 5 품종이 2 mg/g 이상의 phenolic compound 함량을 나타내었으며, angiotensin converting enzyme 활성억제효과는 물 추출물에서 백운3호가 $90.9{\pm}4.5%$, 에탄올 추출물에서는 희학 품종이 $81.8{\pm}4.5%$의 활성억제효과를 나타내었다. 또한 xanthine oxidase 활성억제효과는 물 추출물에서 국상20호가 약 10% 정도, 에탄올 추출물에서는 카타네오가 $21.4{\pm}2.3%$의 활성억제효과를 나타내었다. 당분해활성에 관여하는 ${\alpha}$-amylase와 ${\alpha}$-glucosidase 활성억제효과를 측정해 본 결과 물추출물에서만 대엽조생, 수원뽕, 청일뽕, 강원3호, 희학 및 국상20호 등 6품종이 100%의 ${\alpha}$-amylase 저해효과가 관찰되었으며, 백운3호, 대엽조생, 청일뽕 및 희학은 물추출물에서, 대축면, 강원3호 및 국상20호는 에탄올 추출물에서 20% 이상의 ${\alpha}$-glucosidase 저해효과가 확인되었다. 이상의 결과, 높은 생리활성기능을 나타내는 여러 종의 오디의 물과 에탄올 추출물들은 항고혈압 및 항당뇨 효과가 있는 기능성 식품소재로 활용할 수 있을 것으로 판단되었다.

Streptococcus faecium M74 · LC에 의한 L-α-Glycerophosphate Oxidase의 생산 (Production of L-α-Glycerophosphate Oxidase by streptococcus faecium M74 · LC)

  • 이인애;이은숙;이준우
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제32권5호
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    • pp.684-688
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    • 2003
  • L- $\alpha$ -glycerophosphate oxidase(GPO)는 L- $\alpha$-glycero-phosphate를 산화시켜 dihydroxyacetone phosphate와 과산화수소의 생성을 촉매시켜 주는 효소로서 혈중에 존재하는 triglyceride의 양을 측정하는 kit를 개발하는데 이용할 수 있으며 본 연구 결과로 종균을 개발 및 확보하였으며, 이 종균의 사용으로 GPO의 발효공정기술을 확립하였고, 또한 이들 조효소로부터 순수한 효소를 생산할 수 있는 정제공정 기술을 확립하였다. 먼저 ATCC에서 네 가지 균주와 KCTC에서 세 가지 균주, 그리고 본 연구실에서 분리한 Streptococcus faecium $M_{74}$.LC 균주 등 8가지 균주의 성장상태를 비교하고 GPO의 역가를 측정 해 본 결과, 배양액 1 L당 ATCC 19634는 65 units, ATCC 12755는 60 units, S. faecium $M_{74}$. LC는 67 units로 S. faecium $M_{74}$.LC가 제일 높은 역가를 생산하였다. 또한 발효조에서 배지의 양을 3 L로 하여 배양온도는 $37^{\circ}C$, 교반속도는 300 rpm, 통기량은 0.5 L/min, 17시간 배양하였을 때 가장 많은 양의 균체가 생성되었으며, GPO의 생산량도 가장 많았다(256 units/L). 이 때 배지 조성은 glucose 0.1%, glycerol 0.2%, tryptone 1.0%, yeast extract 1.0% 및 $K_2HP0_4$0.5%로 하여 배양하였고 GPO의 정제공정은 염투석 분획과 이온 교환수지 공정으로 대별할 수 있으며, 이온교환수지는 DEAE-cellulose 칼럼을 이용한 정제수율은 약 47%를 얻을수 있었다.

Cephalosporin C의 생변환을 위한 Trigonopsis variabilis의 D-amino Acid Oxidase 유전자의 클로닝 및 발현 (Cloning and Expression of D-amino Acid Oxidise from Trigonopsis variabilis for Cephalosporin C Biotransformation)

  • 이진형;정태완
    • KSBB Journal
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    • 제10권3호
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    • pp.264-270
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    • 1995
  • Trigonopsis variabilis는 버l타락탐 항생제인 cephalosporin C (ceph C)를 ${\alpha}$-keto-adipyl-7 a aminocephalosporanic acid(AKA-7 ACA)로 생변 환하는 강력한 D-amino acid oxidase 효소를 갖고 있다. 본 연구는 이 D-AAO 효소의 유전자를 추출하기 위하여 polymerase chain reaction (PCR)을 사용하였다. PCR 단편을 콜로닝하기 위하여 Taq D DNA polymerase, Klenow, T4 DNA polymerase I, Alkaline phosphatase Calf Intestinal와 T4 kinase 의 효소반응을 이용하여 4가지의 방법을 샤용한 결 과, blunt - end 의 PCR fragment 를 phosphory­l lation하고 blunt -end의 pUC18 plasmid를 dephos phorylation 한 후 ligation 한 것 이 가장 좋은 클로 닝 효율을 보였다. Ceph C에 대한 D-AAO 효소의 활성은 재조합 E. coli의 세포추출액과 permea bilized cells에서 모두 확인할 수 있었다.

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NADPH Oxidase and Mitochondrial ROS are Involved in the $TNF-{\alpha}$-induced Vascular Cell Adhesion Molecule-1 and Monocyte Adhesion in Cultured Endothelial Cells

  • Yu, Jae-Hyeon;Kim, Cuk-Seong;Yoo, Dae-Goon;Song, Yun-Jeong;Joo, Hee-Kyoung;Kang, Gun;Jon, Ji-Yoon;Park, Jin-Bong;Jeon, Byeong-Hwa
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제10권4호
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    • pp.217-222
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    • 2006
  • Atherosclerosis is considered as a chronic inflammatory process. However, the nature of the oxidant signaling that regulates monocyte adhesion and its underlying mechanism is poorly understood. We investigated the role of reactive oxygen species on the vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1) and monocyte adhesion in the cultured endothelial cells. $TNF-{\alpha}$ at a range of $1{\sim}30\;ng/ml$ induced VCAM-1 expression dose-dependently. BCECF-AM-labeled U937 cells firmly adhered on the surface of endothelial cells when the endothelial cells were incubated with $TNF-{\alpha}$ (15 ng/ml). Ten $\;{\mu}mol/L$ of SB203580, an inhibitor of p38 MAPK, significantly reduced $TNF-{\alpha}-induced$ VCAM-1 expression, compared to the JNK inhibitor ($40\;{\mu}mol/L$ of SP60015) or ERK inhibitor ($40\;{\mu}mol/L$ of U0126). Also, SB203580 significantly inhibited $TNF-{\alpha}-induced$ monocyte adhesion in HUVEC. Superoxide production was minimal in the basal condition, however, treatment of $TNF-{\alpha}$ induced superoxide production in the dihydroethidineloaded endothelial cells. Diphenyleneiodonium (DPI, $10\;{\mu}mol/L$), an inhibitor of NADPH oxidase, and rotenone $(1\;{\mu}mol/L)$, an inhibitor of mitochondrial complex I inhibited $TNF-{\alpha}-induced$ superoxide production, VCAM-1 expression and monocyte adhesion in the endothelial cells. Taken together, our data suggest that NADPH oxidase and mitochondrial ROS were involved in $TNF-{\alpha}-induced$ VCAM-1 and monocyte adhesion in the endothelial cells.

산사자의 Monoamine Oxidase 활성 저해 성분 (Inhibitors of Monoamine Oxidase Activity from the Fruits of Crataegus pinnatifida Bunge)

  • 홍성수;황지상;이선아;한향화;노재섭;이경순
    • 생약학회지
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    • 제33권4호통권131호
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    • pp.285-290
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    • 2002
  • From the fruits of Crataegus pinnatifide BUNGE ursolic acid (1), $quercetin-3-O-{\alpha}-L-rhamnopyranosyl(1{\rightarrow}6)-{\beta}-D-glucopyranoside$ (2), (-)-epicatechin (3), $quercetin-3-O-{\beta}-D-galactopyranoside$ (4) and quercetin (5) have been isolated and identified on the basis of their physicochemical properties and spectroscopic evidences in comparison with authentic samples. Among isolated compounds, quercetin showed significant inhibitory effect against MAO.

Monoamine Oxidase Inhibitors from Aquilaria agallocha

  • Huong, Dang Thi Lan;Dat, Nguyen Tien;Minh, Chau Van;Kang, Jong-Seong;Kim, Young-Ho
    • Natural Product Sciences
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    • 제8권1호
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    • pp.30-33
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    • 2002
  • From the bioassay-directed fractionation and isolation of dichloromethane fraction of Aquilaria agallocha, four compounds having MAO inhibitory effect were isolated by repeated silica gel column chromatography. Their chemical structures were established as psoralen (1), bergapten (2), ${\alpha}-amyrin\;acetate$ (3) and 5-hydroxymethylfurfural (4) on the basis of their physicochemical and spectral data. Among these compounds, psoralen and bergapten showed high inhibitory activities in vitro against mouse brain MAO with $IC_{50}$ values $21.3\;{\mu}M\;and\;13.8\;{\mu}M$, respectively.

바위솔 추출물의 항산화활성 및 암세포 증식억제 (The activity of antioxidants and suppression of cancer cell proliferation in extracts of Orostachys japonicus A. Berger)

  • 김충현;박재호;임종국;이건주;정규영;정형진
    • 한국약용작물학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.31-39
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    • 2003
  • 바위솔의 추출물로부터 항산화 활성 및 동물 항암세포를 이용한 생물학적 특성을 조사 해 본 결과는 다음과 같다. 생육지별 DPPH 프리라디칼 소거 및 xanthine/xanthine oxidase 억제 활성비교에서 재배지에서 수확한 시료의 활성이 $6.07(IC_{50}:{\mu}g/m{\ell})$로 가장 높았다 생육시기별 DPPH 프리라디칼 소거 및 xanthine/xanthine oxidase 억제의 활성은 9월 수확물이 가장 활성이 높았다. 실리카겔 컬럼크로마토그래피를 이용한 항산화물질 분리결과에서 S-4 분획물의 DPPH와 xanthine oxidase 억제활성이 $5.02(IC_{50}\;:\;{\mu}g/m{\ell})$$6.18(IC_{50}:{\mu}g/m{\ell})$을 나타냄으로써 높은 분리효율를 보였다. 항산화활성이 가장 높았던 LH-4 분획물의 주요화합물은 GC/MS에 의하여 지방산, 폴리페놀화합물 및 페놀유도체로 동정되었으며 alpha-androsta-7,14-diene과 1,2,3-benzenetriol이 주 물질이었다. POD 및 SOD 활성은 생육지간에 재배지, 산, 바닷가 순으로, 생육시기간에는 시기가 늦을수록 높게 나타났다 SOD 동위효소의 밴드수는 전 생육지, 전 생육시기에서 공히 2개의 밴드가 나타났으나, 그 세기는 재배지와 9월의 수확물이 가장 높은 활성을 나타내었다. 정제된 LH-4 분획물은 HL-60 세포의 종양증식을 억제시켰으며 종양유발유전자와 IPTG로 콜로니 형성을 유도한 암세포(2-12 cells)에서 분획물 400ppm 처리와 negative control 처리간의 colony형성은 유의차가 없었다.