Update on the Taxonomy of Clinically Important Anaerobic Bacteria

임상적으로 중요한 무산소성 세균의 분류 업데이트

The taxonomy of bacteria in the field of clinical microbiology is in a state of constant flux. A large-scale revamping of the classification and nomenclature of anaerobic bacteria has taken place over the past few decades, mainly due to advances in molecular techniques such as 16S rRNA and whole genome sequencing (WGS). New genera and species have been added, and existing genera and species have been reclassified or renamed. A major role of the clinical microbiological laboratories (CMLs) is the accurate identification (ID) and appropriate antimicrobial susceptibility testing (AST) for clinically important bacteria, and rapid reporting and communication of the same to the clinician. Taxonomic changes in anaerobic bacteria could potentially affect the choice of appropriate antimicrobial agents and the antimicrobial breakpoints to use. Furthermore, current taxonomy is important to prevent treatment failures of emerging pathogenic anaerobes with antimicrobial resistance. Therefore, CMLs should periodically update themselves on the changes in the taxonomy of anaerobic bacteria and suitably inform clinicians of these changes for optimum patient care. This article presents an update on the taxonomy of clinically important anaerobic bacteria, together with the previous names or synonyms. This taxonomy update can help guide antimicrobial therapy for anaerobic bacterial infections and prevent treatment failure and can be a useful tool for both CMLs and clinicians.

임상미생물학 분야에서 세균의 분류는 끊임없이 변화하는 상태에 있다. 무산소성 세균의 대규모 분류와 명명법은 지난 수십년 동안 발생되었는데, 주로 16S rRNA 염기서열 분석 및 전체 게놈 염기서열(WGS) 분석과 같은 분자 기술의 발전 때문이다. 새로운 균속과 균종이 추가되었고, 기존 균종과 균속은 재분류되었거나 재명명되었다. 임상미생물검사실의 주요 역할은 임상적으로 중요한 세균의 정확한 동정 및 적절한 감수성 시험, 그리고 신속한 보고 및 임상의와의 의사 소통이다. 무산소성 세균의 분류학적 변화는 진단적으로 적절한 보고 항균제의 선택과 항균제 감수성 해석 기준의 적용에 잠정적으로 영향을 미칠 수 있다. 이는 신흥 병원성 무산소성 세균의 항균제 내성 및 잘못된 동정은 환자 치료에 있어서 부적절한 경험적 치료를 유발할 수 있기 때문이다. 따라서, 임상미생물검사실은 주기적으로 무산소성 세균의 분류학적 변경 사항을 업데이트하고, 임상의에게 이러한 변경 사항을 적절하게 알려야 한다. 이 논문에서는 임상적으로 중요한 무산소성 세균의 분류에 관한 업데이트을 제시하였고, 이전의 균명 또는 동의어을 함께 기술하였다. 무산소성 세균의 분류 업데이트는 무산소성 세균 감염에 대한 항균제 요법을 안내하고, 치료 실패를 예방하는데 임상미생물검사실과 임상의 모두에게 도움이 될 수 있다.