DOI QR코드

DOI QR Code

Theoretical Investigation for the Structures and Binding Energies of H2O3 and Water (H2O) Clusters

H2O3과 물(H2O) 클러스터들의 분자구조와 열역학적 안정성에 대한 이론적 연구

  • 서현일 (한남대학교 생명나노과학대학 화학과) ;
  • 김종민 (한남대학교 생명나노과학대학 화학과) ;
  • 송희성 (한남대학교 생명나노과학대학 화학과) ;
  • 김승준 (한남대학교 생명나노과학대학 화학과)
  • Received : 2017.08.18
  • Accepted : 2017.09.22
  • Published : 2017.12.20

Abstract

The density functional theory(DFT) and ab initio calculations have been applied to investigate hydrogen interaction of $H_2O_3(H_2O)_n$ clusters(n=1-5). The structures, IR spectra, and H-bonding energies are calculated at various levels of theory. The $trans-H_2O_3$ monomer is predicted to be thermodynamically more stable than cis form at the CCSD(T)/cc-pVTZ level of theory. For clusters, the geometries are optimized at the MP2/cc-pVTZ level of theory. The binding energy of $H_2O_3-H_2O$ cluster is predicted to be -6.39 kcal/mol at the CCSD(T)//MP2/cc-pVTZ level of theory after zero-point vibrational energy (ZPVE) and basis set superposition error (BSSE) correction. This result implies that $H_2O_3$ is a stronger proton donor(acid) than either $H_2O$ or $H_2O_2$. The average binding energies per $H_2O$ are predicted to be 8.25 kcal/mol for n=2, 7.22 kcal/mol for n=3, 8.50 kcal/mol for n=4, and 8.16 kcal/mol for n=5.

$H_2O_3(H_2O)_n$ (n=1-5) 클러스터들에 대해서 밀도 범함수 이론(DFT)과 순 이론(ab initio) 방법을 cc-pVD(T)Z 바탕집합(basis set)과 함께 사용하여 가능한 여러 구조를 최적화하고 결합에너지와 조화진동수를 계산하였다. $H_2O_3$ 단량체의 경우 CCSD(T)/ccp-VTZ 이론 수준에서 트랜스(trans) 구조가 시스(cis) 구조보다 더 안정한 것으로 계산되었다. 클러스터에 대해서는 MP2/cc-pVTZ 수준까지 분자 구조를 최적화하고 열역학적으로 가장 안정한 분자구조를 예측하였다. 클러스터의 결합에너지는 CCSD(T)//MP2 수준에서 영점 진동에너지(ZPVE)와 바탕집합 중첩에러(BSSE)를 모두 보정한 후 n=1일 때 -6.39 kcal/mol 계산 되었으며 이 같은 결과는 $H_2O$$H_2O_2$의 물 클러스터 보다 더 좋은 수소 주게 즉 산(acid)으로서 작용할 것으로 기대된다. 물 분자 1개 당 평균 결합에너지는 n=2의 경우 8.25 kcal/mol, n=3일 때 7.22 kcal/mol, n=4의 경우 8.50 kcal/mol 그리고 n=5의 경우 8.16 kcal/mol로 계산되었다.

Keywords

References

  1. Levanov, A. V.; Sakharov, D. V.; Dashkova, A. V.; Antipenko, E. E.; Lunin, V. V. Eur. J. Inorg. Chem. 2011, 33, 5144.
  2. Wallington, T. J.; Dagaut, P.; Kurylo, M. J. Chem. Rev. 1992, 92, 667. https://doi.org/10.1021/cr00012a008
  3. Lightfoot, P. D.; Cox, R. A.; Crowley, J. N.; Destriau, M.; Hayman, G. D.; Jenkin, M. E.; Moortgat, G. K.; Zabel, F. Atmos. Environ. A-gen. 1992, 26, 1805 https://doi.org/10.1016/0960-1686(92)90423-I
  4. Wentworth, Jr. P.; Wentworth, A. D.; Zhu, X.; Wilson, I. A.; Janda, K. D.; Eschenmoser, A.; Lerner, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. 2003, 100, 1490. https://doi.org/10.1073/pnas.0437831100
  5. Shukla, P. K.; Mishra, P. C. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 4603. https://doi.org/10.1021/jp070399e
  6. Berthelot, M. Compt. Rend. 1880, 90, 656.
  7. Bielski, B. H. J.; Schwarz, H. A. J. Phys. Chem. 1968, 72, 3836. https://doi.org/10.1021/j100857a024
  8. Plesnicar, B. Acta Chim. Slov. 2005, 52, 1.
  9. Engdahl, A.; Nelander, B. Science 2002, 295, 482. https://doi.org/10.1126/science.1067235
  10. Xu, X.; Goddard, W. A., III. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 15308. https://doi.org/10.1073/pnas.202596799
  11. Wu, A.; Cremer, D.; Gauss, J. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 8737. https://doi.org/10.1021/jp030697l
  12. Plesnicar, B.; Tuttle, T.; Cerkovnik, J.; Cremer, D. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11553. https://doi.org/10.1021/ja036801u
  13. Lesko, T. M.; Colussi, A. J.; Hoffmann, M. R. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4432. https://doi.org/10.1021/ja038907v
  14. Tuttle, T.; Cerkovnik, J.; Plesnicar, B.; Cremer, D. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16093. https://doi.org/10.1021/ja0450511
  15. Suma, K.; Sumiyoshi, Y.; Endo, Y. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14998. https://doi.org/10.1021/ja0556530
  16. Maetzke, A.; Jensen, S. J. K. Chem. Phys. Lett. 2006, 425, 40. https://doi.org/10.1016/j.cplett.2006.04.097
  17. Cerkovnik, J.; Tuttle, T.; Kraka, E.; Lendero, N.; Plesnicar, B.; Cremer, D. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4090. https://doi.org/10.1021/ja058065v
  18. Denis, P. A.; Ornella, F. R. J. Phys. Chem. A 2009, 113, 499. https://doi.org/10.1021/jp808795e
  19. Hollman, D. S.; Schaefer III, H. F. J. Chem. Phys. 2012, 136, 084302. https://doi.org/10.1063/1.3684231
  20. Levanov, A. V.; Oksana, Y. I.; Ewald, E. A.; Valerii, V. L. Chem. Phys. 2015. 447, 10. https://doi.org/10.1016/j.chemphys.2014.11.020
  21. Kovacic, S.; Koller, J.; Janez Cerkovnik, J.; Tell Tuttle, T.; Plesnicar, B. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 8129.
  22. Solís-Calero, C.; Ortega-Castro, J.; Munoz.; F. J. Phys. Chem. C 2011, 115, 22945. https://doi.org/10.1021/jp2064134
  23. Aloisio, S.; Francisco, J. S. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8592. https://doi.org/10.1021/ja991001y
  24. Chalmet, S.; Ruiz-Lopez, M. F. ChemPhysChem. 2006, 7, 463. https://doi.org/10.1002/cphc.200500326
  25. Cannon, D.; Tuttle, T.; Koller, J.; Plesnicar, B. Comp. Theor. Chem. 2013, 1010, 19. https://doi.org/10.1016/j.comptc.2013.01.009
  26. Liang, T.; Raston, P. L.; Douberly, G. E. ChemPhysChem. 2013, 14, 764. https://doi.org/10.1002/cphc.201200712
  27. Anglada, J. M.; Hoffman, G. J.; Slipchenko, L. Y.; Costta, M. M.; Ruiz-Lopez, M. F.; Francisco, J. S. J. Phys. Chem. A 2013, 117, 10381. https://doi.org/10.1021/jp407282c
  28. Kulkarni, S. A.; Bartolotti, L. J.; Pathak, R. K. Chem. Phys. Lett. 2003, 372, 620. https://doi.org/10.1016/S0009-2614(03)00468-8
  29. Becke, A. D. J. Chem. Phys., 1993, 98, 5648. https://doi.org/10.1063/1.464913
  30. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. 1988, B37, 785.
  31. Yanai, T.; Tew, D. P.; Handy, N. C. Chem. Phys. Lett. 2004, 393, 51. https://doi.org/10.1016/j.cplett.2004.06.011
  32. Dunning, T. H. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007. https://doi.org/10.1063/1.456153
  33. Kendall, R. A.; Dunning, T. H.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796. https://doi.org/10.1063/1.462569
  34. Boys, S. F.; Bernardi, F.; Mol. Phys. 1970, 19, 553. https://doi.org/10.1080/00268977000101561
  35. Tarakeshwar, P.; Choi, H. S.; Lee, S. J.; Lee, J.Y.; Kim, K. S.; Ha, T.; Jang, J. H.; Lee, J. G.; Lee, H. J. Chem. Phys. 1999, 111, 5838. https://doi.org/10.1063/1.479879
  36. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, O. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, and D. J. Fox, Gaussian 09, Revision A; Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
  37. Hincapie, G.; Acelas, N.; Castano, M.; David, J.; Restrepo, A. J. Phys. Chem. A. 2010, 114, 7809. https://doi.org/10.1021/jp103683m
  38. Song, H. S.; Seo, H. I.; Shin, C. H.; Kim, S. J. J. Kor. Chem. Soc. 2015, 59, 117. https://doi.org/10.5012/jkcs.2015.59.2.117
  39. Kulkarni, A. D.; Pathak, R. K.; Bartolotti, L. J. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 4583. https://doi.org/10.1021/jp044545h
  40. Martins-Costa, M.; Anglada, J. M.; Ruiz-Lopez, M. F. Int. J. Quantum. Chem. 2011, 111, 1543. https://doi.org/10.1002/qua.22695

Cited by

  1. 수소 결합한 물 분자에서 OH 신축 진동의 국소모드와 정규모드 vol.64, pp.6, 2017, https://doi.org/10.5012/jkcs.2020.64.6.350