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Genetic Diversity of Pleurotus eringii Strains in Korea Based on Morphological Characteristics and PCR Polymorphism

형태적 특성과 PCR다형성 분석에 의한 국내 큰느타리버섯 계통의 유전적 다양성 분석

  • Jeon, Sun-Jeong (Graduate School of Biotechnology and Information Technology, Hankyong National University) ;
  • Kim, Jong-Kun (Graduate School of Biotechnology and Information Technology, Hankyong National University) ;
  • Kim, Gum-Hee (Mushheart Corp) ;
  • Chi, Jeong-Hyun (Gyonggi Province ARES) ;
  • Seo, Geon-Sik (Korea National Agricultural College) ;
  • Kang, Hee-Wan (Graduate School of Biotechnology and Information Technology, Hankyong National University)
  • 전선정 (한경대학교 생물환경정보통신전문대학원) ;
  • 김종군 (한경대학교 생물환경정보통신전문대학원) ;
  • 김금희 (머쉬하트 영농조합) ;
  • 지정현 (경기도 농업기술원) ;
  • 서건식 (한국농업대학) ;
  • 강희완 (한경대학교 생물환경정보통신전문대학원)
  • Published : 2009.06.30

Abstract

This study was conducted to investigate genetic characteristics of 25 Pleurotus eringii strains that have been released in Korea based on cultural, morphological features and PCR fingerprints. Strains PER-007 and PER-012 showed distinct cultural characteristics in growth rate, morphological characteristics of mycelial colony and fruiting bodies when compared to those of other strains. Strain PER-007 did not form primordium initiation in sawdust medium and PER-012 also showed different phenotypes on fruiting bodies. Eleven URP primers were used to detect PCR polymophic bands in P. eringii strains. Primers URP1F, URP2R, URP2F, URP4R, URP6R, URP9F and URP17R were selected as useful primers for amplifying PCR polymorphic bands in P. eringii strains. The genetic similarity index was calculated by using PCR polymorphic bands amplified by eight URP primers among the 25 strains. The P. eringii strains were grouped by four distinct clusters on the UPGMA analysis. The genetic similarity values ranged from 100% to 76% were observed in three major groups, suggesting close genetic relatedness of them. Exceptionally, PER-007 and PER-017 were involved in outgroup.

25개의 큰느타리버섯 균주를 국내외의 다양한 지역에서 수집하여 본 실험에 사용하였다. PER-007과 PER-012균주는 다른 균주와 비교하여 볼 때 PDA 배지상에서 특징적인 균총 형태를 보였으나 대부분 균주간 유사한 균사생장률을 보였다. 자실체 유도 및 생육 실험에서 PER-007균주는 자실체가 형성 되지 않았고 PER-012균주의 발이가 되었으나 이후 성숙 자실체로 성장하지 않았으며 그 외의 공시한 균주의 자실체 대부분의 갓모양은 볼록반구형, 평판구형 등 다양하게 나타났다. URP primer의 PCR 반응 조건은 $48^{\circ}C$에서 $52^{\circ}C$의 annealing 온도에서 높은 다형성 밴드를 관찰할 수 있었으며 25개의 P. eringii strains의 다형성은 11개의 URP primer 중 URP1F, URP2R, URP2F, URP4R, URP6R, URP9F, URP17R primer에서 계통간 PCR 다형성 밴드를 형성하였다. URP-PCR다형성밴드를 기초로 하여 유전적 유연관계를 분석한 결과 P. eringii strain들은 $76%{\sim}100%$정도의 유전적 유사도를 가지는 3개의 주요 group으로 나눌 수 있었으며 PER-007과 PER-017균주는 outgroup으로 원연관계를 형성하였다.

Keywords

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