DNMT3b Promoter Polymorphism and Risk of Gastric Cancer in the Korean Population

한국인에서 DNMT3b 유전자 다형성과 위암의 감수성

  • Kim, Sung Geun (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Jung, Hun (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Kim, Sin Sun (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Jeon, Kyung Hwa (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Song, Kyo Young (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Kim, Jin Jo (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Jin, Hyung Min (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Kim, Wook (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Park, Cho Hyun (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Park, Seung Man (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Lim, Keun Woo (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Kim, Seung Nam (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea) ;
  • Jeon, Hae Myung (Department of Surgery, College of Medicine, The Catholic University of Korea)
  • 김성근 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 정헌 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 김신선 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 전경화 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 송교영 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 김진조 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 진형민 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 김욱 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 박조현 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 박승만 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 임근우 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 김승남 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실) ;
  • 전해명 (가톨릭대학교 의과대학 외과학교실)
  • Received : 2006.10.30
  • Accepted : 2007.03.12
  • Published : 2007.03.31

Abstract

Purpose: DNA methylation is an important epigenetic factor in tumorigenesis. We hypothesized that polymorphism of the promoter of the DNA methyltransferase 3b (DNMT3b) genes, which are responsible for regulating the methylation status of tumor suppressor genes, are associated with increased risk of gastric cancer. Materials and Methods: In this hospital-based case-control study, to determine the role of this polymorphism of the promoter of DNA methyltransferase 3b (DNMT3b) genes in gastric cancer, we genotyped 176 cases and 70 control subjects. To determine the genotype, we used a polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism assay. We compared alleles and genotypes between the two groups and revealed an association of DNMT3b promoter polymorphism with increased risk of gastric cancer in the Korean population. Results: Genotype frequencies were 14.8% (Cytosine-Cytosine), 71.6% (Cytosine-Thymine), and 13.6% (Thymine- Thymine) in the case patients and 40.0% (Cytosine-Cytosine), 42.9% (Cytosine-Thymine), and 17.1% (Thymine-Thymine) in the control subjects, respectively. Compared with CC homozygotes, CT heterozygotes had a 4.523-fold increased risk (OR, 2.13; 95% CI, 2.324~8.803), and the TT homozygotes had a 2.154-fold elevated risk (OR, 1.42; 95% CI, 0.899~85.165). For the T variant genotype (CT+TT), there was a 3.846-fold increased risk (OR, 1.88; 95% CI, 2.040~7.251). However, no significance was observed in the genotype distributions of both polymorphisms according to histopathology, stage of stomach cancer. The Ssame results were observed with Helicobacter infection. Conclusion: DNMT3b promoter polymorphism, especially the T variant genotype, is associated significantly with thean increased risk of gastric cancer.

목적: DNA 메틸화는 암 발생과정에 있어 중요한 기전 중 하나이다. DNA 메틸화는 DNMT (DNA methyltransferase)에 의해 매개되는데 이중 DNMT3b가 암세포에서 주로 암억제 유전자의 메틸화 정도롤 조절하는 것으로 알려져 있다. 저자들은 DNMT3b 유전자의 촉진자의 다형성과 한국인에서 위암발생의 연관성을 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 2001년 12월에서 2002년 12월까지 가톨릭대학교 성모병원에서 위암으로 진단받고 위 절제술을 받은 사람 중에서 176명과 같은 기간동안 내시경 검사를 시행했던 사람들 중 위암과 관련이 없는 경우 70명을 대상으로 하였다. DNMT3b 촉진자 다형성은 연쇄효소중합반응과 제한분절 길이 다형성 분석으로 유전형을 관찰하였다. 위암 환자에서 대립유전자 및 유전자형을 대조군과 비교하여 이런 다형성이 한국인에서 위암의 감수성을 증가시키는가에 대하여 연구하였다. 결과: DNMT3b 촉진자의 유전형은 환자군에서 14.8% (CC), 71.6% (CT), 13.6% (TT)를 보였고, 대조군에서 40% (CC), 42.9% (CT), 17.1% (TT)를 보였다. CT 이종접합체군에서 약 4.5배(OR 2.13; 95% CI, 2.324~8.803), TT 동종접합체군에서는 약 2.2배(교차비 1.42; 95% 신뢰구간, 0.899~5.165)의 위암발생률의 증가를 보였다. T 변이체 전체로는 약 3.8배의 위험률 증가를 보였다(교차비 1.88; 95%신뢰구간 2.040~7.251). 위암의 병기나 조직학적 소견, Helicobacter pylori 감염과는 유의한 관계를 보이지 않았다. 결론: DNMT3b 촉진자의 다형성은 T 변이체에서 한국인에서 위암 발생 위험도를 증가시킨다. 이러한 다형성과 위암의 병기, 조직학적 유형, Helicobacter pylori 감염과는 관련이 없었다.

Keywords