Journal of Animal Science and Technology

Korean Society of Animal Sciences and Technology (한국축산학회)
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Estimation of Genetic Parameter for Carcass Traits According to MTDFREML and Gibbs Sampling in Hanwoo(Korean Cattle)

MTDFREML 방법과 Gibbs Sampling 방법에 의한 한우의 육질형질 유전모수 추정

  • 김내수 (충북대학교 농업생명환경대학 축산학과) ;
  • 이중재 (충북대학교 농업생명환경대학 축산학과) ;
  • 주종철 (천안연암대학)
  • Published : 2006.06.30
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Abstract

The objective of this study was to compare of genetic parameter estimates on carcass traits of Hanwoo(Korean Cattle) according to modeling with Gibbs sampler and MTDFREML. The data set consisted of 1,941 cattle records with 23,058 animals in pedigree files at Hanwoo Improvement Center. The variance and covariance among carcass traits were estimated via Gibbs sampler and MTDFREML algorithms. The carcass traits considered in this study were longissimus dorsi area, backfat thickness, and marbling score. Genetic parameter estimates using Gibbs sampler and MTDFREML from single-trait analysis were similar with those from multiple-trait analysis. The estimated heritabilities using Gibbs sampler were .52～.54, .54 ～.59, and .42～.44 for carcass traits. The estimated heritabilities using MTDFREML were .41, .52～.53, and .31～.32 for carcass traits. The estimated genetic correlation using Gibbs sampler and MTDFREML of LDA between BF and MS were negatively correlated as .34～.36, .23～.37. Otherwise, genetic correlation between BF and MS was positive genetic correlation as .36～.44. The correlations of breeding value for marbling score between via MTDFREML and via Gibbs sampler were 0.989, 0.996 and 0.985 for LDA, BF and MS respectively.

본 연구는 Gibbs sampler와 MTDFREML 방법에 의해서 한우 도체형질의 유전력 및 유전(공)분산을 단형질 및 다형질 개체모형을 가지고 추정하고 비교 하였다. 배장근단면적(longissimus dorsi area), 등지방 두께(backfat thickness), 상강도(marbling score)의 유전 모수를 추정하였으며, 분석에 이용된 자료는 총 1,941두 이고, 혈연계수를 구하기 위한 혈통 자료는 23,058두를 이용하였다. 도체형질에 대한 유전력 추정 시 단형질과 다형질 개체모형에 의한 편차는 크게 나타나지 않았다. 단형질 개체모형에서 Gibbs sampler 방법을 이용한 추정에서는 LDA, BF 및 MS에서 각각 0.52, 0.59 및 0.42로서 고도의 유전력을 보였다. MTDFREML 방법을 통한 추정 시에는 LDA 0.41, BF 0.52로서 고도의 유전력을 보였으며, MS는 0.32로서 중도의 유전력을 보였다. 분석 방법에 의한 유전력 추정은 Gibbs sampler에 의한 방법이 MTDFREML에 의한 방법에 비해서 0.1정도 높게 추정되었다. MTDFREML 방법과 Gibbs Sampler 방법에 의한 도체 형질간의 유전상관은 LDA와 BF, MS 간에는 모두 부의 상관을 보였고, BF과 MS에서는 정의 상관을 보였다. MTDFREML과 Gibbs Sampler에서 이들의 분석 방법 간에 육종가 추정치에 대한 상관계수는 LDA와 BF에서는 0.989 이상의 높은 추정치를 보였으나, MS에 대해서는 이보다 다소 낮은 0.985를 나타내었다. 그리하여, 상강도(marbling score)와 같은 범주형 자료에 대한 유전분석은 기존의 선형의 정규분포를 가정한 REML방법에 의한 것 보다 범주형 모형을 설정하여 Gibbs sampling algorithm을 응용한 분석방법이 더 적합할 것으로 사료된다.

Keywords

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