Genetic characterization of Phellinus baumii PMO-P4 by analyzing restriction fragment length polymorphisms of nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacers (ITS)

Ribosomal DNA의 ITS부위에 대한 RFLP 분석에 의한 Phellinus baumii PMO-P4의 유전학적 특성

  • Chang, Yun-Hee (Institute of Food and Culture, Pulmuone Co. Ltd.) ;
  • Kim, Tae-Rack (Institute of Food and Culture, Pulmuone Co. Ltd.) ;
  • Kim, Hyun-Su (Konkuk University, Microbial Engineering) ;
  • Yeo, Ik-Hyun (Institute of Food and Culture, Pulmuone Co. Ltd.) ;
  • Lee, Sang-Youn (Institute of Food and Culture, Pulmuone Co. Ltd.) ;
  • Ha, Hyo-Cheol (Institute of Food and Culture, Pulmuone Co. Ltd.)
  • 장윤희 (풀무원 식문화 연구원) ;
  • 김태락 (풀무원 식문화 연구원) ;
  • 김현수 (건국대학교 미생물공학 전공) ;
  • 여익현 (풀무원 식문화 연구원) ;
  • 이상윤 (풀무원 식문화 연구원) ;
  • 하효철 (풀무원 식문화 연구원)
  • Published : 2006.06.30

Abstract

PMO-P4, being cultivated as "Sanghwang" in Korea, was proved to be P. baumii based on ITS (internal transcribed spacer) sequencing and RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) patterns along with some Phellinus species including P. linteus. The similaraty of ITS sequencing between PMO-P4 and other Phellinus species was given the range of 48.6%~72.2%, showing the highest homology from P. linteus and the lowest from P. gilvus.

국내에서 재배하여 생산되고 있는 상황버섯의 일종인 PMO-P4균주에 대한 ITS 영역의 염기서열 분석을 실시하였으며 목질 진흙버섯으로 잘 알려져 있는 P. linteus와 함께 RFLP분석을 통하여 상호 비교한 결과 PMO-P4균주는 P. baumii로 판명되었다. 이 결과를 토대로 이미 보고되어 있는 Phellinus속 균주들과의 종간 ITS 영역의 상동성을 비교한 결과 48.6%-72.2%였으며 본 연구에서 비교한 종들 가운데서는 P. linteus와 상동성이 가장 높았으며 P. gilvus와 상동성이 가장 낮았다.

Keywords