Korean Journal of Poultry Science (한국가금학회지)

The Korean Society of Poultry Science (한국가금학회)
권호 표지

DNA Sequence and Characteristics of Muscle Development cDNA Clone Derived from Korean Native Chicken

재래닭의 근육 성장과 관련되는 cDNA Clone의 염기서열 및 특성

  • Sun, S.S. (Department of Department of Animal Science, Chonnam National University) ;
  • Myung, K.H. (Department of Department of Animal Science, Chonnam National University) ;
  • Kuk, K. (Department of Department of Animal Science, Chonnam National University) ;
  • Kim, N.O. (Department of Department of Animal Science, Chonnam National University)
  • 선상수 (전남대학교 동물자원학부) ;
  • 명규호 (전남대학교 동물자원학부) ;
  • 국길 (전남대학교 동물자원학부) ;
  • 김남오 (전남대학교 동물자원학부)
  • Published : 2006.12.30
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Abstract

This experiment was conducted to examine the effective DNA related with muscle growth of Korean native chicken. cDNA library was constructed with mRNA subtraction from Korean native chicken to Cornish. Total mRNA was purified from pectoralis muscle of adult chicken. Five clones were compared their DNA sequence and characteristics based on GenBank. Clone NDS-1 (618nt) was low homology (10%) with other species, but it is closely related with triosephosphate isomerase which is play an important role in glycolysis. Clone NDS-6 (651nt) is corresponding to glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. These two clones are encoding to enzymes in key role in glycolysis. However, other three clones (NDS-2, NDS-10, NDS-12) have low homology with other species about 5.0%. These clones were not similar with any other eukaryotics. Therefore, three clones (NDS-2, NDS-10, NDS-12) are high possibility of specific DNA for muscle growth in Korean native chicken.

본 연구는 재래닭의 성장 관련 유용 유전자를 검색하기 위하여, 재래닭에서 발현되는 유전자와 코니쉬에서 발현되는 유전자를 subtraction하여 cDNA library를 구축하고, 염기서열을 밝혀서 재래닭 특이 유용 유전자를 검증하고자 하였다. cDNA library에서 얻은 clone들의 염기서열을 분석하여 나타난 결과를 5개의 clone을 비교 분석하였다. Clone NDS-1(618nt)은 비록 타 종과의 상동성은 낮으나(10%) 해당 과정에서 중요한 역할을 담당하는 triosephosphate isomerase이며, Clone NDS-6(651nt)는 자에서 해당 과정에 관여하는 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase로 여겨진다. 그러나 3가지 유전자(clone NDS-2, NDS-10, NDS-12)는 다른 유전자들과 비교하여 5.0%내외의 낮은 상동성을 보이고 고등 동물과 거의 유사성이 없으므로 재래닭 특이 성장 관련 유용 유전자일 가능성이 있다.

Keywords

References

  1. Sang BD, Kong HS, Kim HK, Choi CH, Kim SD, Cho YM, Sang BC, Lee JH, Jeon GJ, Lee HK 2006 Estimation of genetic parameters for economic traits in Korean native chickens. Asian-Aust J Anim Sci 19(3):319 https://doi.org/10.5713/ajas.2006.319
  2. Choi CH, Cho BW, Jeon GJ, Lee HK 2006 Identification of novel SNPs with effect on economic traits in uncoupling protein gene of Korean native chicken. Asian-Aust J Anim Sci 19(8):1065 https://doi.org/10.5713/ajas.2006.1065
  3. Devaraj H, Natarajan A 2006. Molecular mechanisms regulating molting in a crustacean. FEBS Journal 273(4):839-846 https://doi.org/10.1111/j.1742-4658.2006.05117.x
  4. Pei Y, Hausmann S, Ho CK, Schwer B, Shuman S 2001 The length and phosphorylation state, and primary structure of the RNA polymerase-II carboxy-terminal domain dictate interactions with mRNA capping enzymes. J BIol Chem 276(30):28075-28082 https://doi.org/10.1074/jbc.M102170200
  5. Piehler AP, Wenzel JJ, Olstad OK, Haug KBF, Kierulf P, Kaminski WE 2006 The human ortholog of the rodent testis-specific ABC transporter Abca17 is a ubiquitously expressed pseudogene (ABCA17P) and shares a common 5' end with ABCA3. BMC Mol Biol 2006; 7:28
  6. Shin, JH, Kim H, Song KD, Han BK, Park TS, Kim DK, Han JY 2005 A set of testis-specific novel genes collected from a collection of Korean native chicken ESTs. Animal Genetics 36(4):346-348 https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2005.01268.x
  7. Yun JS, Seo DS, Kim WK, Ko Y 2005 Expression and relationship of the insulin-like growth factor system with posthatch growth in the Korean native Ogol chicken. Poultry Sci 84(1):83-90 https://doi.org/10.1093/ps/84.1.83
  8. 상병돈 최철환 김학규 김시동 장병귀 나재천 유동조 이상진 상병찬 이준헌 2003 한국재래닭의 경제 형질에 미치는 계통 및 환경의 효과. 한국가금학회지 29(5): 235-244
  9. 이학교 공홍식 이승수 정호영 조창연 상병돈 최철환 김학규 2003 한국 재래닭 경제형질 관련 QTL 탐색 및 표지유전 자 개발. 한국가금학회 제20차 정기총회 및 학술발표회 pp.135-137
  10. 최철환 상병돈 김학규 조규호 정일정 상병찬 박창식 한성욱 2002 산란형질에 대한 한국 재래닭 계통간 교배종의 잡종강세 및 결합능력 추정. 한국가금학회 02 가을 학술발표논문집 pp.140-142
  11. 한성욱 1998 재래닭 생산물의 소비형태에 관한 조사연구. 한국재래닭 및 백색산란계 산업의 육성방안 pp.51-86