Journal of Animal Science and Technology

Korean Society of Animal Sciences and Technology (한국축산학회)
권호 표지
DOI QR코드

DOI QR Code

Genetic Features of Cheju Horses based on Transferrin Gene Frequency

Transferrin 유전자빈도에 의한 제주마의 유전적 특성

  • Yang, Y.H. (Research Institute for Subtropical Agriculture and Biotechnology, Cheju National University) ;
  • Kim, N.Y. (Jeju Institute)
  • 양영훈 (제주대학교 아열대농업생명과학연구소) ;
  • 김남영 (제주도축산진흥원)
  • Published : 2004.02.29
Download PDF
⟨ Previous Next ⟩

Abstract

To investigate genetic features and the allele distribution of transferrin gene in three Cheju horse groups (group I, 137 horses of Jeju institute; group II, 107 horses of farms; group III, 89 racing horses) and three foreign breeds(l03 Thoroughbred, 10 Mongolian and 5 American Quarter horses), transferrin gene exons 13, 15, and 16 were analyzed by SSCP. The allele frequencies of transferrin gene of these groups and breeds were used to calculate genetic distances and to test population differentiations. The Fst values were 0.067 between Cheju horse groups I and II, 0.070 between Cheju horse groups I and group III, 0.091 between Cheju horse group I and Mongolian breed, and 0.189 between Cheju horse group I and Thoroughbred breed. Cheju horse group I showed significant population differentiation from other two Cheju horse groups and three foreign breeds while Cheju horse group III showed significant population differentiation only from Cheju horse group I and Thoroughbred breed(p <0.05). Results indicate that three Cheju horse groups showed population differentiation between each other, suggesting genetic heterogeneity of Cheju horses.

제주마의 세 구룹의 집단(group I , 제주도축산진홍원 관리마; group Il , 농가사육마; group III, 제주경마장의 경주마)과 외래품종인 Thoroughbred, Mongolian horse 및 Quarter horse에 있어서 transfemin 유전자 분포를 비교하기 위하여 Transferrin 유전자 exon 13, 15 및 16에 대하여 SSCP 분석을 수행하였다. 조사된 유전자의 빈도는 집단간의 유전적 분화거리를 측정하는데 이용되었고 집단분화의 유의성을 검정하였다. 집단분화를 나타내는 Fst 값에 의하면 제주마 group I 은 group Il (0.067) 및 group III(0.070)와는 가깝게 위치하고 있었으나 Mongol 집단과는 0.091 로， Thoroughbred 집단과는 0.189의 유전적으로 거리가 다소 먼 분화된 집단관계를 보여주고 있었다. 또한 제주마 group I 은 외래품종인 Thoroughbred, Mongolian horse, American Quarter 집단뿐만 아니라 제주마 group Il 및 m와도 차별화 되는 집단으로 유지되고 있음을 보여주고 있었다'(p <0.05). 제주 경마장에 경주마로 이용되고 있는 제주마 group ill는 제주마 group I 및 Thoroughbred 품종집단에 대해서 칩단분화에 유의성이 안정 ( p < 0.01)되 었고 나머지 다른 집단과는 집단분화의 유의성이 없었다(p > 0.05). 제주마 group Il, group Ill 및 몽고마 사이에는 분화 확률의 유의성이 없어서 이들 집단간에는 유전자 빈도가 매우 유사한 것으로 생각되었다. 이로서 비교적 짧은 기간에 번식환경의 격려 또는 외래품종의 유전자 유업에 의하여 제주마의 transferrin 유전자 빈도는 제주마 집단간에 이질화를 초래하고 있으며， 집단의 분화가 유전자의 유엽이 원인이라면 혈통보존되는 축산 진홍원의 관리집단 이외의 제주마 집단은 외래 품종의 유전자 유업으로 제주마의 고유한 유전적 특성이 빠른 속도로 희석될 것으로 생각된다.

Keywords

References

  1. Brandon, R. B., Giffard, J. M. and Bell, K. 1999. Single nucleotide polymorphism in the equine transferrin gene. Animal Genetics 30:439-443
  2. Carpenter, M. A. and Broad, T. E. 1993. The cDNA sequence of horse transferrin. Biochemica et Biophysica Acta. 1173:230-232. https://doi.org/10.1016/0167-4781(93)90186-H
  3. Excoffier, L. and Slatkin, M. 1995. Maximumlikelihood estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population. Mol. BioI. Evol. 12:921-927.
  4. Felsenstein, J. 1989. PHYLlP.Phylogeny Inference Package(V.3.2). Cladistics 5:164-166.
  5. Guo, S. and Thompson, E. 1992. Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportion for multiple alleles. Biometrics 48:361-372
  6. Nei, M. 1972. Genetic distance between populations. Am. Nat. 106:283-292.
  7. Nei, M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. Columbia University Press, New York, NY, USA.
  8. Nei, M. and Kumar, S. 2000. Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford Univerity Press.
  9. Shin, J. A., Yang, Y. H., Kim, H. S., Yun, Y. M. and Lee, K. K. 2002. Genetic polymorphism of the serum proteins of horses in Jeju. Journal of Veterinary Science 3:255-263.
  10. Stefan, S., David R. and Laurent, E. 2000. ArIequin ver. 2.000. A software for population genetics data analysis. University of Geneva. Switzerland.
  11. Kim, K. I.. Yang, Y. H., Lee, S. S., Park, C. Ma. R., Bouzat, J. L. and Lewin, H. A. 1999. Phylogenetic relationships of Cheju horses to other horse breeds as determined by mtDNA D-loop sequence polymorphism. Animal Genetics 30:102-108. https://doi.org/10.1046/j.1365-2052.1999.00419.x
  12. Miller, S. A.. Dykes. D. D. and Polesky, H. F. 1988. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research 16:1215.
  13. Stefan. S.. David R. and Laurent. E. 2000. Arlequin ver 2.000, A software for population genetics data analysis. Genetics and Biometry Laboratory, University of Geneva, Switzerland.
  14. Yang, Y. H., Kim, K. I.. Cothran, E. G. and Flanery, A. R. 2002. Genetic diversity of Cheju horses(Equus cabal/us) determined by using mitochondrial DNA D-loop polymorphism. Biochemical Genetics 40: 175-186. https://doi.org/10.1023/A:1015884125507
  15. 김남영, 이성수, 양영훈. 2002. 제주마 Transferin gene exon 13, 15 및 16의 다형현상. 한국동물자원과학회지 44(4):391-398
  16. 양영훈. 1997. 제주마 체형 측정치에 의한 혈통 등급 판정에 관한 연구. 제주대학교 동물과학논총 12:89-98
  17. 양영훈, 정창조, 이현종, 강태숙. 1991. 제주재래마 혈통정립 및 혈통등록을 위한 조사연구 II. 제주재래마의 체위측정치에 대한 혈통등급의 고정 효과. 한국축산학회지 33(6):438-443.
  18. 오유성, 오문유, 김세재, 김기옥, 고미희, Kayano Hiroshi, 양영훈. 1995. 제주 재래마와 쓰시마 재래마의 혈액내 단백질의 다형. Korean J. Zool. 38:324-329
  19. 정창조, 이현종, 강태숙, 김중계, 김규일, 강민수, 양영훈, 오문유, 장덕지. 1990. 제주재래마 혈통정립 및 혈통등록을 위한 조사연구 I. 제주마의 지역별, 성별, 연령별 체형측정치. 한국축산학회지 33(6):418-422.
  20. 정창조, 양영훈, 김중계, 강민수. 1991. 제주재래마 혈통정립 및 혈통등록을 위한 조사연구 I. 제주마의 지역별, 성별, 연령별 체형측정치. 한국축산학회지 33(6):418-422.