Abstract
Fluorescent in situ hybridization (FISH) with rRNA-targeted oligonucleotide probes was used to compare the community structures of free-living and aggregated bacteria at thawing period in Lake Baikal. Targeted groups were Eubacteria, $\alpha$-, $\beta$-, $\gamma$- proteobacteria groups, Cytophaga-Flavobacterium group and Planctomycetales. Total bacterial numbers of free-living bacteria were ranged from $0.2{\times}10^6\cells{\cdot}ml^-1$ to $3.2{\times}10^6\cells{\cdot}ml^-1$, which were decreasing with depth, while the aggregated bacterial numbers were dramatically increasing from $0.4{\times}10^4 to 3.3{\times}10^4 \cells{\cdot}ml^-1$ with depth. The ratios of EUB probe binding cells to DAPI counts were ranged from 52.3 to 74.1% in free-living bacteria, and from 39.6 to 66.7% in the aggregated bacteria, respectively. Community structures of the aggregated bacteria were very different from each free-living bacteria at every depth. At 25 m depth, where the chlorophyll a concentration was highest, both structures were quite different from those of surface layers, rendering the fact that the community structures might be affected by phytoplankton. The vertical profile of community structure of aggregated bacteria is particular. The proportion of $\beta$-proteobacteria group was increasing with depth and it was 51.8% at 100 m, but the dominant group was $\gamma$-pro-teobacteria group at 250 m. Taken together, the biodiversity and succession of aggregated bacteria are quite different from free-living bacteria.
러시아 바이칼호에서 해빙기에 부유세균과 aggregates에 부착한 세균의 군집구조를 FISH (fluorescent in situ hybridization)방법으로 0 m부터 250 m수심에서 비교 분석하였다. 조사대상은 Eubacteria에 속하는 세균과 class Proteobacteria에 속하는 세균 중 $\alpha$-, $\beta$-, $\gamma$ -group과 Cytophaga-Flavobacterium group,그리고 Planctomycetales였다. 부유세균의 수는 $0.2{\times}10^6\cells{\cdot}ml^-1 to 3.2{\times}10^6 \cells{\cdot}ml^-1$범위였으며, 수심이 깊어질수록 감소하였다. Aggregate에 부착한 세균은 부유세균과 반대로 수심이 깊어질수록 증가하였고, 개체수의 범위는 0.4~$3.3{\times}10^4$ $cells{\cdot}ml^-1$ 이였다. 총세균수에 대한 Eubacteria 수의 비율은 부유세균의 경우 52.3~74.1%, aggregates에 부착한 세균은 39.6~66.7%로 부유세균보다 부착세균에서 그 비율이 낮았으며, 세균의 군집구조 분석 결과에서도 부유세균과 aggregates애 부착한 세균의 군집구조가 다른 양상으로 나타났다. 특히 두 세균의 군집구조는 식물플랑크톤이 밀집해 있는 25 m 수심에서 급격히 변화하여 식물플랑크톤이 부유세균과 부착세균의 군집의 변화에 밀접한 관련이 있는 것으로 확인되었다, Aggregates에 부착한 세균 군집은 수심에 따라 매우 특이한 변화 양상을 나타내었다. $\beta$-proteobacteria group은 수심이 깊어지면서 그 비율이 높아져, 100m에서는 $\beta$-group이 총세균수는 51.8%를 차지하였으나, 250m에서는 $\gamma$-group이 43.8%를 차지하여, 급격하게 우점 group이 변화하였다. 그러나, 부유세균에서는 전혀 다른 군집 구조를 이루고 있었다. 이러한 결과에서 aggregates에 부착한 세균은 부유세균과는 다른 다양성을 이루고, 다른 천이과정을 거치는 것으로 확인되었다.
