The Korean Journal of Mycology (한국균학회지)

The Korean Society of Mycology (한국균학회)
권호 표지

A Study on the Genetic Variations of Tricholoma matsutake Collected from Eleven Sites of Korea Using I-SSR PCR

I-SSR PCR을 이용한 한국의 11개 주요 산지에서 채집한 송이의 유전변이에 관한 연구

  • Cho, Duck-Hyun (Department of Forest Resources, College of Agriculture & Life Science, Seoul National University) ;
  • Lee, Kyung-Joon (Department of Forest Resources, College of Agriculture & Life Science, Seoul National University) ;
  • Han, Sim-Hee (Department of Forest Resources, College of Agriculture & Life Science, Seoul National University)
  • 조덕현 (서울대학교 농업생명과학대학 산림자원학과) ;
  • 이경준 (서울대학교 농업생명과학대학 산림자원학과) ;
  • 한심희 (서울대학교 농업생명과학대학 산림자원학과)
  • Published : 2000.04.30
Download PDF
⟨ Previous Next ⟩

Abstract

The objectives of this study was to identify genetic variations of Tricholoma matsutake (S. Ito et Imai) Sing. growing in different geographic ranges in South Korea. Mushrooms were collected during fruiting seasons from 1994 to 1997 from 11 major sites which included four sites (Bonghwa, UIjin, Goryoung, and Chungdo) in Kyongbuk Province, three sites (Changnyung, Hadong, and Hamyang) in Kyongnam Province, two sites (Yangyang and Inje) in Kangwon Province, one site (Goisan) in Choongbuk Province, and one site (Namwon) in Chonbuk Province. Two mushrooms each from three to eight shiros in each sites were collected. Genetic characteristics were analyzed by Inter-Simple Sequence Repeat Polymerase Chain Reaction (I-SSR PCR) method using six primers. With a total of 131 DNA bands identified, Nei's genetic distance and UPGMA tree were constructed. It was estimated that genetic variations between sites amounted to 12.9%, while 87.1% of total variation was explained by variations among individuals within sites. The cluster analysis indicated that the eleven major sites were clustered into four groups, group I (Yangyang, Hamyang, Inje, Hadong and UIjin), group II (Changnyung, Namwon and Chungdo), group III (Goryoung), and group IV (Bonghwa and Goisan). It is concluded that matsutake mushrooms in South Korea have a considerable degree of genetic variations between major sites.

본 연구는 국내 주요 송이 산지에서 생산되는 송이{Tricholoma matsutake(S. Ito et Imai) Sing}의 개체간, 그리고 지역간 유전적 다양성을 구명하기 위하여 실시하였다. 경상북도의 봉화, 울진, 고령, 청도의 4개 지역, 경상남도의 창녕, 하동, 함양의 3개 지역, 강원도의 양양, 인제의 2개 지역, 충청북도의 괴산, 전라북도의 남원을 포함하여 총 11개의 송이 산지를 대상으로 1994년부터 1997년까지 산지별로 $3{\sim}8$개의 균환에서, 그리고 각 균환마다 2개의 자실체를 채집하여 6개의 primer를 이용하여 Inter Simple Sequence Repeat Polymerase Chain Reaction(I-SSR PCR)법을 이용하여 자실체의 유전적 특성을 조사하였다. 그 결과 총 131개의 DNA band가 재현성 있게 나타났다. 또한 산지간의 유연관계를 살펴보기 위하여 Nei의 genetic distance를 이용하여 UPGMA tree를 작성하였다. I-SSR PCR법을 이용하여 DNA를 분석한 결과, 산지간의 유전적 변이는 12.9%에 불과한 반면 산지 내 개체간 변이가 87.1%로 나타났다. 유집 분석 결과는 11개 송이 산지를 제 I 그룹(양양, 함양, 인제, 하동, 울진), 제 II 그룹(남원, 창녕, 청도), 제 III 그룹(고령), 제 IV 그룹(봉화, 괴산)의 4개 그룹으로 분류하였다. 송이의 유전적 다양성, 집단간의 유전적 차이를 나타내는 수치인 Fst 값이 0.13이므로 집단간의 유전적 변이를 어느 정도 나타낸다고 결론짓는다.

Keywords

References

  1. 송이 인공재배에 관한 연구;농촌진흥청 시험연구보고 강안석;김양섭;차동렬
  2. RAPD 분석에 의한 소나무 10개 천연집단의 유전변이 연구 김용률
  3. 한국육종학회지 v.24 no.1 강원, 경북지역 소나무 천연집단의 유전적 구조 김진수;이석우
  4. 한국임학회지 v.82 금강소나무-유전적으로 별개의 품종으로 인정될 수 있는가?-동위효소 분석결과에 의한 관찰 김진수;이석우;황재우;권기원
  5. 동국대학교 논문집 v.16 송이의 인공재배에 있어서 발생조건에 관한 연구 김창호;정윤수
  6. 한국임학회지 v.78 경북지방 소나무 및 곰솔집단의 동위효소에 의한 유전변이 손두식;홍성천;여진기
  7. 한국균학회지 v.19 no.3 경상도지역의 소나무 군락에서 발견된 송이의 생물학 이상선
  8. 한국임학회지 v.84 29개 지역의 10년간 송이 발생림의 기상인자와 송이발생량과의 상관관계 조덕현;이경준
  9. Genetic Variation in Ribosomal RNA Gene Cluster in Tricholoma matsutake 허은지
  10. The RAPDistance Package (ver. 1.04). Distributed by the author Armstrong, J.A.;Gibbs, A.;Peakall, R.;Weiller, G.
  11. Genetics v.112 Temporal and microgeographic variation in allozyme frequencies in a natural population of Drosophila buzzatii Baker, J.;East, P.;Weir, B.
  12. Genetics v.74 Analysis of gene frequencies Cockerham, C.
  13. Nucleic Acid Research v.19 A simple and rapid method for preparation of plant genomic DNA for PCR analysis Edwards, A.;Johnston, C.;Thompson, C.
  14. Genetics v.131 Analysis of molecular variance interred from metric distance among DNA haplotypes: application to human mitochondrial DNA restriction data Excoffier, L.;Smouse, P.;Quattro, J.
  15. PHYLIP (Phylogeny Inference Package) version 3.5c. Distributed by the author Felsenstein, J.
  16. Theoretical Applied Genetics v.86 Goodwin;Lee
  17. Theoretical Applied Genetics v.86 RAPD variation within and among natural populations of outcrossing buffalograss (Buchloe dactyloides (Nutt.) Engelm) Huff, D.;Peakall, R.;Smouse, P.
  18. Can. J. Bot. v.73 no.10 Mating system and distribution of enzyme genetic variation in bracken (Pteridium aquilinum) Korpelainen, H.
  19. Genetics v.89 Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals Nei, M.
  20. Bull. Gov. For. Exp. Sta. v.278 Microbial ecology of mycorrhizal fungus, T. matsutake (Ito et Imai) Sing. in pine forest. II. Mycorrhiza formed by T. matsutake Ogawa, M.
  21. Trans. Mycol. Soc. Japan v.17 Microbial ecology of 'Shiro' in Tricholoma matsutake (Ito et Imai) Sing. and its allied species. III. Tricholoma matsutake in Picea glehnii and Picea glehnii-Abies sachalinensis forests Ogawa, M.
  22. Bull. Gov. For. Exp. Sta. v.293 Microbial ecology of mycorrhizal fungus Tricholoma matsutake (Ito et Imai) Sing. in pine forest III. Fungal florae in Shiro soil and on the mycorrhiza Ogawa, M.
  23. Biology of Matustake Mushroom Ogawa, M.
  24. Analysis of isozymes of Tricholoma matsutake by polyacrylamide gel electrophoresis;日本菌學會 第 35回 記念大會 講演要旨集 Shinya, E.;Tsutomu, M.
  25. General Genetics Snyder, L.A.;Freifelder, D.;Hartl, D.L.
  26. Theor. Appl. Genet. v.92 Diversity and inheritance of inter-simple sequence repeat polymorphisms in Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii) and sugi (Cryptomeria japonica) Tsumura, Y.;Ohba, K.;Strauss, S.H.
  27. Meth. Enzy. v.162 Genetic analysis using RAPD markers Willams, J.;Hanafey, M.;Rafalski, J.;Tingey, S.