Variation of Mitochondrial DNA Restriction Fragments of Common Rats, Rattus norvegicus caraco Pallas (Mammalia , Redentia) , from Cheongju , Korea

청주에 서식하는집쥐[Rattus norvegicus caraco Pallas(설치목, 포유강)]의 미토콘드리아 DNA 절단단편의 변이

  • Hung Sun Koh (Department of Biology, Chungbuk National University) ;
  • Yong Seok Roh (Department of Biology, Chungbuk National University) ;
  • Sang Bok Kim (Department of Biology, Chungbuk National University) ;
  • Byung Sun Yoo (Environment Safety Division Korea Atomic Energy Reseach Institute)
  • Published : 1995.12.01

Abstract

Forty samples of common rats (Rattus norvegicus caraco) from Cheongu, Korea, were used for the analyses of mitochondrial DNA (mtDNA) fragment patterns resulted from the digestion with eight restriction enzymes. A total of 36 fragments were recognized and six mtDNA clones were revealed . The nucleotide-sequence divergences (p) among six mtDNA clones ranged from 0.35% to 2.73%. moreover, the six clones were grouped into three major subgroups ; the first, second , and third subgroup were composed of 29 samples of three clones, ten samples of two clones, and one sample of one clone, respectively. The second and third subgroups were different in their mtDNa genotype of Pvu II from the first subgroup, and the third subgroup differed in the genotype of Dra I from other two subgroups. Futhermore, the maximum divergence among common rats from Korea in this study is greater than that among common rats from the United States and Japan by Brown and Simpson (1981). Further analyses with additional sample from other localities in Korea appeared to be necessary in order to clarify the taxnomic status of the distinct mtDNA subgroups.

한국의 청주에서 채집한 집쥐(Rattus norvegicus caraco) 40마리를 사용하여, 8개 제한효소로 절단한 미토콘드리아 DNA(mtDNA)의 단편들을 분석하였다 총 36개의 절단단편들이 나타났고, 6개 mtDNA의 clone이 밝혀졌다. 여섯 mtDNA clone간의 nucleotide-sequence divergence(p)는 0.35-2.73%였으며 , 이들 6개 clone은 3개 소군으로 나뒤어졌다. 한 소군은 3개 clone의 29마리였고, 다른 한 소 군은 2개 clone의 열마리였으며, 나머지 소군은 한 clone의 한마리였다. 둘째와 셋 째 소군은 첫째 소군과 Pvu II의 genotype이 달랐으며, 셋째 소군은 나머지 두 소 군과 Dra I에 있어서 뚜렸한 차이를 보였다. 뿐만아니라, 한국산 집쥐를 사용한 본 연구의 결과로 밝혀진 최대 divergence는 Brown과 Simpson(1981)의 미국과 일 본의 집쥐를 사용해서 연구한 최대값보다 컸다 이들 뚜렷한 mtDNA 소군의 분류 학적 위치를 규명하기 위하여 한국내 다른 지역의 더 많은 표본들을 사용한 계속적 인 연구가 필요하게 되었다.

Keywords