DNA-DNA Hybridization에 의한 Bacillus coagulans의 분류학적 연구

Taxonomic Study of Bacillus coagulans by Deoxyribonucleic Acid-Deoxyribonucleic Acid Hybridization Technique

서로 다른 11주의 Bacillus coagulans와 13종의 Bacillus 속 14주를 deoxyribonucleic acid(DNA)-DNA hybridization method에 의해서 분류학적인 연구를 하였다. 사용한 B. coagulans 11주중 6주는 흙에서(일본 오사까교외) 분리했고, 나머지 5주는 ATCC, IFO에서 authentic strains을 얻어서 사용했다. 사용된 B. coagulans는 Bergey's Manual(8th ed)에 의거 Gordon씨들의 방법으로 동정한 결과 B. coagulans로서 확인되었다. 이렇게 동정된 B. coagulans을 분자 생물학적 차원에서 지금까지의 Conventional taxonomic study와의 관계를 연구하기 위해서 사용한 11주의 B. coagulans중 ATCC 7070을 $^3$H labeled input 즉 standard로 해서 사용했을 때 B. coagulans 내의 intraspecific DNA homology indexes는 76% 이상으로 나타났다. 이와같은 발견은 Bergey's Manual에 의거한 conventional taxonomic study의 결과와 잘 일치하고 있었음으로 새로 분리한 6주와 authentic sources로부터 받은 5주는 같은 group의 B. coagulans라는 사실을 입증해 주었다. 그리고 B. coagulans와 다른 species의 Bacillus 속 즉 B. pumilus(168), B. licheniformis (IFO 12107), B. pumilus(IFO12110), B. firmus(ATCC 14575), B. lentus(ATCC 10840), B. circulans(ATCC 4513), B.macelans(ATCC 8244), B.polymyxa, (ATCC 842), B.sphaericus(ATCC 14577), B.brevis(ATCC 8246, IFO 12334), B.laterosporus(ATCC 64), B. pantothenticus(ATCC 14576) interspecific DNA homology indexes가 각각 2～4%을 보임으로써 B. coagulans는 molecular level면에서 이들 Bacillus 속과는 상동성 관계가 적음을 나타내었다. 반면에 B. coagulans(ATCC 7050)와 E. coli(F-12)와의 상동성은 1%이하였다.

Taxonomic study of 11 strains of Bacillus coagulans and 14 strains of 13 spccies of Bacillus by deoxyribonucleic acid (DNA)-DNA hybridization were conducted. Among the 11 strains of B. coagulans, 6 were isolated from soil and the rest were the authentic strains obtained from American Type culture collection (ATCC) or the Institute for Fermentation, Osaka (IFO). All strains were examined to confirm as they are expected species of B. coagulans by the methods of Cordon et al. according to Bergey's Manual (8th ed.). The intraspecific DNA homology indexes among the 11 strains of B. coagulans using strain ATCC 7050 as the standard ($^3$H labeled input DNA) showed 76％ or, more, respectively. These findings accorded well with the results of the conventional taxonomic study according to the Bergey's Manual. The interspecific DNA homology indexes between B. coagulant strain ATCC 7050 and the type cultures of B. subtilis (168), B. licheniformis (IFO 12107), B. pumilus (IFO 12110), B. firmus (ATCC 14575), B. lentus (ATCC 10840), B. circulans (ATCC 4513), B. macelans (ATCC 8244), B. polymyxa (ATCC 842), B. sphaericus (ATCC 14577), B. brevis (ATCC 8246, IFO 12334), B. laterosporus (ATCC 64), and B. pantothenticus (ATCC 14576) respectively, showed 2 to 4％, while that of between B. coagulans ATCC 7050 and Escherichia coli K-12 was less than 1 ％.