EDISON SW 활용 경진대회 논문집 (Proceeding of EDISON Challenge)
- 제2회(2013년)
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- Pages.89-100
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- 2013
양자역학으로 π-π interaction 에너지 계산을 통한 ligand binding energy 분석
- Lee, Seung-Jin ;
- Yun, Ji-Hui ;
- Jang, Seong-Min ;
- Cho, Art E.
- 발행 : 2013.04.17
초록
생물정보학의 다양한 이론적 내용과 계산적 방법들이 갈수록 전문화 되어짐에 따라 신약 개발, 신 물질 합성, 단백질의 구조 예측 등 다양한 분야에서 필요성이 커져가고 있다. 이 중 molecular docking 기술은 단백질과 특정 분자간의 결합 형태를 분자 모델링 기법을 통해 알아내는 방법이며 신약개발 연구에 큰 영향을 미치고 있다. Molecular docking을 통하여 분자간의 결합 형태를 예측하는 과정에서 Protein-ligand complex의 정확한 에너지 측정을 가능하게 하는 scoring function이 필요하다. 그런데 본 연구에서 사용한 B-Raf kinase protein 은 active site 부분에서 ligand와 receptor 간에 aromatic ring로 인한