Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference (한국정보처리학회:학술대회논문집)
- 2012.11a
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- Pages.115-117
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- 2012
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- 2005-0011(pISSN)
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- 2671-7298(eISSN)
DOI QR Code
Parallel Processing of BLAST Using Hadoop and Its Performance Evaluation
하둡을 이용한 BLAST의 병렬 처리 및 성능 분석
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Choi, Hoon
(Dept. of Software Research, KISTI)
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- Um, Jungho (Dept. of Software Research, KISTI) ;
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Yoon, Hwa-mook
(Dept. of Software Research, KISTI)
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Choi, Yun-Soo
(Dept. of Software Research, KISTI)
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Lee, Minho
(Dept. of Software Research, KISTI)
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- Lee, Won-Goo (Dept. of Software Research, KISTI) ;
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Song, Sa-Kwang
(Dept. of Software Research, KISTI)
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Jung, Hanmin
(Dept. of Software Research, KISTI)
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최동훈
(한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실)
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- 엄정호 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
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윤화묵
(한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실)
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최윤수
(한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실)
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이민호
(한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실)
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- 이원구 (한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실) ;
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송사광
(한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실)
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정한민
(한국과학기술정보연구원 소프트웨어연구실)
- Published : 2012.11.22
Abstract
차세대 시퀀싱 장비는 기존의 컴퓨팅 방법으로 처리할 수 없을 만큼 많은 양의 시퀀스 데이터를 생성하고 있다. 본 논문에서는 차세대 시퀀스 데이터의 정렬을 위해 널리 사용되고 있는 BLAST의 병렬 처리 방법을 하둡을 사용하여 제시하며, 이의 성능 개선 효과를 분석한다.
Keywords