Accessing and Retrieving Bioinformatics Data From Biomart on a Mobile Device

모바일 환경에서 BioMart 데이터베이스에 대한 생물정보데이터의 접근 및 검색

  • 유석종 (한국과학기술정보연구원 슈퍼컴퓨팅본부) ;
  • 박준호 (충북대학교 정보통신공학과) ;
  • 임종태 (충북대학교 정보통신공학과) ;
  • 이지희 (충북대학교 정보통신공학과) ;
  • 포미미 (충북대학교 정보통신공학과) ;
  • 김미경 (충북대학교 정보통신공학과) ;
  • 김현주 (충북대학교 정보통신공학과) ;
  • 조미림 (충북대학교 정보통신공학과) ;
  • 류제운 (충북대학교 생화학과) ;
  • 김학용 (충북대학교 생화학과) ;
  • 유재수 (충북대학교 정보통신공학과)
  • Published : 2011.05.20

Abstract

최근 유전자 염기서열분석방법이 새롭게 등장하면서 대량의 생물정보의 데이터가 축적되고 있다. 다양한 생물종의 유전체 정보에 대하여 관련 연구자들에게 유용한 정보를 제공하기 위해서는 분석된 유전체 정보를 빠르게 전달할 필요가 증가하고 있다. 본 연구에서는 분석된 유전체 정보에 대한 데이터베이스를 구축하고 이를 모바일 환경에서 손쉽게 탐색할 수 있는 클라이언트 앱을 개발하였다. 유전체 정보에 대한 데이터베이스는 BioMart를 사용하였다. BioMart의 데이터베이스 스키마를 기반으로 웹서비시스 방법을 통하여 모바일 환경의 기기와 연동할 수 있도록 하였다. 개발된 시스템의 검증을 위해서 BioMart의 유전자내용을 검색 할 수 있는 질의를 통하여 모바일기기에서 인간의 유전체 정보를 네비게이션 할 수 있도록 하였다.

Keywords