Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2010.06c
  • /
  • Pages.235-239
  • /
  • 2010
  • /
  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Prediction of MicroRNA Strand Selection using Hypernetwork Model

하이퍼망 모델을 이용한 MircoRNA Strand 선택 예측

  • Lee, Ji-Hoon (Graduate Program in Bioinformatics, Seoul National University) ;
  • Ha, Jung-Woo (Department of Computer Science & Engineering, Seoul National University) ;
  • Rhee, Je-Keun (Graduate Program in Bioinformatics, Seoul National University) ;
  • Zhang, Byoung-Tak (Graduate Program in Bioinformatics, Seoul National University)
  • 이지훈 (서울대학교 생물정보학 협동과정) ;
  • 하정우 (서울대학교 컴퓨터공학부) ;
  • 이제근 (서울대학교 생물정보학 협동과정) ;
  • 장병탁 (서울대학교 생물정보학 협동과정)
  • Published : 2010.06.30
Download PDF
⟨ Previous Next ⟩

Abstract

MicroRNA는 RNA로 전사된 유전자와의 상보결합을 통해 유전자 발현을 억제하는 조절인자이다. MicroRNA 생성과정에서 pre-microRNA의 3' 또는 5' 부근의 strand가 선택되어 mature 시퀀스가 되고 유전자 조절에 직접 작용하게 된다. 하지만 어떤 특징을 가진 strand가 선택 되는지에 대한 정확한 메커니즘은 아직 연구되어 있지 않다. 본 논문에서는 microRNA 시퀀스 정보를 바탕으로 하이퍼망을 구성하여 strand 선택 예측 모델을 구축하였다. 실험 결과 하이퍼망 학습을 통해 microRNA strand 선택에 중요한 영향을 미치는 시퀀스 특징을 찾을 수 있었고, strand 선택을 높은 정확도로 예측할 수 있음을 확인하였다.

Keywords