Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)
- 2007.06b
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- Pages.36-40
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- 2007
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- 1598-5164(pISSN)
Prediction of microRNA Targets and Discrimination of microRNA Regulatory Mechanisms using Multilayer Perceptron Neural Network
다층 퍼셉트론 신경망을 이용한 microRNA의 목표 유전자 예측 및 조절 메커니즘 분별
- Lee, Min-Su (Biointelligence Laboratory, School of Computer Science and Engineering Seoul National University) ;
- Nam, Jin-Wu (Center for Bioinformatics Technology (CBIT) Seoul National University) ;
- Zhang, Byoung-Tak (Graduate Program in Bioinformatics Seoul National University)
- Published : 2007.06.25
Abstract
miRNA 유전체학의 중요한 이슈로 miRNA가 조절하는 목표 유전자를 예측하는 작업과 miRNA가 목표 유전자를 조절하는 메커니즘이 무엇인지 규명하는 것을 들 수 있다. 본 논문에서는 생물학적 특징들과 다층 퍼셉트론 신경망을 이용하여 miRNA의 목표 유전자를 예측하고 해당 miRNA 조절 메커니즘 타입을 분별해주는 시스템을 제안하고 실제 데이터를 사용하여 그 성능을 평가한다. 실험적으로 검증된 데이터를 사용하여 제안 시스템을 평가해본 결과, 다층 퍼셉트론 신경망을 사용할 경우 84.63%의 정확도로 miRNA의 목표 유전자를 예측할 수 있었고, 87.90%의 정확도로 miRNA가 목표 유전자를 조절하는 메커니즘을 분별할 수 있었다. 학습 데이터가 충분히 많아진다면 제안 시스템의 예측 성능은 더욱 높아질 것으로 예상된다.
Keywords