한국정보처리학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference)

한국정보처리학회 (Korea Information Processing Society)
권호 표지

모티프 서열에서의 특징추출 및 빈발패턴 분석

Feature selection and frequent pattern analysis in protein motif sequence

  • 김대성 (충북대학교 전자계산학과) ;
  • 이범주 (충북대학교 전자계산학과) ;
  • 류근호 (충북대학교 전자계산학과)
  • Kim, Dae-Sung (Database and Bioinformatics Laboratory, Chungbuk National University) ;
  • Lee, Bum-Ju (Database and Bioinformatics Laboratory, Chungbuk National University) ;
  • Ryu, Keun-Ho (Database and Bioinformatics Laboratory, Chungbuk National University)
  • 발행 : 2007.05.11
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초록

모티프는 진화과정을 거치면서 단백질 서열상에서 부분적으로 높게 보존된 지역을 의미한다. 이러한 모티프는 단백질의 기능과 구조를 예측하거나 생물학적으로 관련성이 있는 단백질의 공통적인 특성을 기술하는데 사용된다. 또한, 모티프와 단백질 서열의 상관관계는 생물학적 기능 예측에 필수적이며, 이러한 예측 문제는 모티프 검색을 통해 서열에 존재하는 빈발한 서열패턴과 구조패턴을 통해 단백질 서열에 대한 분석이 가능하다. 이 논문에서는 단백질 서열에 존재하는 2차 구조 특성과 빈발패턴을 검색하고 추출된 정보를 이용하여 단백질 기능 분류에 활용하고자 한다.

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