Incremental Gene Selection-based Cancer Classification Using Microarray Data

마이크로어레이 데이터를 이용한 점증적 유전자 선택기반 암 분류

  • Kown, Hyung-Tae (Dept. of Computer Science, Yonsei University Biometrics Engineering Research Center) ;
  • Hong, Jin-Hyuk (Dept. of Computer Science, Yonsei University Biometrics Engineering Research Center) ;
  • Cho, Sung-Bae (Dept. of Computer Science, Yonsei University Biometrics Engineering Research Center)
  • 권형태 (연세대학교 컴퓨터 과학과 생체인식연구센터) ;
  • 홍진혁 (연세대학교 컴퓨터 과학과 생체인식연구센터) ;
  • 조성배 (연세대학교 컴퓨터 과학과 생체인식연구센터)
  • Published : 2007.10.26

Abstract

마이크로어레이 데이터는 매우 많은 수의 유전자로 구성되며, 암 분류 성능을 높이기 위해서는 대상 암과 관련된 유용한 유전자를 선택해야 한다. 기존 필터 기반 유전자 선택 기법은 유전자를 개별적으로 평가하여 암 분류에 사용하기 때문에, 유전자 사이의 관계나 분류기와의 상관성을 고려하지 않으며, 비슷한 특성의 유전자를 중복해서 선택하는 경향이 있다. 본 논문에서는 필터와 래퍼 방식을 결합하여 분류결과를 반복적으로 반영하며 유전자를 선택하는 기법을 제안한다. 필터 기법으로 유전자의 순위를 계산할 때 이전 분류에서 틀린 샘플의 가중치가 높도록 설계하고, 분류를 반복하면서 각 단계에서 유용한 유전자를 추가로 선택한다. 제안하는 방법을 대표적 암 분류 데이터인 림포마 암과 대장암 데이터에 적용하여 유용성을 검증하였다.

Keywords