Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference (한국정보처리학회:학술대회논문집)

  • 2006.11a
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  • Pages.673-676
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  • 2006
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  • 2005-0011(pISSN)
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  • 2671-7298(eISSN)
Korea Information Processing Society (한국정보처리학회)
권호 표지

An Extraction Technique of Protein Geometric Features for Predicition of Residue Location

잔기 위치 예측을 위한 단백질 기하학적 특징 추출 기법

  • Yu, Ki-Jin (Database/Bioinformatics Laboratory Chungbuk National University) ;
  • Jung, Kwang-Su (Database/Bioinformatics Laboratory Chungbuk National University) ;
  • Ryu, Keun-Ho (Database/Bioinformatics Laboratory Chungbuk National University)
  • 유기진 (충북대학교 데이터베이스/바이오인포메틱스 연구실) ;
  • 정광수 (충북대학교 데이터베이스/바이오인포메틱스 연구실) ;
  • 류근호 (충북대학교 데이터베이스/바이오인포메틱스 연구실)
  • Published : 2006.11.10
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Abstract

생명현상을 이해하기 위해서는 단백질의 기능 규명이 이루어져야한다. 단백질 기능 규명을 위한 서열분석 방법은 서열 상동성이 현저히 낮은 경우 단백질 기능 예측이 불가능하고, 과거의 전체적인 단백질 구조 분석을 통한 기능 예측의 문제점이 보고되고 있다. 이 논문에서는 기능상 중요한 의미를 가지고 있는 단백질의 특정하위구조의 기하학적 특징을 추출하여 이 특징과 잔기의 위치와의 관계를 규명하였다. 또한 NaiveBayes, SVM, C4.5의 분류알고리즘을 이용하여 각 알고리즘별 분류성능을 평가하였다. 기능상 중요한 의미를 가지고 있는 특정하위구조를 비교함으로써 모르는 단백질의 기능을 예측할 수 있다.

Keywords