지능적 다중염기서열 변환 도구의 설계 및 구현

Design and Implementation of an Intelligent Multiple DNA Sequence Translation Tool

  • 이혜리 (충북대학교 전기전자컴퓨터 공학부) ;
  • 이건명 (충북대학교 전기전자컴퓨터 공학부) ;
  • 이찬희 (충북대학교 생물학과) ;
  • 이성덕 (충북대학교 통계학과) ;
  • 김성수 (충북대학교 전기전자컴퓨터 공학부)
  • 발행 : 2006.05.01

초록

계통분석을 하는 생물학자들은 관련된 분석대상에 대한 정보를 확보하여 비교분석하기 위해 NCBI 등으로부터 염기서열을 확보하여 아미노산 서열로 변환하는 작업을 수행하게 된다. 많은 서열 데이터에 대해서 데이터베이스로부터 데이터를 검색하고 이를 변환하는 작업을 순차적으로 분석자가 관여하여 작업하는 것이 현재 분석환경이다. 따라서 본 논문에서는 분석의 효율성을 향상시키기 위해, 관심서열의 등록번호(Accession Number) 리스트를 입력하면 해당 서열에 대항 정보를 NCBI로부터 웹로봇을 통해 자동으로 확보한 다음, 확보된 염기서열 전체를 아미노산 서열로 자동 변환하여 가장 긴 ORF(Open Reading Frame)을 추천해주기 위해 설계된 지능형 다중 염기서열 변환 도구에 대해서 소개한다.

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