Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2006.06a
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  • Pages.88-90
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  • 2006
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Gene Ontology based SBML Document Management and Query processing system

GO 기반의 SBML 문서 관리 및 질의 처리기

  • Jung Seung-Hyun (Chungbuk National University Information Industry Engineering, MIS) ;
  • Jung Tae-Sung (Chungbuk National University Information Industry Engineering, MIS) ;
  • Kim Tae-Kyung (Chungbuk National University Information Industry Engineering, MIS) ;
  • Kim Kyoung-Ran (Chungbuk National University Information Industry Engineering, MIS) ;
  • Cho Wan-Sup (Chungbuk National University Information Industry Engineering, MIS)
  • 정승현 (충북대학교 정보산업공학과, 경영정보학과) ;
  • 정태성 (충북대학교 정보산업공학과, 경영정보학과) ;
  • 김태경 (충북대학교 정보산업공학과, 경영정보학과) ;
  • 김경란 (충북대학교 정보산업공학과, 경영정보학과) ;
  • 조완섭 (충북대학교 정보산업공학과, 경영정보학과)
  • Published : 2006.06.01
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Abstract

본 논문에서는 SBML문서를 효율적으로 저장관리 할 수 있는 Gene Ontology 기반의 SBML 문서관리 시스템을 제안한다. SBML은 시스템생물학에서 생화학적 네트워크 데이터의 교환 표준으로 연구 개발되었으며, 다수의 생화학적 네트워크 데이터베이스들이 SBML을 이용하여 데이터를 제공해주고 있다. 이러한 SBML 문서를 통해 서로 다른 데이터베이스 또는 응용 프로그램간 정보를 교환으로 사용되고 있으며, 그 양 또한 급속하게 증가하고 있다. 따라서 본 논문에서는 이러한 대량의 SBML 문서를 효율적으로 저장, 검색 할 수 있는 문서관리시스템을 제안한다. 제안된 시스템은 OODB를 사용하여 효율적으로 SBML 문서를 저장관리하며, Gene Ontology를 기반으로 생화학적 용어의 모호성을 해결하고, SBML문서간의 발생하는 데이터 중복을 제거하여 데이터의 품질을 제고하였다.

Keywords