한국정보과학회:학술대회논문집 (Proceedings of the Korean Information Science Society Conference)

한국정보과학회 (Korean Institute of Information Scientists and Engineers)
권호 표지

단백질 상호작용 네트워크예서 상동성 기반 바이오 콤플렉스 예측

A Homology-Based Prediction of Biological Complexes in a Protein-Protein Interaction Network

  • Choi Jae-Hun (Electronics and Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Park Jong-Min (Electronics and Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Park Soo-Jun (Electronics and Telecommunications Research Institute(ETRI))
  • 발행 : 2006.06.01
PDF 다운로드
⟨ 이전 논문 다음 논문 ⟩

초록

본 논문에서는 생물학적 실험에 의해 추출된 이종의 단백질 콤플렉스를 통해 대상 종의 콤플렉스를 단백질 상호적용 네트워크에서 예측할 수 있는 방법을 제안한다. 이 예측은 먼저 이종사이에 단백질의 비교를 통해 상동성을 색인한 다음, 이 상동성을 이용하여 이종의 콤플렉스를 대상 종으로 변형하고 그 형태를 단백질 상호작용 네트워크에서 탐색하는 과정으로 수행된다. Swiss-Prot 데이터 베이스의 단백질들을 대상으로 상동성 색인을 색인하였으며, 콤플렉스 형태를 분석하기 위해 DIP의 단백질 상호작용 네트워크를 이용하였다.

키워드