Conceptual Classification Layout of Protein-Protein Interaction Networks

단백질 상호작용 네트워크의 개념 분류 레이아웃

  • Bang Sun-Lee (Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Choi Jae-Hun (Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Park Jong-Min (Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Park Soo-Jun (Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI))
  • Published : 2006.06.01

Abstract

본 논문은 온톨로지를 이용하여 단백질 상호작용 네트워크를 개념적으로 분류하여 레이아웃하는 방법을 제안한다. 상호작용 네트워크를 이루는 단백질은 온톨로지의 표준 통제 용어에 대한 주석 정보를 가지고 있으므로 동일 분류에 해당하는 통제 용어를 가지고 있는 단백질들은 근접한 곳에 위치하도록 레이아웃한다. 이는 기존 물리적 레이아웃에 기능별 그룹화를 해줌으로써 복잡한 네트워크를 개념적으로 분석할 수 있도록 한다. 또한, 동일 분류에 속하는 단백질들을 한 노드로 대응하여 레이아웃 알고리즘을 수행함으로써 기존의 그래프표현 알고리즘 보다 빠르게 시각화할 수 있다.

Keywords