Selection of Discriminative Genes for Data Mining of Time-series Microarray Data

시계열 마이크로어레이 데이터 마이닝을 위한 분별력 있는 유전자 선정 방법

  • Lee Min-Su (Department of Computer Science and Engineering, Ewha Womans University) ;
  • Park Seung-Soo (Department of Computer Science and Engineering, Ewha Womans University) ;
  • Kang Sung-Hee (Bangmok College of Basic Studies, Myongji University) ;
  • Park Woong-Yang (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Seoul National University College of Medicines)
  • 이민수 (이화여자대학교 컴퓨터학과) ;
  • 박승수 (이화여자대학교 컴퓨터학과) ;
  • 강성희 (명지대학교 방목기초교육대학) ;
  • 박웅양 (서울대학교 의과대학)
  • Published : 2006.06.01

Abstract

본 논문에서는 시계열 마이크로어레이데이터 마이닝을 위한 전처리 작업으로 시계열 마이크로어레이 데이터에 특징 추출 방법 및 상관관계 분석을 이용하여 분화 과정에 대해 분별력 있는 유전자들을 선정하기 위한 방법을 제안하고, 줄기세포가 신경세포로 분화하는 과정에서 특이적으로 발현되는 유전자들을 찾기 위한 시계열 마이크로어레이 데이터 분석 과정을 하나의 예로 제시한다. 분석 결과, 제안한 방법이 분화 특이적으로 발현되는 분별력 있는 유전자들, 분화 과정에서 공통적으로 발현되는 유전자들, 그리고 경계선에 존재하는 유전자들을 통해서 줄기세포 신경분화의 특징들을 규명하는데 매우 유용함을 보였다.

Keywords