Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)
- 2006.06a
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- Pages.7-9
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- 2006
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- 1598-5164(pISSN)
Wrapper-based Approach for Protein Identification in PPI Network
PPI 네트워크에서의 래퍼 기반 단백질 식별
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Lee Yong-Ho
(Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI))
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Choi Jae-Hun
(Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI))
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Lim Myung-Eun
(Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI))
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Park Su-Jun
(Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI))
- Published : 2006.06.01
Abstract
단백질 상호작용 관계들은 고 성능 실험 기법을 이용한 생물학적 실험에 의해서 대규모로 추출되고, 동시에 이들을 구성하는 단백질 데이터 역시 공공 데이터베이스에 빈번하게 갱신되고 있다. 이 갱신으로 인하여 인터넷을 통해 공개되는 공공 데이터베이스와 PPI(Protein-Protein interaction) 네트워크에 포함된 단백질 데이터가 서로 일치하지 않게 된다. 본 논문에서는 PPI 네트워크에 존재하는 단백질을 래퍼(Wrapper)를 이용하여 빈번하게 갱신되는 공공 데이터베이스의 단백질로 식별하고, 이 식별을 통해 PPI 네트워크에 존재하는 데이터들을 항상 최신 데이터로 동기화함으로써 데이터의 실시간성을 제공하고 데이터에 대한 신뢰도를 보장할 수 있도록 하였다.
Keywords