Template-based Approach for Detecting Bio-Component in Protein Interaction Network

단백질 상호작용 네트워크에서의 템플릿 기반 바이오 컴포넌트 탐색

  • Park, Jong-Min (Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Choi, Jae-Hun (Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI)) ;
  • Park, Seon-Hee (Electronics & Telecommunications Research Institute(ETRI))
  • Published : 2005.11.01

Abstract

단백질 상호작용 네트워크에는 단백질들로 구성된 패스웨이와 콤플렉스 등과 같은 의미 있는 바이오 컴포넌트들이 존재한다. 하지만, 단백질 상호작용 네트워크는 방대한 단백질들과 상호작용 관계들로 구성되어 있고 많은 잘못된 정보들을 포함하고 있다. 따라서, 사용자가 정확한 단백질에 대한 식별자로 구성된 질의를 통해 원하는 바이오 컴포넌트를 탐색하는 것은 쉽지 않다. 본 논문에서는 사용자가 원하는 바이오 컴포넌트를 식별자뿐만 아니라 단백질 및 상호작용 관계의 다양한 특징들을 이용하여 탐색할 수 있는 방법을 제시한다. 또한 단백질 상호작용 네트워크에는 잘못된 정보들이 많이 포함하고 있으므로 주어진 질의와 근접하게 일치하는 결과들도 제시할 수 있는 질의 연산자들을 제공하여 보다 다양한 관점에서 검토할 수 있도록 하였다.

Keywords